生物标志物

摘要： 背景:靶向铁过载基因调节铁死亡或许是一种较快且有效延缓骨关节炎退变的方法,但目前对骨关节炎铁死亡相关分子机制及基因靶点尚不清楚。目的:通过生物信息学分析铁死亡在骨关节炎中的关键基因和途径,结合体外实验验证骨关节炎中铁死亡标记基因,探讨铁死亡在骨关节炎中的潜在作用。方法:以“Osteoarthritis”为检索词,通过GEO数据库检索2010-01-01/2021-01-01的公开数据,筛选得到基因微阵列数据集GSE55235,对GSE55235数据集进行数据矫正后分析获得差异表达基因;利用FerrDb数据库检索得到铁死亡相关基因与GSE55235数据集差异表达基因作交集,对交集基因作基因本体(Gene Ontology,GO)与京都基因和基因组数据库富集分析(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)并绘制蛋白质-蛋白质相互作用网络,获得骨关节炎铁死亡HUB基因,筛选出铁死亡标记基因;将正常人软骨细胞设为对照组、人软骨细胞骨关节炎模型设为实验组,采用实时荧光定量PCR对两组铁死亡标记基因的mRNA表达进行验证。结果与结论:①共获得36个骨关节炎铁死亡基因,GO富集分析表明其主要参与氧化应激反应、皮质类固醇反应、类固醇激素反应、对糖皮质激素的反应和活性氧的代谢等过程;②针对产生超氧化物的NAD(P)H氧化酶及氧化还原酶活性、血红素结合、四吡咯结合中发挥作用;③KEGG富集分析表明骨关节炎铁死亡基因主要参与NOD样受体、白细胞介素17、缺氧诱导因子1、肿瘤坏死因子及叉头盒O类(FoxO)等信号通路;④构建蛋白质-蛋白质相互作用网络,进一步分析获得血管内皮生长因子A、白细胞介素6、JUN、PTGS2和DUSP1等5个骨关节炎铁死亡HUB基因,筛选出血管内皮生长因子A、白细胞介素6、PTGS2和DUSP1等4个铁死亡标记基因,体外实验证实其在对照组(正常人软骨细胞)与实验组(细胞骨关节炎模型)中有显著差异(P<0.05);⑤上述数据显示,铁死亡可能通过氧化应激、氧化还原及诱导炎症等作用于骨关节炎,机制上可能与缺氧诱导因子1等信号通路刺激NAD(P)H有关;血管内皮生长因子A、白细胞介素6、PTGS2和DUSP1可作为骨关节炎铁死亡的生物标志物。

摘要： N6⁃甲基腺苷(N6⁃methyladenosine,m6A)修饰是真核生物最丰富的一种RNA修饰,广泛参与RNA的核输出、剪接、翻译和降解等过程的调控。越来越多的证据表明环状RNA(circular RNA,circRNA)m6A甲基化修饰与代谢、免疫以及良恶性疾病有关。本文对circRNA m6A甲基化修饰在机体生理过程、恶性肿瘤中的作用及口腔疾病中的研究现状作一综述。现有研究显示,m6A甲基化修饰主要通过调节circRNA翻译、促进circRNA的核输出以及促进circRNA降解对circRNA产生影响;circRNA m6A甲基化修饰在免疫、生殖系统、肌细胞发生发育和恶性肿瘤中发挥调控作用;m6A甲基转移酶蛋白3(methyltransferase⁃like 3,METTL3)通过YTH m6A RNA结合蛋白1(YTH m6A RNA binding protein 1,YTHDF1)介导的m6A修饰促进口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)的发生,METTL14的高表达可有效降低OSCC的增殖、迁移和侵袭;circRNA m6A甲基化修饰在口腔领域的研究较少,仅限于成釉细胞瘤和口腔种植骨吸收方向的初步研究,在口腔重大疾病(如口腔潜在恶性疾病及OSCC)方向有广阔的研究前景。

