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Journal of Biomedical Semantics

中文名称：生物医学语义学杂志

ISSN：2041-1480
出版周期：-

发文量：316

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1.The Ontology for Parasite Lifecycle (OPL): towards a consistent vocabulary of lifecycle stages in parasitic organisms

机译：寄生虫生命周期的本体论（OPL）：朝着寄生生物生命周期阶段的一致词汇表
- 作者：Priti P Parikh;Jie Zheng;Flora Logan-Klumpler;Christian J Stoeckert;Christos Louis;Pantelis Topalis;Anna V Protasio;Amit P Sheth;Mark Carrington;Matthew Berriman;Satya S Sahoo
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2012年第s1期
2.Unsupervised grammar induction of clinical report sublanguage

机译：临床报告亚语言的无监督语法归纳
- 作者：Rohit J Kate
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2012年第s3期
3.Proposed actions are no actions: re-modeling an ontology design pattern with a realist top-level ontology

机译：提议的行动不是行动：使用现实的顶级本体对本体设计模式进行建模
- 作者：Djamila Seddig-Raufie;Ludger Jansen;Daniel Schober;Martin Boeker;Niels Grewe;Stefan Schulz
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2012年第s2期
4.Literature mining of protein-residue associations with graph rules learned through distant supervision

机译：通过远距离监督学习具有图规则的蛋白质残基关联的文献挖掘
- 作者：KE Ravikumar;Haibin Liu;Judith D Cohn;Michael E Wall;Karin Verspoor
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2012年第s3期
5.Ranking relations between diseases, drugs and genes for a curation task

机译：排序疾病，药物和基因之间的关系以完成管理任务
- 作者：Simon Clematide;Fabio Rinaldi
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2012年第s3期
6.Continuation-like semantics for modeling structural process anomalies

机译：用于模拟结构过程异常的类似连续语义
- 作者：Niels Grewe
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2012年第s2期
7.Analysing Syntactic Regularities and Irregularities in SNOMED-CT

机译：分析SNOMED-CT中的语法规则性和不规则性
- 作者：Eleni Mikroyannidi;Robert Stevens;Luigi Iannone;Alan Rector
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2012年第s1期
8.Towards improving phenotype representation in OWL

机译：致力于改善OWL中的表型表示
- 作者：Frank Loebe;Frank Stumpf;Robert Hoehndorf;Heinrich Herre
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2012年第s2期
9.An ontology-based exploration of the concepts and relationships in the activities and participation component of the international classification of functioning, disability and health

机译：基于本体论的功能，残疾和健康国际分类的活动和参与部分中的概念和关系的探索
- 作者：Vincenzo Della Mea;Andrea Simoncello
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2012年第s1期
10.Ontology representation and analysis of vaccine formulation and administration and their effects on vaccine immune responses

机译：疫苗配制和给药的本体表示和分析及其对疫苗免疫反应的影响
- 作者：Yu Lin;Yongqun He
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2012年第s1期
11.Topics in machine learning for biomedical literature analysis and text retrieval

机译：机器学习中用于生物医学文献分析和文本检索的主题
- 作者：Rezarta Islamaj Do?an;Lana Yeganova
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2012年第s3期
12.OpenTox predictive toxicology framework: toxicological ontology and semantic media wiki-based OpenToxipedia

机译：OpenTox预测毒理学框架：毒理学本体论和基于Wiki的语义媒体OpenToxipedia
- 作者：Olga Tcheremenskaia;Romualdo Benigni;Ivelina Nikolova;Nina Jeliazkova;Sylvia E Escher;Monika Batke;Thomas Baier;Vladimir Poroikov;Alexey Lagunin;Micha Rautenberg;Barry Hardy
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2012年第s1期
13.Selected papers from the 14th Annual Bio-Ontologies Special Interest Group Meeting

机译：第十四届年度生物本体论特别兴趣小组会议的论文精选
- 作者：Larisa N Soldatova;Susanna-Assunta Sansone;Michel Dumontier;Nigam H Shah
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2012年第s1期
14.Applying semantic web technologies for phenome-wide scan using an electronic health record linked Biobank

机译：将语义网络技术应用于使用电子病历链接的生物库进行全基因组扫描
- 作者：Jyotishman Pathak;Richard C Kiefer;Suzette J Bielinski;Christopher G Chute
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2012年第s1期
15.Annotation analysis for testing drug safety signals using unstructured clinical notes

