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Pacific Symposium on Biocomputing 2001, Jan 3-7, 2001, Mauna Lani, Hawaii
Pacific Symposium on Biocomputing 2001, Jan 3-7, 2001, Mauna Lani, Hawaii
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1.
ANALYZING SITE HETEROGENEITY DURING PROTEIN EVOLUTION
机译:
蛋白质进化过程中的位点异质性分析
作者:
JEFFREY M. KOSHI
;
RICHARD A. GOLDSTEIN
会议名称:
《Pacific Symposium on Biocomputing 2001, Jan 3-7, 2001, Mauna Lani, Hawaii》
|
2001年
2.
ViewFeature: Integrated Feature Analysis and Visualization
机译:
ViewFeature:集成的功能分析和可视化
作者:
D.R. Banatao
;
C.C. Huang
;
P.C. Babbitt
;
R.B. Altman
;
T.E. Klein
会议名称:
《Pacific Symposium on Biocomputing 2001, Jan 3-7, 2001, Mauna Lani, Hawaii》
|
2001年
3.
UNSUPERVISED LEARNING FROM COMPLEX DATA: THE MATRIX INCISION TREE ALGORITHM
机译:
不受监督的复杂数据学习:矩阵入侵树算法
作者:
Ju Han Kim
;
Lucila Ohno-Machado
;
Isaac S. Kohane
会议名称:
《Pacific Symposium on Biocomputing 2001, Jan 3-7, 2001, Mauna Lani, Hawaii》
|
2001年
4.
USING GRAPHICAL MODELS AND GENOMIC EXPRESSION DATA TO STATISTICALLY VALIDATE MODELS OF GENETIC REGULATORY NETWORKS
机译:
使用图形模型和基因表达数据对遗传调控网络的模型进行统计验证
作者:
ALEXANDER J. HARTEMINK
;
DAVID K. GIFFORD
;
TOMMI S. JAAKKOLA
;
RICHARD A. YOUNG
会议名称:
《Pacific Symposium on Biocomputing 2001, Jan 3-7, 2001, Mauna Lani, Hawaii》
|
2001年
5.
Including Biological Literature Improves Homology Search
机译:
包括生物文献可提高同源性搜索
作者:
Jeffrey T. Chang
;
Soumya Raychaudhuri
;
Russ B. Altman
会议名称:
《Pacific Symposium on Biocomputing 2001, Jan 3-7, 2001, Mauna Lani, Hawaii》
|
2001年
6.
EVENT EXTRACTION FROM BIOMEDICAL PAPERS USING A FULL PARSER
机译:
使用全解析器从生物医学中提取事件
作者:
Akane Yakushiji
;
Yuka Tateisi
;
Yusuke Miyao
;
Jun-ichi Tsujii
会议名称:
《Pacific Symposium on Biocomputing 2001, Jan 3-7, 2001, Mauna Lani, Hawaii》
|
2001年
7.
DEVELOPMENT OF A SYSTEM FOR THE INFERENCE OF LARGE SCALE GENETIC NETWORKS
机译:
大型遗传网络推理系统的开发
作者:
Y. Maki
;
D. Tominaga
;
M. Okamoto
;
S. Watanabe
;
Y. Eguchi
会议名称:
《Pacific Symposium on Biocomputing 2001, Jan 3-7, 2001, Mauna Lani, Hawaii》
|
2001年
8.
EXACT ALGORITHMS FOR COMPUTING PAIRWISE ALIGNMENTS AND 3-MEDIANS FROM STRUCTURE-ANNOTATED SEQUENCES
机译:
精确算法,用于计算带结构注释的序列的对数对齐和3中值
作者:
P.A. EVANS
;
H.T. WAREHAM
会议名称:
《Pacific Symposium on Biocomputing 2001, Jan 3-7, 2001, Mauna Lani, Hawaii》
|
2001年
9.
