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NBS解析システムの開発からバイオマーカ候補タンパク質の探索へ

机译：从NBS分析系统的开发到生物标志物候选蛋白的搜索

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摘要

新規バイオマーカ開発のため，著者らはトリプトファンを標的とする安定同位体標識法と質量分析法を組みrn合わせた新規定量プロテオーム解析手法を開発した。その後，本手法に用いる変性剤や濃縮カラムを変更し，rnまた本手法に特に適した新規マトリックスを開発することでさらに改良を加えた。次に，この解析手法をrnHPLC，自動スポッティング装置，MALDI-TOF型質量分析装置，解析ソフトと組み合わせて，バイオマーカrn探索のための総合解析システムを構築した。このシステムを用いて大腸がんや腎がんといった臨床組織サンプrnルを分析した結果，本システムが新規バイオマーカ候補タンパク質の探索に有用であることが示された。本稿rnでは，これら一連の研究を概説するとともに，今後の展開についても考察する。%For the purpose of biomarker discovery, we originally developed a novel method for quantitative proteome analysis utilizing both tryptophan-targeted stable isotope tagging and mass spectrometry. The method has now been refined by replacing detergents and an enrichment column and further utilizing a novel matrix that is specifically suitable for tagged peptides. A total analytical system has been constructed by combining this method with HPLC, an automatic spotter, matrix assisted laser desorption/ionization-time of flight mass spectrometer (MALDI-TOF MS) and analytical software. Clinical tissue samples such as colorectal carcinoma and renal cell carcinoma were analyzed using this system, and the results demonstrated that it is useful for discovering novel biomarker candidates. Here, we review a series of these studies and also discuss future directions for development of this technology.
机译：为了开发新的生物标记，作者开发了一种新的定量蛋白质组分析方法，该方法结合了针对色氨酸和质谱的稳定同位素标记方法。之后，改变该方法中使用的变性剂和浓缩柱，并开发了一种特别适用于该方法的新基质，以进行进一步改进。然后，将该分析方法与rnHPLC，自动点样仪，MALDI-TOF质谱仪和分析软件相结合，以构建用于生物标记rn搜索的综合分析系统。使用该系统分析临床组织样本（例如大肠癌和肾癌）的结果表明，该系统可用于搜索新型生物标志物候选蛋白。在本文中，我们概述了这一系列研究，还考虑了未来的发展。为了发现生物标志物，我们最初开发了一种新的定量蛋白质组分析方法，该方法同时使用色氨酸靶向的稳定同位素标记和质谱，现在通过替换去污剂和富集柱并进一步利用新的基质对该方法进行了改进。通过将该方法与HPLC，自动点样仪，基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱仪（MALDI-TOF MS）和分析软件相结合，构建了一个完整的分析系统。使用该系统对大肠癌和肾细胞癌等癌症进行了分析，结果表明该技术对于发现新型生物标志物非常有用。在这里，我们回顾了一系列研究，并讨论了该技术的未来发展方向。

著录项

  • 来源
    《島津評論》 |2009年第4期|p.161-172|共12页
  • 作者

    松尾英一; 渡辺　真; 九山浩樹; 安藤英治; 岩佐　進; 綱澤　進; 西村　紀;

  • 作者单位

    基盤技術研究所　ライフサイエンス研究所（理学） 大阪大学蛋白質研究所;

    基盤技術研究所　ライフサイエンス研究所（理学）;

    大阪大学蛋白質研究所（農学）;

    分析計測事業部　ライフサイエンス事業統括部 バイオ?臨床ビジネスユニット;

    分析計測事業部　ライフサイエンス事業統括部;

    分析計測事業部;

    大阪大学蛋白質研究所;

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