摘要： 背景:运动对机体产生刺激反应和生物学适应,对骨骼肌和心肌中的mi RNAs表达水平产生影响。不同运动方式能诱导不同的生物适应,比较而言离心收缩运动相对于向心收缩运动对肌肉刺激更大、生物学效应更积极。mi RNAs是短的非编码RNA,通过调节转录后的基因表达来影响生物过程。在大多数体液中有稳定存在的循环mi RNAs,对运动类型和强度有高度敏感性和特异性。目的:综述不同运动类型对循环mi RNAs表达水平的影响,分析了循环mi RNAs作为骨骼肌对运动反应与适应的生物标志物的可能性,以期为运动训练和运动促进健康过程中的干预提供参考。方法:检索有关骨骼肌mi RNAs、循环mi RNAs、运动对mi RNAs影响的文献,以“exercise;myomi RNAs;ci-mi RNAs;HIIT;biomarker”为关键词,在Pub Med、Web of Science等数据库进行检索;以“运动、mi RNAs、myomi RNAs、ci-mi RNAs、反应、生物标志物”为关键词,在CNKI、万方、维普等数据库进行检索。对检索获得的全部文献阅读、分析、判断,最终纳入符合标准的86篇文献进行归纳总结。结果与结论:循环mi RNAs的表达水平会随着人体运动类型和运动强度的改变而升高或降低,有非常大的潜力成为运动反应和适应的生物标志物。对于各种具体的运动方式产生的循环mi RNAs表达水平的具体变化,及其在运动过程中和恢复过程中的生物学意义,还存在很大的研究空间。

摘要： 背景:色素沉着绒毛结节性滑膜炎是一种罕见的滑膜炎性病变,早期诊断缺乏相关生物标志物,m RNA已被证实参与了疾病的发生发展,但其作用机制尚不清楚。目的:通过生物信息学及相关转录组分析鉴定色素沉着绒毛结节性滑膜炎的潜在生物标志物和发病机制,以用于疾病鉴别诊断。方法:通过GEO数据库检索与色素沉着绒毛结节性滑膜炎相关的滑膜组织微阵列数据集,并用Network Analyst分析鉴定差异表达基因(P <0.05)。使用疾病数据库检索与色素沉着绒毛结节性滑膜炎相关的基因,并与差异表达m RNA取交集得到最终差异表达基因。利用Bio GPS对特异性基因进行组织/器官定位。通过STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络,KOBAS 3.0和GSEA 4.1.0对差异表达基因进行富集分析,并运用多重计算方法鉴定核心基因。利用Cytoscape构建竞争性内源性RNA(Ce RNA)网络。GEO数据集验证了具有较高诊断价值的生物标志物。此外,通过Xcell网站分析64种免疫细胞和基质细胞的浓度,并计算丰度分数。结果与结论:在GSE175626数据集中共鉴别出2 546个差异表达基因,包括2 317个差异m RNA和229个差异长链非编码RNA。与疾病数据库中的相关基因取交集后最终得到70个差异表达基因,其中60个被Bio GPS识别。与骨性关节炎患者相比,GO和KEGG富集分析显示,色素沉着绒毛结节性滑膜炎患者的差异表达基因主要参与炎症、细胞增殖、血管生成和免疫反应等方面。Cyto Hubba筛选出15个核心基因,MCODE识别出4个基因簇模块。GEO数据集验证了12个差异性表达核心基因。免疫与基质细胞去卷积分析发现12个核心基因与部分免疫细胞均有密切关系。结果表明:IL-6、TNF、CD163、KRAS、FN1、HMOX1、GAPDH、IL1B、PTPRC、MAPK1、CCR2、NFKBIA可能是色素沉着绒毛结节性滑膜炎诊断的潜在生物标志物。SNHG14-hsa-mi R-206-FN1和XIST-hsa-mi R-107-HMOX1/CD163可能是调节色素沉着绒毛结节性滑膜炎疾病进展的潜在RNA途径。

