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Molecular informatics

SCIMEDLINECA

中文名称：分子信息学

ISSN：1868-1743
出版周期：Monthly

发文量：504

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1.Computational Approaches to the Chemical Equilibrium Constant in Protein-ligand Binding

机译：蛋白质-配体结合中化学平衡常数的计算方法
- 作者：Montalvo-Acosta Joel Jose;Cecchini Marco
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2016年第12期
- molecular recognition;
- protein-ligand binding;
- binding affinity;
- free energy calculations;
- rational drug design;
2.Y In silico Exploration of the Conformational Universe of GPCRs

机译：Y对GPCR构象宇宙的计算机探索
- 作者：Rodriguez-Espigares Ismael;Kaczor Agnieszka A.;Selent Jana
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2016年第7期
- Membrane proteins;
- Signal transduction;
- Molecular dynamics;
- Conformation analysis;
- Drug design;
3.Interaction of Tenebrio Molitor Antifreeze Protein with Ice Crystal: Insights from Molecular Dynamics Simulations

机译：黄粉虫防冻蛋白与冰晶的相互作用：分子动力学模拟的见解。
- 作者：Ramya L.;Ramakrishnan Vigneshwar
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2016年第7期
- CHARMM program;
- TmAFP antifreeze protein;
- hexagonal ice crystal (Ih);
- primary prism plane and basal plane;
4.The Comparison of the Combined Toxicity between Gram-negative and Gram-positive Bacteria: a Case Study of Antibiotics and Quorum-sensing Inhibitors

机译：革兰氏阴性和革兰氏阳性细菌联合毒性的比较：抗生素和仲裁感抑制剂的案例研究
- 作者：Wang Dali;Lin Zhifen;Ding Xiruo;Hu Jingyun;Liu Ying
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2016年第2期
- sulfonamides;
- penicillin;
- quorum-sensing inhibitors;
- combined toxicity;
5.A Simple and Resource-efficient Setup for the Computer-aided Drug Design Laboratory

机译：计算机辅助药物设计实验室的简单且资源高效的设置
- 作者：Moretti Loris;Sartori Luca
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2016年第10期
6.Development of Quantum Chemical Method to Calculate Half Maximal Inhibitory Concentration (IC50)

机译：量子化学方法计算半数最大抑制浓度（IC50）的发展
- 作者：Bag Arijit;Ghorai Pradip Kr.
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2016年第5期
- IC50;
- Log P;
- HIV-1;
- Capsid inhibitor;
7.Materials Informatics: Statistical Modeling in Material Science

机译：材料信息学：材料科学中的统计建模
- 作者：Yosipof Abraham;Shimanovich Klimentiy;Senderowitz Hanoch
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2016年第12期
- Material informatics;
- material science;
- QSAR;
- chemoinformatics;
- solar cells;
- photovoltaic cells;
8.Predictive Models for Halogen-bond Basicity of Binding Sites of Polyfunctional Molecules

机译：多功能分子结合位点的卤素键碱性预测模型
- 作者：Glavatskikh Marta;Madzhidov Timur;Solovev Vitaly;Marcou Gilles;Horvath Dragos;Graton Jerome;Le Questel Jean-Yves;Varnek Alexandre
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2016年第2期
- Halogen bonding;
- QSPR;
- ensemble modeling;
- applicability domain;
9.Comparative Analysis of QSAR-based vs. Chemical Similarity Based Predictors of GPCRs Binding Affinity

机译：基于QSAR和化学相似性的GPCR结合亲和力预测因子的比较分析
- 作者：Luo Man;Wang Xiang S.;Tropsha Alexander
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2016年第1期
- QSAR modeling;
- PASS;
- SEA;
- GPCRs;
- Model validation;
10.Simultaneous Prediction of four ATP-binding Cassette Transporters' Substrates Using Multi-label QSAR

机译：使用多标签QSAR同时预测四个ATP结合盒式转运蛋白的底物
- 作者：Aniceto Natalia;Freitas Alex A.;Bender Andreas;Ghafourian Taravat
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2016年第10期
- Multi-label Classification;
- QSAR;
- Transporter;
- P-glycoprotein;
- Multidrug-resistance Associated Protein;
- Breast Cancer Resistance Protein;
- BCRP1;
- MRP1;
- MRP2;
11.Machine Learning Estimation of Atom Condensed Fukui Functions

机译：原子凝聚的Fukui函数的机器学习估计
- 作者：Zhang Qingyou;Zheng Fangfang;Zhao Tanfeng;Qu Xiaohui;Aires-de-Sousa Joao
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2016年第2期
- QSPR;
- Random Forest;
- Chemoinformatics;
- Bradley-Terry Models;
- Quantum Chemistry;
12.CNS Multiparameter Optimization Approach: Is it in Accordance with Occam's Razor Principle?

