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基于生物信息学分析子宫内膜异位症的潜在生物标志物和候选治疗药物

         

摘要

目的 探究子宫内膜异位症中差异表达基因(DEGs)及其功能,筛选潜在的生物标志物和候选治疗药物.方法 磁珠分选异位内膜和正常内膜组织中的基质细胞进行基因表达谱分析;结合GE O数据库中可获取的同平台同类芯片数据,利用limma软件包和经验贝叶斯方法筛选DEGs,并进行GO和KEGG富集分析;查询STRING数据库,进行PPI互作网络分析,筛选核心致病基因;再检索CMAP数据库,筛得类药物小分子.结果 869个基因在异位内膜中表达有显著差异,其中17个上调表达,852个下调表达;GO富集分析显示DEGs多调控受体配体活性、通道活性和被动跨膜转运蛋白活性等功能;KEGG富集分析发现DEGs多介导神经活性配体-受体相互作用通路、细胞因子-细胞因子受体相互作用通路和IL-17信号通路等通路;PPI网络表明FPR2、SAA1、RLN3、CXCL8、FPR1、PF4、CCR7和CXCL5共8个基因是核心致病基因;经CMAP数据库分析认为硫代罗宁和氟硝利嗪可能具有治疗内异症的潜在价值.结论 FPR2、SAA1、RLN3、CXCL8、FPR1、PF4、CCR7和CXCL5共8个基因是子宫内膜异位症潜在的生物标志物,硫代罗宁和氟硝利嗪是治疗子宫内膜异位症的候选药物.

著录项

  • 来源
    《安徽医科大学学报》 |2020年第12期|1925-19301935|共7页
  • 作者单位

    安徽医科大学附属省立医院妇产科 合肥 230001;

    中国科学技术大学附属第一医院妇产科 合肥 230031;

    安徽医科大学附属省立医院妇产科 合肥 230001;

    中国科学技术大学附属第一医院妇产科 合肥 230031;

    中国科学技术大学生命科学与医学部免疫研究所和中国科学院天然免疫与慢性疾病重点实验室 合肥 230027;

    中国科学技术大学附属第一医院妇产科 合肥 230031;

    安徽医科大学附属省立医院妇产科 合肥 230001;

    安徽医科大学附属省立医院妇产科 合肥 230001;

    中国科学技术大学附属第一医院妇产科 合肥 230031;

    中国科学技术大学附属第一医院妇产科 合肥 230031;

    安徽医科大学附属省立医院妇产科 合肥 230001;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 子宫内膜异位症;
  • 关键词

    子宫内膜异位症; 生物标志物; 候选治疗药物; 生物信息学;

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