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首页> 外文期刊>Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America >Ctcf-dependent Enhancer-blocking By Alternative Chromatin Loop Formation
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Ctcf-dependent Enhancer-blocking By Alternative Chromatin Loop Formation

机译：Ctcf依赖增强剂阻断通过替代染色质环形成。

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The mechanism underlying enhancer-blocking by insulators is unclear. We explored the activity of human β-globin HS5, the orthologue of the CTCF-dependent chicken HS4 insulator. An extra copy of HS5 placed between the β-globin locus control region (LCR) and downstream genes on a transgene fulfills the classic predictions for an enhancer-blocker. Ectopic HS5 does not perturb the LCR but blocks gene activation by interfering with RNA pol II, activator and coactivator recruitment, and epigenetic modification at the downstream β-globin gene. Underlying these effects, ectopic HS5 disrupts chromatin loop formation between β-globin and the LCR, and instead forms a new loop with endogenous HS5 that topo-logically isolates the LCR. Both enhancer-blocking and insulator-loop formation depend on an intact CTCF site in ectopic HS5 and are sensitive to knock-down of the CTCF protein by siRNA. Thus, intrinsic looping activity of CTCF sites can nullify LCR function.
机译：绝缘子阻碍增强剂的机理尚不清楚。我们探讨了人类β-珠蛋白HS5的活性，它是CTCF依赖性鸡HS4绝缘子的直向同源物。放置在β-珠蛋白基因座控制区（LCR）和转基因下游基因之间的HS5的额外副本符合增强剂阻断剂的经典预测。异位HS5不会干扰LCR，但会通过干扰RNA pol II，激活和共激活子募集以及下游β-珠蛋白基因的表观遗传修饰来阻止基因激活。在这些作用的基础上，异位HS5破坏了β珠蛋白与LCR之间的染色质环形成，并与拓扑学上分离LCR的内源HS5形成了一个新环。增强子阻断和绝缘子环的形成均取决于异位HS5中完整的CTCF位点，并且对siRNA敲除CTCF蛋白敏感。因此，CTCF位点的固有循环活性可以使LCR功能无效。

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