机译：CNS多参数优化方法：是否符合Occam的剃刀原理？
- 作者：Raevsky Oleg A.
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2016年第4期
13.Visualization Based Data Mining for Comparison Between Two Solar Cell Libraries

机译：基于可视化的数据挖掘，用于两个太阳能电池库之间的比较
- 作者：Yosipof Abraham;Kaspi Omer;Majhi Koushik;Senderowitz Hanoch
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2016年第12期
- Solar cell libraries;
- Chemoinformatics;
- Material Informatics;
- Principal Component Analysis;
- Self-Organizing Maps;
14.Advances in Activity Cliff Research

机译：活动悬崖研究进展
- 作者：Dimova Dilyana;Bajorath Juergen
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2016年第5期
- Bioactive compounds;
- molecular similarity;
- potency;
- activity cliffs;
- X-ray structures;
- structure-activity relationships;
- data mining;
- informatics;
- visualization;
15.A Random Forest Model for Predicting Allosteric and Functional Sites on Proteins

机译：预测蛋白质变构和功能位点的随机森林模型
- 作者：Chen Ava S-Y.;Westwood Nicholas J.;Brear Paul;Rogers Graeme W.;Mavridis Lazaros;Mitchell John B. O.
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2016年第4期
- Random Forest;
- Machine Learning;
- Cheminformatics;
- Drug Design;
- Allosteric site;
16.Structural and Functional Diversities of the Hexadecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthrene Framework, a Ubiquitous Scaffold in Steroidal Hormones

机译：甾体激素无处不在的六价六氢-1H-环戊[a]菲骨架的结构和功能多样性
- 作者：Choudhury Chinmayee;Priyakumar U. Deva;Sastry G. Narahari
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2016年第4期
- Natural products;
- Steroid derivatives;
- Tetracyclic compounds;
- Privileged scaffolds;
- Docking;
- e-Pharmacophore;
17.Molecular Informatics: From Models to Systems and Beyond

机译：分子信息学：从模型到系统及其他
- 作者：Baumann Knut;Ecker Gerhard F.;Mestres Jordi;Schneider Gisbert
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2016年第1期
18.Building Compound Archives for the Future

机译：建立未来的复合档案
- 作者：Lewis Richard;Deheuvels Joakim;Ertl Peter;Pirard Bernard;Sirockin Finton
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2016年第12期
- Physicochemical properties;
- Diversity;
- Protein pocket analysis;
19.In Silico Investigation of the Neurotensin Receptor 1 Binding Site: Overlapping Binding Modes for Small Molecule Antagonists and the Endogenous Peptide Agonist

机译：在计算机上的神经降压素受体1结合位点的计算机研究：小分子拮抗剂和内源性肽激动剂的重叠结合模式。
- 作者：Lueckmann Michael;Holst Birgitte;Schwartz Thue W.;Frimurer Thomas M.
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2016年第1期
- Molecular modeling;
- Docking;
- Virtual screening;
20.Derivation of Self-inhibitory Helical Peptides to Target Rho-kinase Dimerization in Cerebrovascular Malformation: Structural Bioinformatics Analysis and Peptide Binding Assay

机译：在脑血管畸形中自抑制性螺旋肽的目标Rho激酶二聚化的衍生：结构生物信息学分析和肽结合测定
- 作者：Wang Xuyang;Hou Dianqi;Dai Weiwei;Gao Wenwei;Ju Shiming;Cao Heli;Zhang Lin;Wang Gan;Guo Yan;Chen Shiwen;Tian Hengli;Li Zhiqiang
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2016年第7期
- Rho-kinase;
- dimerization;
- self-inhibitory peptide;
- cerebrovascular malformation;
21.The Art of Compiling Protein Binding Site Ensembles

机译：蛋白质结合位点集合体的编辑艺术
- 作者：Bietz Stefan;Faehrrolfes Rainer;Rarey Matthias
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2016年第12期
- protein structure ensembles;
- protein data bank;
- protein binding sites;
- protein-ligand interactions;
- flexible docking;
22.Molecular Polarization Potential as a Molecular Descriptor to Predict Biological Activity of Dioxins and Dibenzofurans

机译：分子极化势作为预测二恶英和二苯并呋喃生物活性的分子描述子
- 作者：Roset Lurdes;Perez Juan J.
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2016年第10期
23.Multiple-parameter Optimization in Drug Discovery: Example of the 5-HT1B GPCR

机译：药物发现中的多参数优化：5-HT1B GPCR的实例
- 作者：Glen Robert Charles;Galloway Warren R. J. D.;Spring David R.;Liwiki Gemma
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2016年第12期
- 5-HT1B;
- Pulmonary Arterial Hypertension;
- PAH;
- Computer-Aided Molecular Design;
24.Molecular Simulations Bring New Insights into Protoporphyrinogen IX Oxidase/Protoporphyrinogen IX Interaction Modes

机译：分子模拟为原卟啉原IX氧化酶/原卟啉原IX相互作用模式提供了新见解
- 作者：Wang Baifan;Wen Xin;Xi Zhen
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2016年第10期
- Protoporphyrinogen IX oxidase;
- Substrate binding mode;
- Docking;
- Molecular dynamics;
- Enzymes;
25.In silico and in vitro Studies on Begomovirus Induced Andrographolide Biosynthesis Pathway in Andrographis Paniculata for Combating Inflammation and Cancer