机译：使用非结构化临床注释对药物安全性信号进行测试的注释分析
- 作者：Paea LePendu;Srinivasan V Iyer;Cédrick Fairon;Nigam H Shah
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2012年第s1期
16.Profiling structured product labeling with NDF-RT and RxNorm

机译：使用NDF-RT和RxNorm对结构化产品标签进行性能分析
- 作者：Qian Zhu;Guoqian Jiang;Christopher G Chute
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2012年第s1期
17.Open semantic annotation of scientific publications using DOMEO

机译：使用DOMEO对科学出版物进行开放式语义注释
- 作者：Paolo Ciccarese;Marco Ocana;Tim Clark
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2012年第s1期
18.Extraction of potential adverse drug events from medical case reports

机译：从医疗案例报告中提取潜在的不良药物事件
- 作者：Harsha Gurulingappa;Abdul Mateen‐Rajput;Luca Toldo
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2012年第s1期
19.Why functions are not special dispositions: an improved classification of realizables for top-level ontologies

机译：为什么功能不是特殊的配置：针对顶级本体的实现的改进分类
- 作者：Johannes R?hl;Ludger Jansen
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2014年第s1期
20.Annotation of phenotypic diversity: decoupling data curation and ontology curation using Phenex

机译：表型多样性注释：使用Phenex解耦数据策展和本体策展
- 作者：James P Balhoff;Wasila M Dahdul;T Alexander Dececchi;Hilmar Lapp;Paula M Mabee;Todd J Vision
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2014年第s1期
21.Variation ontology: annotator guide

机译：变体本体：注释器指南
- 作者：Mauno Vihinen
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2014年第s1期
22.The epidemiology ontology: an ontology for the semantic annotation of epidemiological resources

机译：流行病学本体论：流行病学资源语义标注的本体论
- 作者：Catia Pesquita;Jo?o D Ferreira;Francisco M Couto;Mário J Silva
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2014年第s1期
23.The pathway ontology – updates and applications

机译：路径本体–更新和应用
- 作者：Victoria Petri;Pushkala Jayaraman;Marek Tutaj;G Thomas Hayman;Jennifer R Smith;Jeff De Pons;Stanley JF Laulederkind;Timothy F Lowry;Rajni Nigam;Shur-Jen Wang;Mary Shimoyama;Melinda R Dwinell;Diane H Munzenmaier;Elizabeth A Worthey;Howard J J
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2014年第s1期
24.BioHackathon series in 2011 and 2012: penetration of ontology and linked data in life science domains

机译：2011年和2012年的BioHackathon系列：生命科学领域中的本体论和关联数据的渗透
- 作者：Toshiaki Katayama;Mark D Wilkinson;Kiyoko F Aoki-Kinoshita;Shuichi Kawashima;Yasunori Yamamoto;Atsuko Yamaguchi;Shinobu Okamoto;Shin Kawano;Jin-Dong Kim;Yue Wang;Hongyan Wu;Yoshinobu Kano;Hiromasa Ono;Hidemasa Bono;Simon Kocbek;Jan Aerts;Y
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2014年第s1期
25.OAE: The Ontology of Adverse Events

机译：OAE：不良事件的本体论
- 作者：Yongqun He;Sirarat Sarntivijai;Yu Lin;Zuoshuang Xiang;Abra Guo;Shelley Zhang;Desikan Jagannathan;Luca Toldo;Cui Tao;Barry Smith
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2014年第s1期
26.Automated reasoning using abduction for interpretation of medical signals

机译：使用绑架自动推理以解释医学信号
- 作者：Marjan Alirezaie;Amy Loutfi
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2014年第s1期
27.Comparative analysis of knowledge representation and reasoning requirements across a range of life sciences textbooks

机译：各种生命科学教科书中知识表示和推理要求的比较分析
- 作者：Vinay K Chaudhri;Daniel Elenius;Andrew Goldenkranz;Allison Gong;Maryann E Martone;William Webb;Neil Yorke-Smith
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2014年第s1期
28.Evolving BioAssay Ontology (BAO): modularization, integration and applications