MARKOV CHAIN MONTE CARLO COMPUTATION OF CONFIDENCE INTERVALS FOR SUBSTITUTION-RATE VARIATION IN PROTEINS
机译:
蛋白质替代率变化的置信区间的马尔可夫链蒙特卡罗计算
作者:
ANDREY RZHETSKY
;
PAVEL MOROZOV
会议名称:
《Pacific Symposium on Biocomputing 2001, Jan 3-7, 2001, Mauna Lani, Hawaii》
|
2001年
10.
A MULTITHREADED PARALLEL IMPLEMENTATION OF A DYNAMIC PROGRAMMING ALGORITHM FOR SEQUENCE COMPARISON
机译:
序列比较的动态规划算法的多线程并行实现
作者:
W.S. MARTINS
;
J.B. DEL CUVILLO
;
F.J. USECHE
;
K.B. THEOBALD
;
G.R. GAO
会议名称:
《Pacific Symposium on Biocomputing 2001, Jan 3-7, 2001, Mauna Lani, Hawaii》
|
2001年
11.
Molecular Fingerprinting on the SIMD Parallel Processor Kestrel
机译:
SIMD并行处理器红est上的分子指纹
作者:
Eric Rice
;
Richard Hughey
会议名称:
《Pacific Symposium on Biocomputing 2001, Jan 3-7, 2001, Mauna Lani, Hawaii》
|
2001年
12.
A MODEL FOR PHYLOGENETIC INFERENCE USING STRUCTURAL AND CHEMICAL COVARIATES
机译:
结构和化学变量的系统发育推论模型
作者:
SIMON TAVARE
;
DEAN C. ADAMS
;
OLIVIER FEDRIGO
;
GAVIN J. P. NAYLOR
会议名称:
《Pacific Symposium on Biocomputing 2001, Jan 3-7, 2001, Mauna Lani, Hawaii》
|
2001年
13.
A NEW ALGORITHM FOR ANALYSIS OF WITHIN-HOST HIV-1 EVOLUTION
机译:
一种用于分析HIV-1宿主内释放的新算法
作者:
F. REN
;
S. OGISHIMA
;
H. TANAKA
会议名称:
《Pacific Symposium on Biocomputing 2001, Jan 3-7, 2001, Mauna Lani, Hawaii》
|
2001年
14.
A New Implementation and Detailed Study of Breakpoint Analysis
机译:
断点分析的新实现和详细研究
作者:
Bernard M.E. Moret
;
Stacia Wyman
;
David A. Bader
;
Tandy Warnow
;
Mi Yan
会议名称:
《Pacific Symposium on Biocomputing 2001, Jan 3-7, 2001, Mauna Lani, Hawaii》
|
2001年
15.
NUTRIENT-RELATED ANALYSIS OF PATHWAY/GENOME DATABASES
机译:
通路/基因组数据库的营养相关分析
作者:
P.R. ROMERO
;
P. KARP
会议名称:
《Pacific Symposium on Biocomputing 2001, Jan 3-7, 2001, Mauna Lani, Hawaii》
|
2001年
16.
A COMPARISON OF GENETIC NETWORK MODELS
机译:
遗传网络模型的比较
作者:
L.F.A. WESSELS
;
E.P. VAN SOMEREN
;
M.J.T. REINDERS
会议名称:
《Pacific Symposium on Biocomputing 2001, Jan 3-7, 2001, Mauna Lani, Hawaii》
|
2001年
17.
PERCOLATION CLUSTERING: A NOVEL APPROACH TO THE CLUSTERING OF GENE EXPRESSION PATTERNS IN DICTYOSTELIUM DEVELOPMENT
机译:
渗透聚类:一种在双歧杆菌发育中基因表达模式聚类的新方法
作者:
R. SASIK
;
T. HWA
;
N. IRANFAR
;
W. F. LOOMIS
会议名称:
《Pacific Symposium on Biocomputing 2001, Jan 3-7, 2001, Mauna Lani, Hawaii》
|
2001年
18.