机译：沙门氏菌介导的穿心莲内生穿心莲内酯生物合成途径对抗炎症和炎症的计算机和体外研究
- 作者：Khan Asifa;Sharma Pooja;Khan Feroz;Ajayakumar P. V.;Shanker Karuna;Samad Abdul
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2016年第7期
- docking;
- SnRK1 protein kinase;
- viral protein C2;
- TrAP;
- anti-cancerous;
- anti-inflammatory;
26.Rational Design of Coumarin Derivatives as CK2 Inhibitors by Improving the Interaction with the Hinge Region

机译：通过改善与铰链区的相互作用，合理设计香豆素衍生物作为CK2抑制剂
- 作者：Zhang Na;Chen Wen-juan;Zhou Yue;Zhao Hongtao;Zhong Ru-gang
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2016年第1期
- Protein kinase CK2;
- molecular docking;
- hinge region;
- cancer;
27.Hierarchical Analysis of Bioactive Matched Molecular Pairs, Encoded Chemical Transformations, and Associated Substructures

机译：生物活性匹配分子对，编码的化学转化和相关的子结构的层次分析。
- 作者：Hu Ye;Bajorath Juergen
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2016年第10期
- Matched molecular pairs;
- chemical transformations;
- substructures;
- structural hierarchy;
- activity profiles;
28.Analyzing Promiscuity at the Level of Active Compounds and Targets

机译：在活性化合物和靶标水平上分析滥交
- 作者：Bajorath Juergen
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2016年第12期
- Active compounds;
- targets;
- promiscuity;
- polypharmacology;
- compound activity data;
- data mining;
29.BIGCHEM: Challenges and Opportunities for Big Data Analysis in Chemistry

机译：BIGCHEM：化学大数据分析的挑战与机遇
- 作者：Tetko Igor V.;Engkvist Ola;Koch Uwe;Reymond Jean-Louis;Chen Hongming
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2016年第12期
30.5(th) Strasbourg Summer School in Chemoinformatics

机译：第5届斯特拉斯堡化学信息暑期学校
- 作者：Varnek Alexandre;Rognan Didier
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2016年第12期
31.Pharmacophore-Map-Pick: A Method to Generate Pharmacophore Models for All Human GPCRs

机译：Pharmacophore-Map-Pick：一种为所有人类GPCR生成Pharmacophore模型的方法
- 作者：Dai Shao-Xing;Li Gong-Hua;Gao Yue-Dong;Huang Jing-Fei
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2016年第2期
- GPCR;
- Pharmacophore model;
- Drug discovery;
32.Predicting Melting Points of Organic Molecules: Applications to Aqueous Solubility Prediction Using the General Solubility Equation (vol 34, pg 715, 2015)

机译：预测有机分子的熔点：在使用一般溶解度方程的水溶液溶解度预测中的应用（第34卷，第715页，2015年）
- 作者：McDonagh J. L.;van Mourik T.;Mitchell J. B. O.
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2016年第10期
33.Hydration Free Energy as a Molecular Descriptor in Drug Design: A Feasibility Study

机译：水合自由能作为药物设计中的分子表征：一项可行性研究
- 作者：Zafar Ayesha;Reynisson Johannes
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2016年第5期
- B3LYP;
- chemical space;
- density solvation model;
- chemoinformatics and drug design;
34.6 Deep Learning in Drug Discovery

机译：6药物发现中的深度学习
- 作者：Gawehn Erik;Hiss Jan A.;Schneider Gisbert
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2016年第1期
- bioinformatics;
- cheminformatics;
- drug design;
- machine-learning;
- neural network;
- virtual screening;
35.Designing Multi-target Compound Libraries with Gaussian Process Models

机译：使用高斯过程模型设计多目标复合库
- 作者：Bieler Michael;Reutlinger Michael;Rodrigues Tiago;Schneider Petra;Kriegl Jan M.;Schneider Gisbert
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2016年第5期
- ant colony optimization;
- combinatorial chemistry;
- drug design;
- machine learning;
- polypharmacology;
36.Guided Iterative Substructure Search (GI-SSS) - A New Trick for an Old Dog

机译：引导式迭代子结构搜索（GI-SSS）-老狗的新技巧
- 作者：Weskamp Nils
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2016年第7期
- Chemoinformatics;
- Computational Chemistry;
- Medicinal Chemistry;
- Drug Discovery;
- Fused-ring Systems;
- Heterocycles;
37.Systematic Analysis of Tyrosine Kinase Inhibitor Response to RET Gatekeeper Mutations in Thyroid Cancer

机译：甲状腺癌对RET Gatekeeper突变的酪氨酸激酶抑制剂的系统分析
- 作者：Meng Shu;Wu Hongyan;Wang Jing;Qiu Qiyuan
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2016年第10期
- RET kinase;
- gatekeeper mutation;
- tyrosine kinase inhibitor;
- drug resistance;
- thyroid cancer;
38.Sparse Neural Network Models of Antimicrobial Peptide-Activity Relationships

机译：抗菌肽-活性关系的稀疏神经网络模型
- 作者：Muller Alex T.;Kaymaz Aral C.;Gabernet Gisela;Posselt Gernot;Wessler Silja;Hiss Jan A.;Schneider Gisbert
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2016年第12期
- antibiotic;
- deep learning;
- evolutionary algorithm;
- machine learning;
- molecular dynamics simulation;
- structure-activity relationship;
39.Chemoinformatic Classification Methods and their Applicability Domain