机译：不断发展的生物测定本体论（BAO）：模块化，集成和应用
- 作者：Saminda Abeyruwan;Uma D Vempati;Hande Kü?ük-McGinty;Ubbo Visser;Amar Koleti;Ahsan Mir;Kunie Sakurai;Caty Chung;Joshua A Bittker;Paul A Clemons;Steve Brudz;Anosha Siripala;Arturo J Morales;Martin Romacker;David Twomey;Svetlana Bureeva;Vance Lemmon;Stephan C Schürer
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2014年第s1期
29.Semantic interestingness measures for discovering association rules in the skeletal dysplasia domain

机译：在骨骼发育不良域中发现关联规则的语义趣味性度量
- 作者：Razan Paul;Tudor Groza;Jane Hunter;Andreas Zankl
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2014年第s1期
30.BioBenchmark Toyama 2012: an evaluation of the performance of triple stores on biological data

机译：富山BioBenchmark 2012：根据生物学数据评估三重存储的性能
- 作者：Hongyan Wu;Toyofumi Fujiwara;Yasunori Yamamoto;Jerven Bolleman;Atsuko Yamaguchi
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2014年第s1期
31.The Porifera Ontology (PORO): enhancing sponge systematics with an anatomy ontology

机译：Porifera本体论（PORO）：通过解剖本体论增强海绵系统性
- 作者：Robert W Thacker;Maria Cristina Díaz;Adeline Kerner;Régine Vignes-Lebbe;Erik Segerdell;Melissa A Haendel;Christopher J Mungall
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2014年第s1期
32.The influence of disease categories on gene candidate predictions from model organism phenotypes

机译：疾病类别对模型生物表型的基因候选者预测的影响
- 作者：Anika Oellrich;Sebastian Koehler;Nicole Washington;Chris Mungall;Suzanna Lewis;Melissa Haendel;Peter N Robinson;Damian Smedley;Sanger Mouse Genetic Project
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2014年第s1期
33.Thematic series on biomedical ontologies in JBMS: challenges and new directions

机译：JBMS中的生物医学本体论专题系列：挑战和新方向
- 作者：Robert Hoehndorf;Melissa Haendel;Robert Stevens;Dietrich Rebholz-Schuhmann
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2014年第s1期
34.Panacea, a semantic-enabled drug recommendations discovery framework

机译：Panacea，一种启用语义的药物推荐发现框架
- 作者：Charalampos Doulaverakis;George Nikolaidis;Athanasios Kleontas;Ioannis Kompatsiaris
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2014年第s1期
35.Mining characteristics of epidemiological studies from Medline: a case study in obesity

机译：Medline流行病学研究的挖掘特征：以肥胖症为例
- 作者：George Karystianis;Iain Buchan;Goran Nenadic
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2014年第s1期
36.Executing SADI services in Galaxy

机译：在Galaxy中执行SADI服务
- 作者：Mikel Ega?a Aranguren;Alejandro Rodríguez González;Mark D Wilkinson
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2014年第s1期
37.SEE: structured representation of scientific evidence in the biomedical domain using Semantic Web techniques

机译：SEE：使用语义网技术在生物医学领域对科学证据进行结构化表示
- 作者：Christian B?lling;Michael Weidlich;Hermann-Georg Holzhütter
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2014年第s1期
38.Exploring adverse drug events at the class level

机译：在班级探索不良药物事件
- 作者：Rainer Winnenburg;Alfred Sorbello;Olivier Bodenreider
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2015年第s1期
39.Section level search functionality in Europe PMC

机译：欧洲PMC中的板块级搜索功能
- 作者：?enay Kafkas;Xingjun Pi;Nikos Marinos;Francesco Talo’;Andrew Morrison;Johanna R McEntyre
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2015年第s1期
40.Ontology-based representation and analysis of host-Brucella interactions

机译：基于本体的宿主与小球藻相互作用的表示和分析
- 作者：Yu Lin;Zuoshuang Xiang;Yongqun He
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2015年第s1期
41.Concept selection for phenotypes and diseases using learn to rank

机译：使用学习排名对表型和疾病进行概念选择
- 作者：Nigel Collier;Anika Oellrich;Tudor Groza
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2015年第s1期
42.Supporting the annotation of chronic obstructive pulmonary disease (COPD) phenotypes with text mining workflows

机译：通过文本挖掘工作流支持注释慢性阻塞性肺疾病（COPD）表型
- 作者：Xiao Fu;Riza Batista-Navarro;Rafal Rak;Sophia Ananiadou
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2015年第s1期
43.Development and application of an interaction network ontology for literature mining of vaccine-associated gene-gene interactions