摘要： 背景:脊柱关节退行性病变主要包括椎间盘退行性病变和骨关节炎,近年来利用外泌体miRNA通过促进细胞的自噬和增殖、迁移等治疗脊柱关节退行性病变已成为具有前景的新兴治疗手段。目的:综述外泌体miRNA在椎间盘退行性病变和骨关节炎的疾病发展、诊断及治疗机制的研究进展。方法:第一作者以“Intervertebral disc degeneration,Osteoarthritis,Exosomes,miRNA,Autophagy,Extracellular matrix,Apoptosis,Cell proliferation,Pyroptosis,Biomarkers,Mechanistic pathways”为检索词检索PubMed数据库,最终纳入133篇英文文献进行归纳总结。结果与结论:①外泌体miRNA治疗脊柱关节退行性疾病的主要作用机制是通过促进自噬和细胞的迁移和增殖,抑制细胞外基质降解、细胞凋亡、细胞焦亡及炎症反应等多个方面发挥对脊柱关节退行性疾病的治疗作用,并且同一外泌体miRNA能够参与同一疾病的不同生理病理过程;②Wnt/β-catenin途径、mTOR、NLRP3、核转录因子κB及MAPK等信号通路在外泌体治疗脊柱关节退行性病变中发挥重要作用,其中MAKP信号通路是外泌体miRNA治疗改善椎间盘退行性病变和骨关节炎疾病进程中共同存在的信号通路,对于寻找椎间盘退行性病变、骨关节炎疾病及其他脊柱关节退行性疾病的共同靶点具有重要启示意义;③同一miRNA家族可参与不同的退行性病变的修复,对于探索或合成新型外泌体miRNA来治疗其他脊柱关节退行性疾病具有重要的借鉴意义,但未来需进一步明确外泌体miRNA对脊柱关节退行性疾病的安全性和不良反应。

摘要： 背景:心搏骤停后早期的神经学结果预测是至关重要的,心搏骤停后脑损伤血液生物标志物一定程度上有助于预测预后。目的:对目前心搏骤停后脑损伤血液生物标志物的研究进展予以综述。方法:应用计算机检索PubMed与中国知网、维普、万方数据库,中文检索词为“心搏骤停,生物标志物,脑损伤”;英文检索词为“cardiac arrest,biomarkers,brain injury”,检索血液生物标志物在预测心搏骤停后脑损伤的有关研究。结果与结论:近年来,各种生物标志物在心搏骤停后脑损伤的神经功能预后中发挥着越来越重要的作用。尽管在新的生物标志物方面取得了许多有希望的结果,但生物标记物预测不良结果的阈值在不同的研究中差异很大,表明这些方法的标准化需求尚未得到满足。评估的指标中没有一项能够绝对确定地预测不良的神经结果,而多模式方法似乎仍然是最谨慎的预测策略。常规的脑损伤标志物,如神经元特异性烯醇化酶(NSE)和S100B,仍然具有重要的优势。目前关于新的血液生物标志物的相关研究仍然需进一步深入探索,通过建立更准确的结果预测在此研究领域实现新的突破。

摘要： 背景:恶性神经胶质瘤经过手术、放疗和化疗后,其预后仍然很差,因此阐明胶质瘤发生发展的分子机制,进一步探索可靠的生物标志物至关重要.非编码RNA在外泌体中富集且稳定,由于其在各种肿瘤的起始和进展中的调节功能而受到了广泛关注.目的:文章就外泌体非编码RNA在胶质瘤中的研究和进展进行概述,介绍外泌体非编码RNA的生物来源,阐明其在胶质瘤中的生物学影响,寻找可靠的肿瘤标志物,以期为神经胶质瘤的诊断和治疗提供新的思路.方法:以"Exosome,Extracellular vesicles,Noncoding RNA,Glioma,Molecule mechanism,Biomarkers"为英文检索词,在PubMed和Web of Science数据库中检索筛选出114篇文献进行归纳总结,文献内容主要涉及外泌体非编码RNA在胶质瘤中的肿瘤细胞增殖、侵袭和血管生成,以及外泌体非编码RNA在胶质瘤中的基因诊断和基因治疗等相关内容.结果 与结论:①外泌体非编码RNA在细胞间选择性包装、分泌和转移,参与肿瘤微环境中的细胞间通讯,并可调节胶质瘤的许多生物学行为,如增殖、侵袭、血管生成、免疫逃逸和治疗耐药性,在胶质瘤的发生发展中起着重要作用.②外泌体包含多种功能分子,可以反映整个肿瘤复杂的异质性.③外泌体具有较高的特异性和灵敏度,并且非常稳定,在几乎所有类型的体液中都很容易获得,这些因素使外泌体成为最有潜力的生物标记物,这为未来诊断胶质瘤提供了很大帮助.④外泌体是天然且无毒性的,与质膜的构造相当类似,可将其作为许多治疗性药物的治疗载体,携带多种生物活性分子并能轻易跨越血脑屏障,通过外泌体来开发靶向抗癌药物,既能突破血脑屏障,还能避免人体的免疫排斥反应.⑤外泌体与靶细胞结合具有特定的靶向性,这些优势极大提升了外泌体应用在胶质瘤生物靶向治疗的可行性,但其在临床应用中还面临着一些困难,如外泌体的分选难度大,外泌体非编码RNA的含量有限,以及如何让外泌体精确到达肿瘤部位等.⑥随着外泌体非编码RNA在胶质瘤中研究的不断深入,未来将为攻克胶质瘤这一难题提供新的路径.