机译：化学信息学分类方法及其适用领域
- 作者：Mathea Miriam;Klingspohn Waldemar;Baumann Knut
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2016年第5期
- Applicability Domain;
- Novelty Detection;
- Confidence Estimation;
- Validation;
- Prediction Error;
40.Docking-based Design of Galantamine Derivatives with Dual-site Binding to Acetylcholinesterase

机译：加兰他敏衍生物的对接设计与乙酰胆碱酯酶的双位结合。
- 作者：Stavrakov Georgi;Philipova Irena;Zheleva Dimitrina;Atanasova Mariyana;Konstantinov Spiro;Doytchinova Irini
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2016年第7期
- acetylcholinesterase inhibitors;
- galantamine;
- molecular docking;
- ChemPLP;
- dual-site binding;
- amyloid beta peptide;
41.Chemotherapy Drug Response to the L858R-induced Conformational Change of EGFR Activation Loop in Lung Cancer

机译：肺癌中L858R诱导的EGFR激活环构象变化的化疗药物反应
- 作者：Ding Xi;Liu Xingcai;Song Xiaoyun;Yao Jun
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2016年第10期
- human epidermal growth factor receptor;
- L858R mutation;
- chemotherapy drug;
- lung cancer;
42.Combination of In Silico Analysis and In Vitro Assay to Investigate Drug Response to Human Epidermal Growth Factor Receptor 2 Mutations in Lung Cancer

机译：结合计算机分析和体外分析研究肺癌对人表皮生长因子受体2突变的药物反应
- 作者：Yu Xiyan;Wang Tong;Lou Ying;Li Yanwen
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2016年第1期
- epidermal growth factor receptor 2;
- tyrosine kinase inhibitor;
- mutation;
- drug response;
- lung cancer;
43.Binding Kinetics in Drug Discovery

机译：药物发现中的结合动力学
- 作者：Ferruz Noelia;De Fabritiis Gianni
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2016年第7期
- binding kinetics;
- molecular dynamics;
- drug discovery;
- adaptive sampling;
44.Explorations into Chemical Reactions and Biochemical Pathways

机译：化学反应与生化途径探索
- 作者：Gasteiger Johann
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2016年第12期
45.Constructing and Validating 3D-pharmacophore Models to a Set of MMP-9 Inhibitors for Designing Novel Anti-melanoma Agents

机译：为设计新型抗黑素瘤药物的一组MMP-9抑制剂构建和验证3D药效团模型
- 作者：Turra Kely Medeiros;Rivelli Diogo Pineda;de Moraes Barros Silvia Berlanga;Mesquita Pasqualoto Kerly Fernanda
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2016年第7期
- 4D-QSAR;
- MMP-9;
- melanoma;
- molecular docking;
- computer-aided drug design;
46.Defining Known Drug Space Using DFT

机译：使用DFT定义已知药物空间
- 作者：Matuszek Anna M.;Reynisson Johannes
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2016年第2期
- B3LYP;
- chemical space;
- molecular descriptors;
- chemoinformatics and drug discovery;
47.Empirical Scoring Functions for Affinity Prediction of Protein-ligand Complexes

机译：蛋白质-配体配合物亲和力预测的经验评分函数
- 作者：Pason Lukas P.;Sotriffer Christoph A.
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2016年第12期
- structure-based drug design;
- docking;
- binding free energy;
- descriptors;
- machine learning;
48.Predictive Models for the Free Energy of Hydrogen Bonded Complexes with Single and Cooperative Hydrogen Bonds

机译：具有单氢键和合作氢键的氢键复合物自由能的预测模型
- 作者：Glavatskikh Marta;Madzhidov Timur;Solovev Vitaly;Marcou Gilles;Horvath Dragos;Varnek Alexandre
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2016年第12期
- QSPR;
- hydrogen bonding strength;
- free energies of single and cooperative hydrogen bonds;
49.In silico Prediction of Drug Induced Liver Toxicity Using Substructure Pattern Recognition Method

机译：基于亚结构模式识别方法的计算机模拟药物诱导的肝毒性
- 作者：Zhang Chen;Cheng Feixiong;Li Weihua;Liu Guixia;Lee Philip W.;Tang Yun
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2016年第4期
- Drug-induced liver injury;
- machine learning;
- substructure pattern recognition;
- structural alerts;
50.3D Structure, Dimerization Modeling, and Lead Discovery by Ligand-protein Interaction Analysis of p60 Transcription Regulator Protein (p60TRP)

机译：通过p60转录调节蛋白（p60TRP）的配体-蛋白质相互作用分析进行3D结构，二聚化建模和线索发现
- 作者：Pramanik Subrata;Kutzner Arne;Heese Klaus
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2016年第4期
- BHLHB9;
- p60TRP;
- in silico;
- interaction;
- lead discovery;
- brain;
- Alzheimer's disease;
51.Consensus QSAR Related to Global or MOA Models: Application to Acute Toxicity for Fish