机译：疫苗相关基因-基因相互作用文献挖掘的相互作用网络本体的开发与应用
- 作者：Junguk Hur;Arzucan ?zgür;Zuoshuang Xiang;Yongqun He
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2015年第s1期
44.Implementation of linked data in the life sciences at BioHackathon 2011

机译：在BioHackathon 2011上生命科学中链接数据的实现
- 作者：Kiyoko F Aoki-Kinoshita;Akira R Kinjo;Mizuki Morita;Yoshinobu Igarashi;Yi-an Chen;Yasumasa Shigemoto;Takatomo Fujisawa;Yukie Akune;Takeo Katoda;Anna Kokubu;Takaaki Mori;Mitsuteru Nakao;Shuichi Kawashima;Shinobu Okamoto;Toshiaki Katayama;Soi
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2015年第s1期
45.Developing VISO: Vaccine Information Statement Ontology for patient education

机译：开发VISO：用于患者教育的疫苗信息声明本体
- 作者：Muhammad Amith;Yang Gong;Rachel Cunningham;Julie Boom;Cui Tao
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2015年第s1期
46.Nanopublications for exposing experimental data in the life-sciences: a Huntington’s Disease case study

机译：纳米出版物公开了生命科学中的实验数据：亨廷顿氏病案例研究
- 作者：Eleni Mina;Mark Thompson;Rajaram Kaliyaperumal;Jun Zhao;van Eelke der Horst;Zuotian Tatum;Kristina M Hettne;Erik A Schultes;Barend Mons;Marco Roos
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2015年第s1期
47.Development and validation of a classification approach for extracting severity automatically from electronic health records

机译：开发和验证用于从电子健康记录中自动提取严重性的分类方法
- 作者：Mary Regina Boland;Nicholas P Tatonetti;George Hripcsak
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2015年第s1期
48.Capturing domain knowledge from multiple sources: the rare bone disorders use case

机译：从多个来源获取领域知识：罕见的骨骼疾病用例
- 作者：Tudor Groza;Tania Tudorache;Peter N Robinson;Andreas Zankl
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2015年第s1期
49.Evaluating drug-drug interaction information in NDF-RT and DrugBank

机译：在NDF-RT和DrugBank中评估药物相互作用信息
- 作者：Lee B Peters;Nathan Bahr;Olivier Bodenreider
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2015年第s1期
50.Region Evolution eXplorer – A tool for discovering evolution trends in ontology regions

机译：Region Evolution eXplorer –用于发现本体区域演化趋势的工具
- 作者：Victor Christen;Michael Hartung;Anika Gro?
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2015年第s1期
51.Ontorat: automatic generation of new ontology terms, annotations, and axioms based on ontology design patterns

机译：Ontorat：基于本体设计模式自动生成新的本体术语，注释和公理
- 作者：Zuoshuang Xiang;Jie Zheng;Yu Lin;Yongqun He
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2015年第s1期
52.Annotation-based feature extraction from sets of SBML models

机译：从SBML模型集中提取基于注释的特征
- 作者：Rebekka Alm;Dagmar Waltemath;Markus Wolfien;Olaf Wolkenhauer;Ron Henkel
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2015年第s1期
53.Expanding the mammalian phenotype ontology to support automated exchange of high throughput mouse phenotyping data generated by large-scale mouse knockout screens

机译：扩展哺乳动物表型本体，以支持自动交换由大规模小鼠基因敲除屏幕产生的高通量小鼠表型数据
- 作者：Cynthia L Smith;Janan T Eppig
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2015年第s1期
54.Ambiguity and variability of database and software names in bioinformatics

机译：生物信息学中数据库和软件名称的歧义性和可变性
- 作者：Geraint Duck;Aleksandar Kovacevic;David L. Robertson;Robert Stevens;Goran Nenadic
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2015年第s1期
55.Evaluating a variety of text-mined features for automatic protein function prediction with GOstruct

机译：评估多种文本挖掘功能，以使用GOstruct进行蛋白质功能自动预测
- 作者：Christopher S Funk;Indika Kahanda;Asa Ben-Hur;Karin M Verspoor
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2015年第s1期
56.Completing the is-a structure in light-weight ontologies