摘要： 前列腺癌(PCa)是男性常见的恶性肿瘤.外泌体是存在于人体多种体液中的双层膜囊泡,携带核酸、蛋白等物质,介导细胞间通讯.外泌体可以促进前列腺癌的生长,协助免疫逃逸及化学治疗耐药,诱导血管生成、上皮细胞间充质转化(EMT)并为转移前生态位的形成提供条件,进而促进前列腺癌的侵袭和转移.基于肿瘤细胞与正常细胞分泌的外泌体成分不同,外泌体可作为前列腺癌诊断、预测侵袭转移、评估患者预后及药物疗效的生物标志物,并有望作为药物运输载体,在肿瘤的精准治疗中具有广阔的前景.

摘要： 筛选高质量配子和高发育潜能胚胎是辅助生殖技术关注的重点.近年研究发现胚胎培养液中含有胚胎分泌的蛋白、游离DNA片段、细胞因子等,胚胎也从培养液中获取胚胎发育所需的营养物质.通过分析胚胎培养液成分,运用无创的方法,利用胚胎代谢组学、蛋白组学等方法快速、准确筛选出最具有发育潜能的优质胚胎.本文总结氨基酸、碳水化合物、细胞因子和蛋白质等物质对胚胎发育的影响.

摘要： 唾液外泌体是指存在于唾液中的直径在30～150 nm的细胞外囊泡.随着近年来技术手段的发展,大量研究揭示唾液外泌体在多种口腔疾病的发生发展中发挥重要作用,如唾液外泌体CD9及CD81通过调控细胞粘附及运动促进肿瘤细胞转移、唾液外泌体miR-24-3p通过作用于PER1促进肿瘤细胞增殖、唾液外泌体程序性细胞死亡配体-1(programmed cell death-ligand 1,PD-L1)mRNA抑制炎症组织的破坏等,具有作为诊断口腔癌、牙周炎等口腔疾病的生物标志物的潜能.因此,唾液外泌体可作为口腔疾病潜在的预后和诊断标志物.唾液外泌体除与口腔疾病,如口腔癌、牙周炎、口腔扁平苔藓、干燥综合征等有关外,还同远处部位肿瘤如胰腺癌、肺癌等及系统性疾病如帕金森综合征、炎症性肠病等密切相关;深入研究唾液外泌体对口腔、全身系统性疾病的诊断与治疗作用,开发唾液外泌体作为疾病诊断的生物标志物的潜力具有重要意义.

摘要： 热休克蛋白60(HSP60)氨基酸序列高度保守,具有广泛的生物学功能和免疫原性.研究证实,当生物细胞和个体受到物理、化学、病理等环境因素胁迫时,HSP60参与应激反应中的蛋白质合成、线粒体DNA代谢、细胞内多肤折叠、受损线粒体蛋白运输等重要生理过程,以自发减少机体损伤.HSP60作为环境健康效应新型生物标志物,已在海洋、土壤、空气中环境因子(如高温、高寒、噪声、电离辐射、重金属、有机农药、环境激素等)对生物体及其重要器官的健康损伤和危害预警研究中得到广泛应用.另外,HSP60的生物标志物研究成果还为肿瘤早期诊断与治疗、职业健康评价和流行病学调查等提供新的科学思路和技术于段.同时,有关HSP60作用路径精确示踪、HSP60与效应生物体精确量效关系模型等难题还亟待解决.