PIES, a Protein Interaction Extraction System
机译:
PIES,蛋白质相互作用提取系统
作者:
Limsoon Wong
会议名称:
《Pacific Symposium on Biocomputing 2001, Jan 3-7, 2001, Mauna Lani, Hawaii》
|
2001年
19.
ON REPORTING FOLD DIFFERENCES
机译:
关于报告折价差异
作者:
C.L. TSIEN
;
T.A. LIBERMANN
;
X. GU
;
I. S. KOHANE
会议名称:
《Pacific Symposium on Biocomputing 2001, Jan 3-7, 2001, Mauna Lani, Hawaii》
|
2001年
20.
SAMIE: STATISTICAL ALGORITHM FOR MODELING INTERACTION ENERGIES
机译:
SAMIE:用于建模交互能量的统计算法
作者:
P.V. BENOS
;
A.S. LAPEDES
;
D.S. FIELDS
;
G.D. STORMO
会议名称:
《Pacific Symposium on Biocomputing 2001, Jan 3-7, 2001, Mauna Lani, Hawaii》
|
2001年
21.
STRESS-INDUCED DNA DUPLEX DESTABILIZATION IN TRANSCRIPTIONAL INITIATION
机译:
转录引发中的应力诱导DNA双链失稳
作者:
C.J. BENHAM
会议名称:
《Pacific Symposium on Biocomputing 2001, Jan 3-7, 2001, Mauna Lani, Hawaii》
|
2001年
22.
SIMULATING THE GROWTH OF VIRUSES
机译:
模拟病毒的增长
作者:
LINGCHONG YOU
;
JOHN YIN
会议名称:
《Pacific Symposium on Biocomputing 2001, Jan 3-7, 2001, Mauna Lani, Hawaii》
|
2001年
23.
AN NMR-BASED QUENCHED HYDROGEN EXCHANGE INVESTIGATION OF MODEL AMYLOID FIBRILS FORMED BY COLD SHOCK PROTEIN A
机译:
基于NMR的冷休克蛋白A模型淀粉样原纤维的氢交换研究
作者:
ANDREI T. ALEXANDRESCU
会议名称:
《Pacific Symposium on Biocomputing 2001, Jan 3-7, 2001, Mauna Lani, Hawaii》
|
2001年
24.
AN ALGORITHM FOR STATISTICAL ALIGNMENT OF SEQUENCES RELATED BY A BINARY TREE
机译:
二叉树相关序列的统计对齐算法
作者:
JOTUN HEIN
会议名称:
《Pacific Symposium on Biocomputing 2001, Jan 3-7, 2001, Mauna Lani, Hawaii》
|
2001年
关键词:
sequence evolution;
insertion-deletion model;
dynamic programming;
25.
COLLECTIVE REORIENTATIONAL MOTION AND NUCLEAR SPIN RELAXATION IN PROTEINS
机译:
蛋白质的集体定向运动和核自旋松弛
作者:
J. J. PROMPERS
;
S. F. LIENIN
;
R. BRUESCHWEILER
会议名称:
《Pacific Symposium on Biocomputing 2001, Jan 3-7, 2001, Mauna Lani, Hawaii》
|
2001年
26.
USING METACOMPUTING TOOLS TO FACILITATE LARGE-SCALE ANALYSES OF BIOLOGICAL DATABASES
机译:
使用元计算工具方便地进行生物数据库的大规模分析
作者:
Allison Waugh
;
Glenn A. Williams
;
Liping Wei
;
Russ B. Altman
会议名称:
《Pacific Symposium on Biocomputing 2001, Jan 3-7, 2001, Mauna Lani, Hawaii》
|
2001年
27.