机译：与全球或MOA模型相关的共识QSAR：在鱼类急性毒性中的应用
- 作者：Sylvain Lozano;Marie Pierre Halm Lemeille;Alban Lepailleur;Sylvain Rault
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2010年第11期
52.Quantitative Prediction of Regioselectivity Toward Cytochrome P450/3A4 Using Machine Learning Approaches

机译：使用机器学习方法对细胞色素P450 / 3A4的区域选择性进行定量预测
- 作者：Kiyoshi Hasegawa;Michio Koyama;Kimito Funatsu
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2010年第3期
- Structure-activity relationships;
- ADMET;
- CYP 3A4;
- Random forest;
- Regioselectivity;
53.Rigorous Free Energy Calculations in Structure-Based Drug Design

机译：基于结构的药物设计中严格的自由能计算
- 作者：Julien Michel;Nicolas Foloppe;Jonathan W. Essex
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2010年第9期
54.Best Practices for QSAR Model Development, Validation, and Exploitation

机译：QSAR模型开发，验证和开发的最佳实践
- 作者：Alexer Tropsha
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2010年第7期
- QSAR modeling;
- Model validation;
- Virtual screening;
- Drug discovery;
55.In Silico Receptorome Screening of Antipsychotic Drugs

机译：抗精神病药物的计算机感受器组筛选
- 作者：David Vidal;Jordi Mestres
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2010年第7期
- Chemogenomics;
- Polypharmacology;
- Chemical biology;
- Drug repurposing;
- High-throughput screening;
56.Probabilistic Modeling of Conformational Space for 3D Machine Learning Approaches

机译：3D机器学习方法构象空间的概率建模
- 作者：Andreas Jahn;Georg Hinselmann;Nikolas Fechner;Carsten Henneges;Andreas Zell
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2010年第5期
- 4D-QSAR;
- Machine learing;
- Molecular similarity;
- Gaussian mixture model;
57.How to Deal with Batch Effect in Sequential Microarray Experiments?

机译：在顺序微阵列实验中如何处理批量效应？
- 作者：Nino Demetrashvili;Ken Kron;Vaijayanti Pethe;Bharati Bapat;Laurent Briollais
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2010年第5期
- Sequential microarray experiments;
- Batch effect adjustment;
- Empirical Bayes;
- Clustering;
- Methylation profile;
58.A Free-Wilson-like Approach to Analyze QSAR Models Based on Graph Decomposition Kernels

机译：基于图分解核的类Free-Wilson方法分析QSAR模型
- 作者：Nikolas Fechner;Georg Hinselmann;Andreas Jahn;Lars Rosenbaum;Andreas Zell
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2010年第7期
- QSAR;
- Kernel;
- Free-Wilson;
- Inverse QSAR;
- Selectivity;
59.Pharmacophores in Drug Research

机译：药物研究中的药理学
- 作者：Thierry Langer
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2010年第7期
- Pharmacophore;
- Virtual screening;
- Ligand profiling;
- Affinity fingerprint;
- Drug design;
- Database mining;
60.Design, Synthesis, and Evaluation of Antineoplastic Activity of Novel Carbocyclic Nucleosides

机译：新型碳环核苷的抗肿瘤活性设计，合成及评价
- 作者：Aliuska M. Helguera;J. E. Rodriguez-Borges;Olga Caamano;Xerardo Garcia-Mera;Maykel Perez Gonzalez;M. Natalia D. S. Cordeiro
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2010年第3期
- Antitumor agents;
- Nucleosides;
- QSAR;
- 3D-DRAGON descriptors;
- Leukemia;
61.An Improved Weighted-Residue Profile Based Method of Using Protein-Ligand Interaction Information in Increasing Hits Selection from Virtual Screening: A Study on Virtual Screening of Human GPCR A2A Receptor Antagonists

机译：基于蛋白质配体相互作用信息从虚拟筛选中增加命中选择的改进的基于加权残基图谱的方法：人GPCR A2A受体拮抗剂虚拟筛选的研究
- 作者：Mohammad Shahid;Vinod Kasam;Martin Hofmann Apitius
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2010年第11期
62.Impact of the Recent Mouse P-Glycoprotein Structure for Structure-Based Ligand Design

机译：最近的小鼠P-糖蛋白结构对基于结构的配体设计的影响
- 作者：Freya Klepsch;Gerhard F. Ecker
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2010年第4期
- Proteins;
- Molecular modelling;
- Drug design;
- Ligands;
63.Multi-class Mode of Action Classification of Toxic Compounds Using Logic Based Kernel Methods

机译：使用基于逻辑的核方法对有毒化合物进行多类作用方式分类
- 作者：Huma Lodhi;Stephen Muggleton;Mike J. E. Stemberg
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2010年第9期
64.A Statistical Survey on the Binding Constants of Covalently Bound Protein-Ligand Complexes

机译：共价结合的蛋白质-配体复合物的结合常数的统计调查。
- 作者：Xun Li;Zhihai Liu;Yan Li;Jie Li;Jiajie Li;Renxiao Wang
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2010年第2期
- Covalent binding;
- Protein-ligand complex;
- Binding constant;
- PDBbind;
- Enzyme proficiency;
- Drug design;
- Molecular modeling;
65.Cheminformatics Approach to Gene Silencing: Z Descriptors of Nucleotides and SVM Regression Afford Predictive Models for siRNA Potency