摘要： 肺动脉高压(pulmonary arterial hypertension,PAH)是一种预后不良的进展性疾病,由于肺血管收缩和重构引起肺血管阻力增加、肺动脉压力增加和右心室功能衰竭,甚至死亡.病理特征包括内膜增生、中膜增厚、丛状病变和原位血栓形成.鉴于其复杂的病理生理和高死亡率,早期诊断和预后分层评估对精准治疗极其重要;而生物标志物由于其可在血液、尿液或呼气凝结物等体液中检测,不仅与疾病严重程度、临床进展和治疗反应相关联,而且简易方便、降低成本和改善预后.尽管至今尚未发现一个理想的生物标志物可以揭示PH的全部特征,但人类从未停止探索.本文将综述PH生物标志物研究进展,并推荐临床中采用多参数评估的方法.

摘要： 近年来,随着对肿瘤免疫机制及肿瘤免疫逃逸机制的了解日益深入,以尼伏单抗(Nivolumab)、哌姆单抗(Pembrolizumab)和阿替珠单抗(Atezolizumab)为代表的免疫检查点抑制药,即程序性死亡受体(PD-1)及其配体(PD-L1)的抗体相继问世,极大改变了非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)的临床治疗模式,相比化疗显著改善了患者的生存和生活质量.为了选择出最有可能从免疫检查点抑制药治疗中获益的患者群体,前期临床研究均选取免疫组织化学(immunohistochemistry,IHC)染色检测的肿瘤组织PD-L1表达水平作为初治或复治患者疗效预测的生物标志物.然而,PD-L1表达作为生物标志物也遇到了许多挑战,使得进一步寻找更可靠的生物标志物的探索成为必要.多种基于组织或血液检测的新的生物标志物有望帮助更精准地找出可从免疫治疗中获益的患者群,这些生物标志物包括:肿瘤突变负荷(TMB),炎症型肿瘤(“热”肿瘤)标志物如肿瘤浸润淋巴细胞(tumor infitration lymphocyte,TILS)与免疫评分、T细胞受体克隆、基因签名等.

摘要： 慢性阻塞性肺疾病(以下简称慢阻肺)是最常见的慢性气道疾病,目前中国有约1亿慢阻肺患者,40岁以上人群的患病率高达13.7％[1].慢阻肺的表型研究因而成为热点.目前基于嗜酸粒细胞等生物标志物的慢阻肺表型研究已得到越来越多的关注,并逐渐成为指导慢阻肺治疗的重要指标.1879年,临床上观察到哮喘患者嗜酸粒细胞增高的现象.直至一个多世纪后,嗜酸粒细胞与支气管哮喘(以下简称哮喘)发病之间的关系才被明确阐述[2-3].骨髓嗜酸粒细胞祖细胞在哮喘发病过程中的重要作用的发现,为哮喘靶向治疗开启了全新的篇章[4-5].

摘要： 2017年以来,特发性间质性肺炎(idiopathic interstitial pneumonia,IIP)领域出现许多新的进展.本文复习相关文献,就报道比较多的几个热点问题包括:IIP的生物标志物研究现状、IPF及非IPF-IIP的某些进展加以介绍.

摘要： 滤泡性淋巴瘤是西半球最常见的惰性非霍奇金淋巴瘤.多个随机临床试验证实治疗中加入利妥昔单抗对FL的自然史产生了积极的影响,化疗联合利妥昔单抗,提高了总体生存率.但这种疾病异质性很强,不同个体生物学上和临床上有不同的表现,预后也有很大的差异.目前的研究集中在对患者进行精确的风险分层后有针对性的治疗.在过去的几年中,肿瘤分级、肿瘤负荷和FL国际预后指数已用于区分低风险和高风险患者.生物因素中关键的7个基因突变如(EZH2、ARID1A、MEF2B、EP300、FOX01、CREBBP和CARD11)与滤泡性淋巴瘤国际预后指标结合可帮助识别一线治疗效果不佳的高风险患者.最近已经证明对初始治疗的反应,PET的结果或患者的缓解持续时间,能够识别高风险人群.但仍有一些问题需要进一步研究,即如何更好的识别高危患者,针对靶向制剂的生物标志物的开发,降低FL转化风险的策略.

