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【24h】

Missing data mean holes in tree of life

机译：数据丢失意味着生命之树上的漏洞

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摘要

As part of the Open Tree of Life project, we surveyed publications covering all domains of life and found that most phylogenetic trees and nudeotide alignments from the past two decades have been irrevocably lost. Of 6,193 papers we surveyed in more than 100 peer-reviewed journals, only 17% present accessible trees and alignments (used to infer relatedness). Contacting lead authors to procure data sets was only 19% successful. DNA sequences were deposited in GenBank for almost all these studies, but it is the actual character alignments that are pivotal for reproducing phylogenetic analyses. We estimate that more than 64% of existing alignments or trees are permanently lost.
机译：作为“开放生命之树”项目的一部分，我们对涵盖生命所有领域的出​​版物进行了调查，发现过去二十年来，大多数系统发育树和核苷排列都不可避免地丢失了。在100余篇同行评审期刊中，我们对6,193篇论文进行了调查，其中只有17％的论文提供了可访问的树和对齐方式（用于推断相关性）。与主要作者联系以获取数据集的成功率只有19％。几乎所有这些研究都将DNA序列保存在GenBank中，但实际的字符比对是重现系统发育分析的关键。我们估计现有路线或树木中有64％以上会永久丢失。

著录项

  • 来源
    《Nature》 |2013年第7432期|305-305|共1页
  • 作者

    Bryan T. Drew;

  • 作者单位

    University of Florida, Gainesville, USA;

  • 收录信息 美国《科学引文索引》(SCI);美国《工程索引》(EI);美国《生物学医学文摘》(MEDLINE);美国《化学文摘》(CA);
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 eng
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