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MethHC: a database of DNA methylation and gene expression in human cancer

机译：MethHC：人类癌症中DNA甲基化和基因表达的数据库

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We present MethHC (http://MethHC.mbc.nctu.edu.tw), a database comprising a systematic integration of a large collection of DNA methylation data and mRNA/microRNA expression profiles in human cancer. DNA methylation is an important epigenetic regulator of gene transcription, and genes with high levels of DNA methylation in their promoter regions are transcriptionally silent. Increasing numbers of DNA methylation and mRNA/microRNA expression profiles are being published in different public repositories. These data can help researchers to identify epigenetic patterns that are important for carcinogenesis. MethHC integrates data such as DNA methylation, mRNA expression, DNA methylation of microRNA gene and microRNA expression to identify correlations between DNA methylation and mRNA/microRNA expression from TCGA (The Cancer Genome Atlas), which includes 18 human cancers in more than 6000 samples, 6548 microarrays and 12 567 RNA sequencing data.
机译：我们提出了MethHC（http://MethHC.mbc.nctu.edu.tw），该数据库包括对人类癌症中DNA甲基化数据和mRNA / microRNA表达谱的大量收集的系统整合。 DNA甲基化是基因转录的重要表观遗传调控因子，在其启动子区域具有高水平DNA甲基化的基因在转录上是沉默的。越来越多的DNA甲基化和mRNA / microRNA表达谱在不同的公共资源库中发表。这些数据可以帮助研究人员确定对癌变至关重要的表观遗传模式。 MethHC整合了DNA甲基化，mRNA表达，microRNA基因和microRNA表达的DNA甲基化等数据，以识别TCGA（癌症基因组图谱）的DNA甲基化与mRNA / microRNA表达之间的相关性，该基因组包括6000多个样本中的18种人类癌症， 6548个微阵列和12567个RNA测序数据。

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