摘要： 感染是一个永恒话题，WHO数据显示:每年因感染性疾病死亡者约占全球每年总体死亡率的25.5％(约1500万人），呼吸道感染是致患者死亡最主要的感染性疾病死亡人数约430万人/年。

摘要： 感染是一个永恒话题，WHO数据显示:每年因感染性疾病死亡者约占全球每年总体死亡率的25.5％(约1500万人），呼吸道感染是致患者死亡最主要的感染性疾病死亡人数约430万人/年。

摘要： 感染是一个永恒话题，WHO数据显示:每年因感染性疾病死亡者约占全球每年总体死亡率的25.5％(约1500万人），呼吸道感染是致患者死亡最主要的感染性疾病死亡人数约430万人/年。

摘要： 感染是一个永恒话题，WHO数据显示:每年因感染性疾病死亡者约占全球每年总体死亡率的25.5％(约1500万人），呼吸道感染是致患者死亡最主要的感染性疾病死亡人数约430万人/年。

摘要： 用于识别低风险地具有尿路上皮癌(UC)的血尿患者的新方法，该方法包括将挑选的表型变量与基因型表达水平组合到新的指标，即“G+P指数”中。G+P指数将年龄、性别、吸烟史、血尿的存在和血尿的频率与遗传标志物，MDK、CDC2、HOXA13、IGFBP5和可选的IL8Rb的基因型表达相结合，然后确定由患者所获得的G+P指数值是在以下三组中的一组内：(1)UC高风险，(2)UC风险，或(3)UC低风险。

摘要： 本发明公开了提取胰腺癌诊断用生物标志物的方法、用于所述方法的计算装置、胰腺癌诊断用生物标志物以及包含该生物标志物的胰腺癌诊断用装置。更具体地，本发明公开了利用在胰腺癌患者中特异性表达的基因或者获自血液或组织的与所述基因配对的微RNA来提取胰腺癌诊断用生物标志物的方法、用于所述方法的计算装置、胰腺癌诊断用生物标志物以及包含该生物标志物的胰腺癌诊断用装置。

摘要： 生物标志物检测方法包括以下步骤：基于从多个参考活体的每一个获得的参考活体数据中的多个因子项目数据来准备参考数据集(ST1)；将从目标活体获得的目标活体数据中的多个因子项目数据添加到参考数据集以生成目标数据集(ST2)；在参考数据集中的多个因子项目之间求出第一相关系数(ST3)；在目标数据集中的多个因子项目之间求出第二相关系数(ST4)；求出作为第一相关系数和第二相关系数的差分的差分相关系数(ST5)；对于多个因子项目中的每一个基于差分相关系数求出指标(ST6)；基于指标选择生物标志物(ST7)。

摘要： 本发明公开了提取胰腺癌诊断用生物标志物的方法、用于所述方法的计算装置、胰腺癌诊断用生物标志物以及包含该生物标志物的胰腺癌诊断用装置。更具体地，本发明公开了利用在胰腺癌患者中特异性表达的基因或者获自血液或组织的与所述基因配对的微RNA来提取胰腺癌诊断用生物标志物的方法、用于所述方法的计算装置、胰腺癌诊断用生物标志物以及包含该生物标志物的胰腺癌诊断用装置。

摘要： 提供了一种同时分析多种生物标志物的设备，根据本发明的实施例，该同时分析多种生物标志物的设备包括：料筒安装部分(210)，料筒(100)安装在料筒安装部分(210)中，料筒(100)包括一个或多个井和尖端(110)，该一个或多个井包括包含检测对象物质(T)的样本(S)被注入到其中的样本井(101)和用于容纳第一结合材料(105a)的反应井(105)，第一结合材料(105a)能与检测对象物质(T)特异性结合并且标志物(R)联接到第一结合材料(105a)，尖端(110)插入到一个或多个井内并且能与检测对象物质(T)特异性结合的第二结合材料(111)联接到其一端；尖端联接部分(220)，其联接到尖端(110)并且能在联接了尖端(110)时在预定移动轨迹上移动；光学单元(230)，其向尖端(110)照射光并接收根据光照射而从尖端(110)产生的光；和处理单元(240)，其利用光学单元(230)接收到的光、根据预定方法来确定样本(S)中是否存在检测对象物质(T)。