机译：基因沉默的化学信息学方法：核苷酸的Z描述子和SVM回归Afford siRNA效能预测模型
- 作者：Jerry 0. Ebalunode;Weifan Zheng
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2010年第12期
66.Quantitative Structure-Fluorescence Property Relationship Analysis of a Large BODIPY Library

机译：大型BODIPY库的定量结构-荧光性质关系分析
- 作者：Andreas Schuller;Garrett Benjamin Goh;Hanjo Kim;Jun Seok Lee;Young Tae Chang
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2010年第10期
67.Molecular Informatics-From models to Molecules and Systems

机译：分子信息学-从模型到分子和系统
- 作者：Knut Baumann
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2010年第2期
68.Drug-Target Networks

机译：药物靶向网络
- 作者：Ingo Vog;Jordi Mestres
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2010年第2期
- Polypharmacology;
- Chemogenomics;
- Drug repurposing;
- Target profiling;
- Affinity fingerprint;
- Drug design;
- Molecular evolution;
69.Exhaustive Structure Generation for Inverse-QSPR/QSAR

机译：反向QSPR / QSAR的穷举结构生成
- 作者：Tomoyuki Miyao;Masamoto Arakawa;Kimito Funatsu
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2010年第2期
- Inverse-QSAR;
- Inverse-QSPR;
- Molecular design;
- Structure generation;
- Chemoinformatics;
- Drug design;
70.Selecting Relevant Descriptors for Classification by Bayesian Estimates: A Comparison with Decision Trees and Support Vector Machines Approaches for Disparate Data Sets

机译：选择有关贝叶斯估计值分类的相关描述符：与针对不同数据集的决策树和支持向量机方法进行比较
- 作者：Miriam Carbon Mangels;Michael C. Hutterl
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2011年第10期
- Chemoinformatics;
- Drug design;
- Feature selection;
- in silico-ADMET;
- Machine learning;
- Molecular descriptors;
- Naive Bayes classifier;
71.Predicting the Thermal Stability of Nitroaromatic Compounds Using Chemoinformatic Tools

机译：使用化学信息学工具预测硝基芳族化合物的热稳定性
- 作者：Guillaume Fayet;Alberto Del Rio;Patricia Rotureau;Laurent Joubert;and Carlo Adamo
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2011年第7期
- Thermal stability;
- Structure-property relationships;
- REACH regulation;
- Chemoinformatics;
- OECD principles;
72.A Comparative Study on the Constitutive Properties of Marketed Pesticides

机译：市售农药的构成特性比较研究
- 作者：Gefei Hao;Qingjian Dong;Guangfu Yang
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2011年第7期
- Constitutive properties;
- Fungicide;
- Herbicide;
- Insecticide;
- Pesticide-likeness;
73.Multi-pH QSAR: A Method to Differentiate the Activity of Neutral and Ionized Species and Obtain True Correlations when both Species are involved

机译：多pH QSAR：一种区分中性和离子化物种活动并在涉及两种物种时获得真实相关性的方法
- 作者：Robert A. Scherrer;Albert J. Leo
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2011年第4期
74.A Novel Generalized 3D-QSAR Model-of Camptothecin Analogs

机译：喜树碱类似物的新型广义3D-QSAR模型
- 作者：Magdalena Bacilieri;Silvia Paoletta;Serena Basili;Marco Fanton;Stefano Moro
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2011年第12期
- 3D-QSAR;
- Molecular docking;
- Conformational analysis;
- Autocorrelation Molecular Electrostatic Potential (autoMEP);
- Campt;
75.A Comparative Study of Nonlinear Machine Learning for the 'In Silico' Depiction of Tyrosinase Inhibitory Activity from Molecular Structure

机译：非线性机器学习对分子结构中酪氨酸酶抑制活性的“计算机模拟”描述的比较研究
- 作者：Huong Le Thi Thu;Yovani Marrero Ponce;Gerardo M. Casanola Martin;Gladys Casas Cardoso
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2011年第7期
- Machine learning technique;
- Atom-based quadratic index;
- Tyrosinase inhibitor;
- Multiple comparison test;
76.BIBuilder: Exhaustive Searching for De Novo Ligands

机译：BIBuilder：详尽搜索De Novo配体
- 作者：Miguel Teodoro;Ingo Muegge
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2011年第1期
77.A Role for Hydration In lnterleukin-2 Inducible T Cell Kinase (Itk) Selectivity

机译：水合在白介素2诱导性T细胞激酶（Itk）选择性中的作用。
- 作者：Ronald M. A. Knegtel;Daniel D. Robinson
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2011年第12期
- Kinase selectivity;
- Drug design;
- WaterMap;
- Molecular Dynamics;
- Itk;
78.A Combination of Computational and Experimental Approaches to Investigate the Binding Behavior of B.sub Lipase A Mutants with Substrate pNPP