Gene Verification and Discovery by Walking Tree Method
机译:
步行树法进行基因验证和发现
作者:
Tai Hsu
;
Paul Cull
会议名称:
《Pacific Symposium on Biocomputing 2001, Jan 3-7, 2001, Mauna Lani, Hawaii》
|
2001年
28.
MUTUAL INFORMATION ANALYSIS AS A TOOL TO ASSESS THE ROLE OF ANEUPLOIDY IN THE GENERATION OF CANCER-ASSOCIATED DIFFERENTIAL GENE EXPRESSION PATTERNS
机译:
互信息分析作为评估非肿瘤性在癌相关差异基因表达模式产生中的作用的工具
作者:
GREGORY T. KLUS
;
ANDREW SONG
;
ARI SCHICK
;
MATTIAS WAHDE
;
ZOLTAN SZALLASI
会议名称:
《Pacific Symposium on Biocomputing 2001, Jan 3-7, 2001, Mauna Lani, Hawaii》
|
2001年
29.
DETECTING GENE RELATIONS FROM MEDLINE ABSTRACTS
机译:
从MEDLINE摘要中检测基因关系
作者:
M. STEPHENS
;
M. PALAKAL
;
S. MUKHOPADHYAY
;
R. RAJE
;
J. MOSTAFA
会议名称:
《Pacific Symposium on Biocomputing 2001, Jan 3-7, 2001, Mauna Lani, Hawaii》
|
2001年
30.
DETERMINING SIGNIFICANT FOLD DIFFERENCES IN GENE EXPRESSION ANALYSIS
机译:
确定基因表达分析中重要的折叠差异
作者:
A. J. BUTTE
;
J. YE
;
H. U. HAERING
;
M. STUMVOLL
;
M. F. WHITE
;
I. S. KOHANE
会议名称:
《Pacific Symposium on Biocomputing 2001, Jan 3-7, 2001, Mauna Lani, Hawaii》
|
2001年
31.
EFFICIENCIES OF GENES AND ACCURACY OF TREE-BUILDING METHODS IN RECOVERING A KNOWN DROSOPHILA GENEALOGY
机译:
基因的效率和树构建方法在恢复已知果蝇遗传学中的准确性
作者:
J.E. STEINBACHS
;
N.V. SCHIZAS
;
J.W.O. BALLARD
会议名称:
《Pacific Symposium on Biocomputing 2001, Jan 3-7, 2001, Mauna Lani, Hawaii》
|
2001年
32.
DNA Structure. Protein-DNA Interactions, and DNA-Protein Expression
机译:
DNA结构。蛋白质-DNA相互作用和DNA蛋白质表达
作者:
P.F. Baldi
;
R.H. Lathrop
会议名称:
《Pacific Symposium on Biocomputing 2001, Jan 3-7, 2001, Mauna Lani, Hawaii》
|
2001年
33.
BIDIRECTIONAL INCREMENTAL PARSING FOR AUTOMATIC PATHWAY IDENTIFICATION WITH COMBINATORY CATEGORIAL GRAMMAR
机译:
基于组合分类语法的自动路径识别的双向增量剖析
作者:
Jong C. Park
;
Hyun Sook Kim
;
Jung Jae Kim
会议名称:
《Pacific Symposium on Biocomputing 2001, Jan 3-7, 2001, Mauna Lani, Hawaii》
|
2001年
34.
BIOPROSPECTOR: DISCOVERING CONSERVED DNA MOTIFS IN UPSTREAM REGULATORY REGIONS OF CO-EXPRESSED GENES
机译:
生物保护者:在共表达基因的上游调控区域中发现保守的DNA动机
作者:
X. LIU
;
D.L. BRUTLAG
;
J.S. LIU
会议名称:
《Pacific Symposium on Biocomputing 2001, Jan 3-7, 2001, Mauna Lani, Hawaii》
|
2001年
35.