摘要： 本发明公开了克罗恩病生物标志物、试剂盒及生物标志物的筛选方法，克罗恩病生物标志物包括KO号为：K02761、K00368、K09953、K00285、K18692、K11895、K02796、K06148、K03710、K02240、K14393、K00689、K08652、K07251、K06286、K06175、K15726的微生物同源基因；克罗恩病生物标志物的筛选方法包括以下步骤：S1、获取疾病和正常对照组微生物测序数据及临床信息数据，并进行预处理；S2、将预处理后的微生物测序数据进行筛选，对微生物同源基因KO进行定量与注释；S3、对疾病患者和健康对照组的微生物同源基因数据进行差异分析，获得差异显著的微生物同源基因；S4、对差异同源基因进行筛选，确定同源基因最优生物标志物；综上，本发明提供的克罗恩病生物标志物及筛选方法取样方便、无创，具有较高的临床价值。

摘要： 本发明公开结直肠腺瘤生物标志物、试剂盒及生物标志物的筛选方法，结直肠腺瘤生物标志物包括内脏奥德氏杆菌Odoribacter splanchnicus_62174、解纤维素拟杆菌Bacteroides cellulosilyticus_58046、沙氏别样杆菌Alistipes shahii_62199等；肿瘤生物标志物的筛选方法，包括：S1、获取疾病和正常对照组微生物测序数据及临床信息数据，并进行预处理；S2、将预处理后的微生物测序数据进行筛选，对具有足够测序深度和覆盖度的菌株进行SNV水平的注释，获得每个菌株的SNV突变频率等信息；S3、对疾病患者和健康对照组的微生物SNV数据进行差异分析，获得不同菌株中差异显著的SNV位点；S4、对差异SNV位点进行筛选，确定SNV最优生物标志物；综上，本发明提供的生物标志物及筛选方法更好地进行癌症早诊早治，具有重要的意义和临床应用价值。

摘要： 本申请涉及一种用于筛选头颈鳞癌西妥昔单抗原发耐药生物标志物的方法、用该方法筛选的生物标志物及其用途。本申请通过建立头颈鳞癌患者肿瘤组织来源的小鼠异种移植瘤模型(patient‑derived xenograft，PDX)，获取患者准确的临床信息，构建头颈鳞癌PDX模型平台。在构建的PDX模型平台中，参考临床二期研究模式，选择患者对应的PDX模型入组开展PDX模型临床替代性试验，进行西妥昔单抗药物治疗，借助全外显子测序及转录组测序，筛选西妥昔单抗的原发耐药生物标志物。经试验验证，本申请提供的头颈鳞癌西妥昔单抗原发耐药的生物标志物是预测头颈鳞癌患者对西妥昔单抗药效非常可靠的标志物。

摘要： 本发明提出了一种基于比率的方法，用于在人外周血单核细胞中新发现的mtRNA。比率变换方法可用于标准化sncRNA数据的艰巨任务，从而识别可靠的生物标志物。并且，我们还提出了一种利用外周血mtRNA和比率变换进行肺癌诊断的新方法。

摘要： 本发明属于分子生物学领域，公开了一种泛癌甲基化生物标志物及其筛选方法和应用，通过开发新的数据筛选方法，筛选出具有泛癌性质的甲基化标志物PRKCB基因。然后针对筛选出的PRKCB基因特定区域进行甲基化检测引物和探针设计，建立检测体系检测肿瘤样本中的甲基化信号，具有准确性高、特异性强的优点，在保证检测性能的情况下，能够简单、快速、低成本、标准统一地对样本进行检测。本发明为泛癌肿瘤筛查、术后及预后评估提供新思路，并对阐明肿瘤恶性行为的分子机制具有重要意义，可以根据肿瘤标志物PRKCB基因启动子区域来开发无创型泛癌甲基化诊断产品及术后、预后评估产品。