机译：完成轻量级本体中的is-a结构
- 作者：Patrick Lambrix;Fang Wei-Kleiner;Zlatan Dragisic
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2015年第s1期
57.owlcpp: a C++ library for working with OWL ontologies

机译：owlcpp：一个用于处理OWL本体的C ++库
- 作者：Mikhail K. Levin;Lindsay G. Cowell
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2015年第s1期
58.Formalizing biomedical concepts from textual definitions

机译：从文本定义形式化生物医学概念
- 作者：Alina Petrova;Yue Ma;George Tsatsaronis;Maria Kissa;Felix Distel;Franz Baader;Michael Schroeder
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2015年第s1期
59.Development of an Ontology for Periodontitis

机译：牙周炎本体论的发展
- 作者：Asami Suzuki;Takako Takai-Igarashi;Jun Nakaya;Hiroshi Tanaka
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2015年第s1期
60.Using description logics to evaluate the consistency of drug-class membership relations in NDF-RT

机译：使用描述逻辑评估NDF-RT中药物类别成员关系的一致性
- 作者：Rainer Winnenburg;Jonathan M Mortensen;Olivier Bodenreider
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2015年第s1期
61.Semantic enrichment of longitudinal clinical study data using the CDISC standards and the semantic statistics vocabularies

机译：使用CDISC标准和语义统计词汇对纵向临床研究数据进行语义丰富
- 作者：Hugo Leroux;Laurent Lefort
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2015年第s1期
62.A framework for ontology-based question answering with application to parasite immunology

机译：基于本体的问题解答框架及其在寄生虫免疫学中的应用
- 作者：Amir H. Asiaee;Todd Minning;Prashant Doshi;Rick L. Tarleton
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2015年第s1期
63.Linking gene expression to phenotypes via pathway information

机译：通过途径信息将基因表达与表型联系起来
- 作者：Irene Papatheodorou;Anika Oellrich;Damian Smedley
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2015年第s1期
64.Sequential pattern mining for discovering gene interactions and their contextual information from biomedical texts

机译：顺序模式挖掘，用于从生物医学文本中发现基因相互作用及其上下文信息
- 作者：Peggy Cellier;Thierry Charnois;Marc Plantevit;Christophe Rigotti;Bruno Crémilleux;Olivier Gandrillon;Ji?í Kléma;Jean-Luc Manguin
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2015年第s1期
65.Discovering relations between indirectly connected biomedical concepts

机译：发现间接关联的生物医学概念之间的关系
- 作者：Dirk Weissenborn;Michael Schroeder;George Tsatsaronis
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2015年第1期
66.Database citation in supplementary data linked to Europe PubMed Central full text biomedical articles

机译：与欧洲PubMed Central全文生物医学文章相关的补充数据中的数据库引用
- 作者：?enay Kafkas;Jee-Hyub Kim;Xingjun Pi;Johanna R McEntyre
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2015年第1期
67.KneeTex: an ontology–driven system for information extraction from MRI reports

机译：KneeTex：一种由本体驱动的系统，用于从MRI报告中提取信息
- 作者：Irena Spasi?;Bo Zhao;Christopher B Jones;Kate Button
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2015年第1期
68.Networks of neuroinjury semantic predications to identify biomarkers for mild traumatic brain injury

机译：神经损伤语义预测网络，以识别轻度脑外伤的生物标志物
- 作者：Michael J Cairelli;Marcelo Fiszman;Han Zhang;Thomas C Rindflesch
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2015年第1期
69.GO2PUB: Querying PubMed with semantic expansion of gene ontology terms

机译：GO2PUB：使用基因本体术语的语义扩展来查询PubMed
- 作者：Charles Bettembourg;Christian Diot;Anita Burgun;Olivier Dameron
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2012年第s1期
70.Towards valid and reusable reference alignments — ten basic quality checks for ontology alignments and their application to three different reference data sets

机译：迈向有效和可重用的参考比对-本体比对及其对三个不同参考数据集的十项基本质量检查
- 作者：Elena Beisswanger;Udo Hahn
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2012年第s1期
71.Logical Gene Ontology Annotations (GOAL): exploring gene ontology annotations with OWL

机译：逻辑基因本体注释（GOAL）：使用OWL探索基因本体注释
- 作者：Simon Jupp;Robert Stevens;Robert Hoehndorf
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2012年第s1期
72.OntoCheck: verifying ontology naming conventions and metadata completeness in Protégé 4