THE PROTEIN NON-FOLDING PROBLEM: AMINO ACID DETERMINANTS OF INTRINSIC ORDER AND DISORDER
机译:
蛋白质非折叠问题:内在有序和无序的氨基酸决定因素
作者:
R.M. WILLIAMS
;
Z. OBRADOVI
;
V. MATHURA
;
W. BRAUN
;
E.C. GARNER
;
J. YOUNG
;
S. TAKAYAMA
;
C.J. BROWN
;
A.K. DUNKER
会议名称:
《Pacific Symposium on Biocomputing 2001, Jan 3-7, 2001, Mauna Lani, Hawaii》
|
2001年
36.
ASSESSMENT AND MANAGEMENT OF SINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHISM GENOTYPE ERRORS IN GENETIC ASSOCIATION ANALYSIS
机译:
遗传关联分析中单核苷酸多态性基因型错误的评估与管理
作者:
DEREK GORDON
;
JUERG OTT
会议名称:
《Pacific Symposium on Biocomputing 2001, Jan 3-7, 2001, Mauna Lani, Hawaii》
|
2001年
37.
MAXIMUM LIKELIHOOD ANALYSIS OF ADAPTIVE EVOLUTION IN HIV-1 GP120 ENV GENE
机译:
HIV-1 GP120 ENV基因适应进化的最大似然分析
作者:
ZIHENG YANG
会议名称:
《Pacific Symposium on Biocomputing 2001, Jan 3-7, 2001, Mauna Lani, Hawaii》
|
2001年
38.
A NEW ALGORITHM FOR THE ALIGNMENT OF MULTIPLE PROTEIN STRUCTURES USING MONTE CARLO OPTIMIZATION
机译:
基于蒙特卡洛优化的多种蛋白质结构对齐新算法
作者:
C. GUDA
;
E. D. SCHEEFF
;
P. E. BOURNE
;
I. N. SHINDYALOV
会议名称:
《Pacific Symposium on Biocomputing 2001, Jan 3-7, 2001, Mauna Lani, Hawaii》
|
2001年
39.
A NONPARAMETRIC SCORING ALGORITHM FOR IDENTIFYING INFORMATIVE GENES FROM MICROARRAY DATA
机译:
用于从微阵列数据中识别信息基因的非参数评分算法
作者:
PETER J. PARK
;
MARCELLO PAGANO
;
MARCO BONETTI
会议名称:
《Pacific Symposium on Biocomputing 2001, Jan 3-7, 2001, Mauna Lani, Hawaii》
|
2001年
40.
A STRUCTURE-BASED APPROACH FOR PREDICTION OF PROTEIN BINDING SITES IN GENE UPSTREAM REGIONS
机译:
基于结构的基因上游地区蛋白结合位点的预测方法
作者:
Y. MANDEL-GUTFREUND
;
A. BARON
;
H. MARGALIT
会议名称:
《Pacific Symposium on Biocomputing 2001, Jan 3-7, 2001, Mauna Lani, Hawaii》
|
2001年
41.
A TREE OBSCURED BY VINES: HORIZONTAL GENE TRANSFER AND THE MEDIAN TREE METHOD OF ESTIMATING SPECIES PHYLOGENY
机译:
藤蔓所吸引的树:水平基因转移和中亚树种物种谱系估计方法
作者:
JUNHYONG KIM
;
BENJAMIN .A. SALISBURY
会议名称:
《Pacific Symposium on Biocomputing 2001, Jan 3-7, 2001, Mauna Lani, Hawaii》
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2001年
42.
NUCLEOTIDE SUBSTITUTIONS AND THE EVOLUTION OF DUPLICATE GENES
机译:
核苷酸取代和双倍基因的进化
作者:
JOHN S. CONERY
;
MICHAEL LYNCH
会议名称:
《Pacific Symposium on Biocomputing 2001, Jan 3-7, 2001, Mauna Lani, Hawaii》
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2001年
43.
