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首页> 外文期刊>Journal of Computer Chemistry, Japan -International Edition >Development of PolyParGenv2 Software for Determination of Molecular Dynamics Simulation Parameters for Molecules with Crosslinked or Condensed Ring Structures
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Development of PolyParGenv2 Software for Determination of Molecular Dynamics Simulation Parameters for Molecules with Crosslinked or Condensed Ring Structures

机译：具有交联或冷凝环结构的分子分子测定分子动力学模拟参数的多滤油试验

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We had previously developed o2p, a parameter conversion semi-automation program for polymers with repeating structures, and PolyParGen, a parameter acquisition program primarily meant for chainlike macromolecules. These programs use the parameters obtained via the automatic parameter generation tool. However, with these programs, it is difficult to acquire parameters of molecules with crosslinked structures or large condensed ring structures. To acquire these parameters, herein we improved the algorithm to develop PolyParGen v2. Further, this program adds Antechamber as the automatic parameter generation tool and can obtain the Amber force field parameter for polymers. This program was evaluated via simulations using graphene, carbon nanotubes, and fullerene. Our results agree with those of previous studies and verify the effectiveness of the proposed program.
机译：我们以前开发了O2P，一个参数转换半自动化程序，用于具有重复结构的聚合物和多面型，一个参数采集程序主要用于链条状大分子。 这些程序使用通过自动参数生成工具获得的参数。 然而，利用这些程序，难以使用交联结构或大浓缩环结构获取分子的参数。 为了获取这些参数，这里我们改进了开发Polypargen V2的算法。 此外，该程序将Antechamber添加为自动参数生成工具，可以获得聚合物的琥珀色字段参数。 使用石墨烯，碳纳米管和富勒烯的模拟评估该程序。 我们的结果与以往的研究中的结果同意并验证拟议计划的有效性。

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