机译：OntoCheck：在Protégé4中验证本体命名约定和元数据完整性
- 作者：Daniel Schober;Ilinca Tudose;Vojtech Svatek;Martin Boeker
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2012年第s2期
73.Towards an ontological representation of morbidity and mortality in Description Logics

机译：走向描述逻辑中发病率和死亡率的本体表示
- 作者：Filipe Santana;Fred Freitas;Roberta Fernandes;Zulma Medeiros;Daniel Schober
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2012年第s2期
74.Ontology-based time information representation of vaccine adverse events in VAERS for temporal analysis

机译：基于本体的时间信息表示VAERS中疫苗不良事件的时间分析
- 作者：Cui Tao;Yongqun He;Hannah Yang;Gregory A Poland;Christopher G Chute
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2012年第s1期
75.Thematic clustering of text documents using an EM-based approach

机译：使用基于EM的方法对文本文档进行主题聚类
- 作者：Sun Kim;W John Wilbur
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2012年第s3期
76.Identification of fever and vaccine-associated gene interaction networks using ontology-based literature mining

机译：使用基于本体的文献挖掘识别发烧和疫苗相关的基因相互作用网络
- 作者：Junguk Hur;Arzucan ?zgür;Zuoshuang Xiang;Yongqun He
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2012年第s1期
77.Functional tissue units and their primary tissue motifs in multi-scale physiology

机译：多尺度生理学中的功能组织单位及其主要组织基序
- 作者：Bernard de Bono;Pierre Grenon;Richard Baldock;Peter Hunter
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2013年第s1期
78.Monitoring named entity recognition: the League Table

机译：监视命名实体的识别：排行榜
- 作者：Dietrich Rebholz-Schuhmann;Senay Kafkas;Jee-Hyub Kim;Antonio Jimeno Yepes;Ian Lewin
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2013年第s1期
79.Biotea: RDFizing PubMed Central in support for the paper as an interface to the Web of Data

机译：Biotea：RDFizing PubMed Central以支持该论文作为Web到Web的接口
- 作者：L J Garcia Castro;C McLaughlin;A Garcia
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2013年第s1期
80.The Gene Ontology (GO) Cellular Component Ontology: integration with SAO (Subcellular Anatomy Ontology) and other recent developments

机译：基因本体论（GO）细胞成分本体论：与SAO（亚细胞解剖学本体论）和其他近期发展的整合
- 作者：Paola Roncaglia;Maryann E Martone;David P Hill;Tanya Z Berardini;Rebecca E Foulger;Fahim T Imam;Harold Drabkin;Christopher J Mungall;Jane Lomax
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2013年第s1期
81.Automatically transforming pre- to post-composed phenotypes: EQ-lising HPO and MP

机译：自动将合成表型转化为合成表型：EQ-lising HPO和MP
- 作者：Anika Oellrich;Christoph Grabmüller;Dietrich Rebholz-Schuhmann
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2013年第s1期
82.Pooling annotated corpora for clinical concept extraction

机译：合并带注释的语料库以提取临床概念
- 作者：Kavishwar B Wagholikar;Manabu Torii;Siddhartha R Jonnalagadda;Hongfang Liu
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2013年第s1期
83.Ontology of physics for biology: representing physical dependencies as a basis for biological processes

机译：生物学的本体论：代表物理依存关系作为生物学过程的基础
- 作者：Daniel L Cook;Maxwell L Neal;Fred L Bookstein;John H Gennari
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2013年第s1期
84.Representing annotation compositionality and provenance for the Semantic Web

机译：表示语义网的注释组成和出处
- 作者：Kevin M Livingston;Michael Bada;Lawrence E Hunter;Karin Verspoor
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2013年第s1期
85.BioUSeR: a semantic-based tool for retrieving Life Science web resources driven by text-rich user requirements

机译：BioUSeR：一种基于语义的工具，用于检索由文本丰富的用户需求驱动的生命科学网络资源
- 作者：María Pérez;Rafael Berlanga;Ismael Sanz;María José Aramburu
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2013年第s1期
86.EMAP/EMAPA ontology of mouse developmental anatomy: 2013 update

机译：小鼠发育解剖学的EMAP / EMAPA本体：2013年更新
- 作者：Terry F Hayamizu;Michael N Wicks;Duncan R Davidson;Albert Burger;Martin Ringwald;Richard A Baldock
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2013年第s1期
87.Using ontologies to study cell transitions