机译：计算和实验方法的组合，以调查B.sub脂肪酶A突变体与底物pNPP的结合行为
- 作者：Zhonq Ni;Xin Jin;Penq Zhou;Qi Wu;Xian Fu Lin
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2011年第4期
- QM/MM;
- Molecular docking;
- Site-directed mutagenesis;
- B.sub lipase A;
- Enzyme-substrate interaction;
79.Predictivity of Simulated ADME AutoQSAR Models over Time

机译：模拟ADME AutoQSAR模型随时间变化的可预测性
- 作者：Sarah L Rodgers;Andrew M. Davis;Nick P. Tomkinson;Han van de Water bee md
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2011年第3期
- ADME;
- ADMET;
- autoQSAR;
- BNN;
- PLS;
- Quantitative structure-activity relationships (QSAR);
- Quantitative structure-property relationships (QSPR);
- Random forest (RF);
80.Mapping Chemical Structures to Markush Structures Using SMIRKS

机译：使用SMIRKS将化学结构映射到Markush结构
- 作者：Wei Deng;Gisbert Schneider;W. Venus So
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2011年第8期
- Markush structure;
- SMIRKS;
- SMILES;
- Nested R-group;
- Patent search;
- Combinatorial chemistry;
81.Identification and Application of Antitarget Actiwlty Hotspots to Guide Compound Optimization

机译：抗靶活性热点的识别和应用以指导化合物优化
- 作者：Gerhard Hessler;Hans Matter;Friedemann Schmidt;Clemens Giegerich;Li hsing Wang;Stefan Giissregen;Karl Heinz Baringhaus
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2011年第12期
- Antitarget;
- Activity Hotspot;
- hERG;
- CYP3A4;
- Compound optimization;
82.Blind Dockings of Benzothlazoles to Multiple Receptor Conformations of Triosephosphate Isomerase from Trypanosoma cruzi and Human

机译：苯并噻唑的盲对接与克鲁氏锥虫和人的磷酸三糖异构酶的多个受体构型
- 作者：Zeynep Kurkcuoglu;Gulgun Ural;E. Demet Akten;Pemra Doruker
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2011年第12期
- Blind docking;
- Triosephosphate isomerase;
- Trypanosoma cruzi;
- Molecular dynamics;
- Benzothiazole;
83.CADASTER QSPR Models for Predictions of Melting and Boiling Points of Perfluorinated Chemicals

机译：用于全氟化物熔点和沸点预测的CADASTER QSPR模型
- 作者：Barun Bhhatarai;Wolfram Teetz;Tao Liu;Tomas Oberg;Nina Jeliazkova;Nikolay Kochev
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2011年第3期
84.Visual Interpretation of Kernel-Based Prediction Models

机译：基于内核的预测模型的可视化解释
- 作者：Katja Hansen;David Baehrens;Timon Schroeter;Matthias Rupp;Klaus Robert Muller
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2011年第9期
- Kernel-based learning;
- Confidence estimation;
- Domain of applicability;
- QSAR;
- QSPR;
85.Associating Drugs, Targets and Clinical Outcomes into an Integrated Network Affords a New Platform for Computer-Aided Drug Repurposing

机译：将药物，靶标和临床结果关联到一个集成网络中，从而为计算机辅助药物再利用提供一个新平台
- 作者：Tudor I. Oprea;Sonny Kim Nielsen;Oleg Ursu;Jeremy J. Yang;Olivier Taboureau
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2011年第3期
- Drug discovery;
- Drug side effects;
- Drug targets;
- Principal component analysis;
- Text mining;
86.Tree and Hashing Data Structures to Speed up Chemical Searches: Analysis and Experiments

机译：树和哈希数据结构以加快化学搜索：分析和实验
- 作者：Ramzi Nasr;Thomas Kristensen;Pierre Baldi
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2011年第9期
- Drug design;
- Computational chemistry;
- Tree data structures;
- Hashing data structures;
87.Using Spherical Harmonic Surface Property Representations for Ligand-Based Virtual Screening

机译：使用球面谐波表面特性表示法进行基于配体的虚拟筛选
- 作者：Violeta I. Perez Nueno;Vishwesh Venkatraman;Lazaros Mavridis;Tim Clark;David W. Ritchie
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2011年第3期
- Spherical harmonics;
- Consensus properties;
- Genetic algorithm;
- Virtual screening;
- Difficult targets;
- P38;
- FXA;
- PPAR-y;
88.Classification of the Toxicity of Some Organic Compounds to Tadpoles (Rana Temporaria) Through Integrating Multiple Classifiers

机译：通过整合多个分类器，对某些有机化合物对Ta（Rana Temporaria）的毒性分类
- 作者：Qiang Su;Wen cong Lu;Bing Niu;Xu Liu;Tian hong Gu
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2011年第8期
- Majority voting;
- Classification;
- Rana temporaria tadpoles;
- Toxicity;
89.Prediction of Acute Rodent Toxicity on the Basis of Chemical Structure and Physicochemical Similarity

机译：基于化学结构和理化相似性的急性啮齿动物毒性预测
- 作者：O. A. Raevsky;V. Y. Grigorev;E. A. Liplavskaya;A. P. Worth
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2011年第3期
90.Toward an Optimal Approach for Variable Selection In Counter-Propagation Neural Networks: Modeling Protein-Tyroslne KInase Inhibitory of Flavanoids Using Substituent Electronic Descriptors