PREDICTING GENE FUNCTION FROM GENE EXPRESSIONS AND ONTOLOGIES
机译:
从基因表达和本体预测基因功能
作者:
T.R. HVIDSTEN
;
J. KOMOROWSKI
;
A.K. SANDVIK
;
A. LAEGREID
会议名称:
《Pacific Symposium on Biocomputing 2001, Jan 3-7, 2001, Mauna Lani, Hawaii》
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2001年
44.
QUALITY CONTROL IN MANUFACTURING OLIGO ARRAYS: A COMBINATORIAL DESIGN APPROACH
机译:
制造寡聚阵列的质量控制:组合设计方法
作者:
RIMLI SENGUPTA
;
MARTIN TOMPA
会议名称:
《Pacific Symposium on Biocomputing 2001, Jan 3-7, 2001, Mauna Lani, Hawaii》
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2001年
45.
PROMOTER REGION-BASED CLASSIFICATION OF GENES
机译:
基于启动子区域的基因分类
作者:
P. PAVLIDIS
;
T. S. FUREY
;
M. LIBERTO
;
D. HAUSSLER
;
W. N. GRUNDY
会议名称:
《Pacific Symposium on Biocomputing 2001, Jan 3-7, 2001, Mauna Lani, Hawaii》
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2001年
46.
Representation and simulation of biochemical processes using the π-calculus process algebra
机译:
π演算过程代数对生化过程的表示和模拟
作者:
Aviv Regev
;
William Silverman
;
Ehud Shapiro
会议名称:
《Pacific Symposium on Biocomputing 2001, Jan 3-7, 2001, Mauna Lani, Hawaii》
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2001年
47.
REVERSE ENGINEERING OF METABOLIC PATHWAYS FROM OBSERVED DATA USING GENETIC PROGRAMMING
机译:
遗传程序从观测数据进行代谢途径的逆向工程
作者:
John R. Koza
;
William Mydlowec
;
Guido Lanza
;
Jessen Yu
;
Martin A. Keane
会议名称:
《Pacific Symposium on Biocomputing 2001, Jan 3-7, 2001, Mauna Lani, Hawaii》
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2001年
48.
SCALING OF ACCURACY IN EXTREMELY LARGE PHYLOGENETIC TREES
机译:
大型系统树的准确性标度
作者:
O. R. P. BININDA-EMONDS
;
S. G. BRADY
;
J.KIM
;
M. J. SANDERSON
会议名称:
《Pacific Symposium on Biocomputing 2001, Jan 3-7, 2001, Mauna Lani, Hawaii》
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2001年
49.
Sequence Analysis With the Kestrel SIMD Parallel Processor
机译:
使用Kestrel SIMD并行处理器进行序列分析
作者:
Leslie Grate
;
Mark Diekhans
;
David Dahle
;
Richard Hughey
会议名称:
《Pacific Symposium on Biocomputing 2001, Jan 3-7, 2001, Mauna Lani, Hawaii》
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2001年
关键词:
sequence analysis;
smith-waterman;
hidden markov models;
SIMD parallel processing;
50.
TEXTQUEST: DOCUMENT CLUSTERING OF MEDLINE ABSTRACTS FOR CONCEPT DISCOVERY IN MOLECULAR BIOLOGY
机译:
TEXTQUEST:用于分子生物学概念发现的MEDLINE摘要的文档聚类
作者:
I. ILIOPOULOS
;
A. J. ENRIGHT
;
C. A. OUZOUNIS
会议名称:
《Pacific Symposium on Biocomputing 2001, Jan 3-7, 2001, Mauna Lani, Hawaii》
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2001年
51.
Analyzing sensory systems with the information distortion function
机译:
使用信息失真功能分析感官系统
作者:
Alexander G Dimitrov
;
John P Miller
会议名称:
《Pacific Symposium on Biocomputing 2001, Jan 3-7, 2001, Mauna Lani, Hawaii》
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2001年
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