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Resistance gene analogues are clustered on chromosome 3 of sugar beet and cosegregate with QTL for rhizomania resistance

机译:抗性基因类似物聚集在甜菜的第3号染色体上,并与QTL共同分离,以用于根瘤菌的抗性

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摘要

Worldwide, rhizomania is the most important disease of sugar beet. The only way to control this disease is to use resistant varieties. Four full-length resistance gene analogues (RGAs) from sugar beet (cZR-1, cZR-3, cZR-7, and cZR-9) were used in this study. Their predicted polypeptides carry typical nucleotide-binding sites (NBSs) and leucin-rich repeat (LRR) regions, and share high homology to various plant virus resistance genes. Their corresponding alleles were cloned and sequenced from a rhizomania resistant genotype. The 4 RGAs were mapped as molecular markers, using sequence-specific primers to determine their linkage to the rhizomania resistance locus Rz1 in a population segregating for rhizomania resistance. One cZR-3 allele, named Rz-C, together with 5 other molecular markers, mapped to the Rz1 locus on chromosome 3 and cosegregated with quantitative trait loci for rhizomania resistance. After screening a bacterial artificial chromosome (BAC) library, 25 cZR-3-positive BACs were identified. Of these, 15 mapped within an interval of approximately 14 cM on chromosome 3, in clusters close to the Rz1 locus. Rz-C differentiates between susceptible and resistant beet varieties, and its transcripts could be detected in all rhizomania resistant varieties investigated. The potential of this RGA marker for cloning of rhizomania resistance genes is discussed.La rhizomanie est la plus importante maladie de la betterave sucrière à l'échelle mondiale. Le seul moyen de contrer cette maladie est l'emploi de cultivars résistants. Quatre analogues de gènes de résistance (RGA) de la betterave sucrière (cZR-1, 3, 7 et 9) ont été employés dans ce travail. Les polypeptides prédits comportent des régions typiques de sites de liaison nucléotidique (NBS) et de répétitions riches en leucine (LRR) et ils affichent une grande homologie avec divers gènes de résistance aux virus chez les plantes. Les allèles correspondants ont été clonés et séquencés chez un génotype résistant à la rhizomanie. Les quatre RGA ont été cartographiés à l'aide d'amorces spécifiques afin de déterminer leur emplacement par rapport au locus Rz1 chez une population en ségrégation pour la résistance à la rhizomanie. Un allèle cZR-3 nommé Rz-C et cinq autres marqueurs moléculaires coïncidaient avec le locus Rz1 sur le chromosome 3 et montraient une co-ségrégation avec des QTL de résistance. En criblant une banque de clones BAC, 25 clones hybridant à cZR-3 ont été identifiés. De ceux-ci, 15 étaient situés à l'intérieur d'un intervalle d'environ 14 cM sur le chromosome 3, groupés à proximité du locus Rz1. Rz-C permet de distinguer entre cultivars résistants et sensibles et son transcrit était détectable chez tous les cultivars examinés résistants à la rhizomanie. Le potentiel de ce marqueur RGA en vue du clonage de gènes de résistance à la rhizomanie est discuté.
机译:在世界范围内,根瘤菌病是甜菜最重要的疾病。控制这种疾病的唯一方法是使用抗性品种。在这项研究中使用了四个甜菜的全长抗性基因类似物(RGA)(cZR-1,cZR-3,cZR-7和cZR-9)。他们预测的多肽带有典型的核苷酸结合位点(NBS)和富亮氨酸的重复序列(LRR)区,并且与各种植物病毒抗性基因具有高度同源性。从根瘤菌抗性基因型中克隆了它们的相应等位基因并进行了测序。使用序列特异性引物,将4个RGA定位为分子标记,以确定它们与针对根瘤菌抗性隔离的群体中的根瘤菌抗性基因座Rz1的联系。一个名为Rz-C的cZR-3等位基因与其他5个分子标记一起定位于3号染色体上的Rz1基因座,并与定量性状基因座共分离,以进行根瘤菌抵抗。筛选细菌人工染色体(BAC)文库后,鉴定出25个cZR-3阳性BAC。其中15个位于3号染色体上大约14 cM的间隔内,靠近Rz1基因座。 Rz-C区分易感和抗性甜菜品种,并且其转录本可在所有调查的根瘤菌抗性品种中检测到。讨论了该RGA标记在克隆根瘤菌抗性基因中的潜力。根瘤菌和重要病菌sucrièreàl'échellemondiale。栽培种的抗病能力最强。受雇于四面体的法国抵抗军(RGA)的类似物(cZR-1、3、7和9),以及受雇于丹尼斯·塞瓦莱的人。核酸,核酸和其他物种的同源性,代表性和互补性(NRR)和丰富的同源性(LRR)以及与植物的同源性和多样性。 Lesallèles通讯员,根与种之间的联系。 RGA在地图上的位置和位置在地图上显示的是Rz1位置的居民,并且在Rh1所在地的居民中得到了很好的解决。 cZR-3命名为Rz-C和cinque autres marqueursmoléculaires共有基因座Rz1位于第3染色体上,并且是同等同源的QTL标记。克隆了BAC和25个与àcZR-3杂交的克隆。 De ceux-ci,15号染色体第3染色体周围环境15位,Rz1位点附近。 Rz-C permet de disentuerent resististants et sensibles et son transcritétaitdétectablechez tous les canistin resistantsàla rhizomanie。纪念性大事记RGA纪念集锦。

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