机译：在反向传播神经网络中寻求变量选择的最佳方法：使用取代基电子描述符对类黄酮的蛋白酪氨酸激酶抑制进行建模
- 作者：Bahrain Hemmateenejad;Ahmadreza Mehdipour;Omar Deeb;l Mahmood Sanchooli;Ramin Miri
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2011年第12期
91.Integration of Ligand- and Target-Based Virtual Screening for the Discovery of Cruzain Inhibitors

机译：基于配体和基于靶标的虚拟筛选的整合，用于发现克鲁赞抑制剂
- 作者：H. J. Wiggers;J. R. Rocha;J. Cheleski;C. A. Montanari
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2011年第7期
- Chagas disease;
- Combined virtual screening;
- Ligand-based methodologies;
- QSAR -Docking;
- SMARTS;
- Similarity search;
- Consensus scoring;
92.Contribution of Non-Canonical Interactions to the Stability of Sm/LSm Oligomeric Assemblies

机译：非规范相互作用对Sm / LSm寡聚组件稳定性的贡献。
- 作者：Srdan O. Stojanovic;Esma R. lsenovic;Bozidarka L Zaric
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2011年第5期
- Computational chemistry;
- Interfaces;
- Noncovalent interactions;
- Proteins;
- Stabilization centers;
93.Docking and Molecular Dynamics Calculations of Pyrrolidlnone Analog IVHV1K16 Bound to COX and LOX Enzymes

机译：吡咯烷酮类似物IVHV1K16与COX和LOX酶结合的对接和分子动力学计算
- 作者：N. Neophytou;G. Leonis;N. Stavrinoudakis;M. Simcic;S. Golic Grdado!nik;E. Papavassilopoulou;G. Michas;P. Moutevelis Minakakis;M. G. Papadopoulos;M. Zing;T. MavromoustakosPresented at the 18th European Symposium on Quantitative Structu.
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2011年第5期
- Pyrrolidinone analogs;
- Drug design;
- Molecular dynamics;
- LOX;
- COX;
94.Modeling Choices for Virtual Screening Hit Identification

机译：虚拟筛选匹配识别的建模选择
- 作者：Charles Bergeron;Michael Krein;Gregory Moore;Curt M. Breneman;Kristin P. Bennett
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2011年第9期
95.Retrospective Mapping of SAR Data for TTR Protein in Chemico-Biological Space Using Ligand Efficiency Indices as a Guide to Drug Discovery Strategies

机译：使用配体效率指数作为药物发现策略的指南，对化学-生物空间中TTR蛋白的SAR数据进行回顾性作图
- 作者：Daniel Blasi;Gemma Arsequell;Gregori Valencia;Joan Nieto;Antoni Planas;Marta Pinto
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2011年第3期
- TTR;
- Amyloid;
- Ligand efficiency indices;
- Chemico-biological space;
96.Deciphering the Structural Requirements of Nucleoside Bisubstrate Analogues for Inhibition of MbtA in Mycobacterium tuberculosis: A FB-QSAR Study and Combinatorial Library Generation for Identifying Potential Hits

机译：鉴定抑制结核分枝杆菌中MbtA的核苷双底物类似物的结构要求：FB-QSAR研究和组合文库的产生，以鉴定潜在的命中
- 作者：Lakshmi Maganti;Sanjit Kumar Das;Nahren Manuel Mascarenhas;Nanda Ghoshal
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2011年第10期
- Combinatorial library;
- FB-QSAR;
- Siderophore;
- Tuberculosis;
97.A Microarray Tool Provides Pathway and GO Term Analysis

机译：微阵列工具提供途径和GO术语分析
- 作者：Martin Koch;Hans Dieter Royer;and Michael Wiese
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2011年第12期
- Bioinformatics;
- Genomics;
- Medicinal chemistry;
98.Bioactive Molecules: Perfectly Shaped for Their Target?

机译：生物活性分子：完美地针对其目标吗？
- 作者：Matthias Wirth;Wolfgang H. B. Sauer
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2011年第8期
- Clustering assessment;
- Drug likeness;
- Molecular shape;
- Multiconformational analysis;
- NPR descriptor;
99.The Importance of Descriptor-Based Clusterization in QSAR Models Development: Tyrosine Kinases Inhibitors as a Key Study

机译：基于描述符的聚类在QSAR模型开发中的重要性：酪氨酸激酶抑制剂为关键研究
- 作者：Giovanni Marzaro;Francesca Tonus;Paola Brun;Ignazio Castagliuolo;Adriano Guiotto
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2011年第8期
- QSAR;
- Clusterization;
- Tyrosine kinase inhibitors;
- Quinazolines;
100.Growth Response of Trichoderma Species to Organic Solvents

机译：木霉菌种对有机溶剂的生长反应
- 作者：Gyula Oros;Zoltan Naar;Tibor Cserhati
- 期刊名称：《Molecular informatics》 | 2011年第3期
- Alkanols;
- Solvents;
- Toxicity;
- Selectivity;
- QSAR;
- Trichoderma;

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