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Analyses of pig genomes provide insight into porcine demography and evolution

机译：猪基因组分析提供了有关猪人口统计和进化的见识

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For 10,000 years pigs and humans have shared a close and complex relationship. From domestication to modern breeding practices, humans have shaped the genomes of domestic pigs. Here we present the assembly and analysis of the genome sequence of a female domestic Duroc pig (Sus scrofa) and a comparison with the genomes of wild and domestic pigs from Europe and Asia. Wild pigs emerged in South East Asia and subsequently spread across Eurasia. Our results reveal a deep phylogenetic split between European and Asian wild boars million years ago, and a selective sweep analysis indicates selection on genes involved in RNA processing and regulation. Genes associated with immune response and olfaction exhibit fast evolution. Pigs have the largest repertoire of functional olfactory receptor genes, reflecting the importance of smell in this scavenging animal. The pig genome sequence provides an important resource for further improvements of this important livestock species, and our identification of many putative disease-causing variants extends the potential of the pig as a biomedical model.%家猪是一种重要的家畜，其基因组受到数千年rn驯化的影响，后来还受到复杂育种方法的影rn响。在“猪基因组测序联合体”支持下，本期rnNature发表了一头雌性“杜洛克猪”的高质量rn基因组序列草稿。对野猪和家猪基因组所做的rn对比，为了解欧洲和亚洲野猪之间的演化关系rn提供了线索，显示了在免疫反应和嗅觉中所涉rn及的基因的迅速演化。本文作者识别出了很多rn可能的致病性基因变异，提高了猪作为种生rn物医学模型的潜力，并且对内生猪逆转录酶病rn毒做了详细的分析，这对于猪在异种移植中的rn可能应用来说是有重要意义的必备知识。
机译：一万年来，猪与人之间有着密切而复杂的关系。从驯化到现代繁殖实践，人类已经塑造了家猪的基因组。在这里，我们介绍了雌性杜洛克猪（Sus scrofa）的基因组序列的组装和分析，并与来自欧洲和亚洲的野生和家养猪的基因组进行了比较。野生猪出现在东南亚，并随后在欧亚大陆扩散。我们的研究结果揭示了百万年前欧洲和亚洲野猪之间的深厚的系统发育分裂，并且选择性扫描分析表明对参与RNA加工和调控的基因的选择。与免疫反应和嗅觉相关的基因表现出快速的进化。猪具有最大的功能性嗅觉受体基因，反映出这种清除动物的气味很重要。猪的基因组序列为进一步改良这一重要的家畜种类提供了重要的资源，我们对许多推定的致病变异的鉴定扩展了猪作为生物医学模型的潜力。％家猪是一种重要的家畜，其基因组在“猪基因组重组联合体”支持下，本期rn自然发表了一头雌性“杜洛克猪”的可能rn基因组序列草稿。 。对野猪和家猪基因组生成物的rn对比，为了解欧洲和亚洲野猪之间的进化关系rn提供了线索，显示了在免疫反应和嗅觉中所涉rn及的基因的迅速演变。出了很多rn可能的致病性基因变异，提高了猪作为种生rn物医学模型的潜力，并且对内生猪逆转录酶病毒毒做了详细的分析，这对于猪在异种移植中的rn可能应用来说是有重要意义的必备知识。

著录项

  • 来源
    《Nature》 |2012年第7424期|p.393-398a3|共7页
  • 作者

    Martien A. M. Groenen; Alan L. Archibald; Hirohide Uenishi; Christopher K. Tuggle; Yasuhiro Takeuchi; et al;

  • 作者单位

    Animal Breeding and Genomics Centre, Wageningen University, De Elst 1, 6708 WD,Wageningen, The Netherlands;

    The Roslin Institute and R(D)SVS, University of Edinburgh, Easter Bush, Midlothian EH25 9RG, UK;

    National Institute of Agrobiological Sciences, 2-1-2 Kannondai, Tsukuba, Ibaraki 305-8602, Japan;

    Department of Animal Science and Center for Integrated Animal Genomics, Iowa State University, 2255 Kildee Hall, Ames 50011, USA;

    MRC/UCL Centre for Medical Molecular Virology and Wohl Virion Centre, Division of Infection & Immunity, University College London, Cruciform Building, Gower Street, London WC1E6BT, UK;

  • 收录信息 美国《科学引文索引》(SCI);美国《工程索引》(EI);美国《生物学医学文摘》(MEDLINE);美国《化学文摘》(CA);
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 eng
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