机译：使用本体来研究细胞转化
- 作者：Georg Fuellen;Ludger Jansen;Ulf Leser;Andreas Kurtz
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2013年第s1期
88.Rat Strain Ontology: structured controlled vocabulary designed to facilitate access to strain data at RGD

机译：大鼠应变本体：结构化受控词汇表，旨在促进在RGD中访问应变数据
- 作者：Rajni Nigam;Diane H Munzenmaier;Elizabeth A Worthey;Melinda R Dwinell;Mary Shimoyama;Howard J Jacob
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2013年第s1期
89.A task-based approach for Gene Ontology evaluation

机译：基于任务的基因本体评估方法
- 作者：Erik L Clarke;Salvatore Loguercio;Benjamin M Good;Andrew I Su
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2013年第s1期
90.The Drosophila phenotype ontology

机译：果蝇表型本体
- 作者：David Osumi-Sutherland;Steven J Marygold;Gillian H Millburn;Peter A McQuilton;Laura Ponting;Raymund Stefancsik;Kathleen Falls;Nicholas H Brown;Georgios V Gkoutos
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2013年第s1期
91.The Vertebrate Trait Ontology: a controlled vocabulary for the annotation of trait data across species

机译：脊椎动物性状本体论：用于注释跨物种特征数据的受控词汇表
- 作者：Carissa A Park;Susan M Bello;Cynthia L Smith;Zhi-Liang Hu;Diane H Munzenmaier;Rajni Nigam;Jennifer R Smith;Mary Shimoyama;Janan T Eppig;James M Reecy
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2013年第s1期
92.MAPI: a software framework for distributed biomedical applications

机译：MAPI：用于分布式生物医学应用程序的软件框架
- 作者：Johan Karlsson;Oswaldo Trelles
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2013年第s1期
93.The environment ontology: contextualising biological and biomedical entities

机译：环境本体论：生物和生物医学实体的环境化
- 作者：Pier Luigi Buttigieg;Norman Morrison;Barry Smith;Christopher J Mungall;Suzanna E Lewis;the ENVO Consortium
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2013年第s1期
94.Evaluating gold standard corpora against gene/protein tagging solutions and lexical resources

机译：针对基因/蛋白质标签解决方案和词汇资源评估黄金标准语料库
- 作者：Dietrich Rebholz-Schuhmann;Senay Kafkas;Jee-Hyub Kim;Chen Li;Antonio Jimeno Yepes;Robert Hoehndorf;Rolf Backofen;Ian Lewin
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2013年第s1期
95.OWL model of clinical trial eligibility criteria compatible with partially-known information

机译：与部分已知信息兼容的临床试验资格标准的OWL模型
- 作者：Olivier Dameron;Paolo Besana;Oussama Zekri;Annabel Bourdé;Anita Burgun;Marc Cuggia
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2013年第s1期
96.PAV ontology: provenance, authoring and versioning

机译：PAV本体：出处，创作和版本控制
- 作者：Paolo Ciccarese;Stian Soiland-Reyes;Khalid Belhajjame;Alasdair JG Gray;Carole Goble;Tim Clark
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2013年第s1期
97.Introducing glycomics data into the Semantic Web

机译：将糖组学数据引入语义网
- 作者：Kiyoko F Aoki-Kinoshita;Jerven Bolleman;Matthew P Campbell;Shin Kawano;Jin-Dong Kim;Thomas Lütteke;Masaaki Matsubara;Shujiro Okuda;Rene Ranzinger;Hiromichi Sawaki0;Toshihide Shikanai0;Daisuke Shinmachi0;Yoshinori Suzuki0;Philip Toukach;Issak
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2013年第s1期
98.OPPL-Galaxy, a Galaxy tool for enhancing ontology exploitation as part of bioinformatics workflows

机译：OPPL-Galaxy，这是一种作为生物信息学工作流程的一部分，用于增强本体开发的Galaxy工具
- 作者：Mikel Ega?a Aranguren;Jesualdo Tomás Fernández-Breis;Chris Mungall;Erick Antezana;Alejandro Rodríguez González;Mark D Wilkinson
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2013年第s1期
99.Developing a semantically rich ontology for the biobank-administration domain

机译：为生物库管理领域开发语义丰富的本体
- 作者：Mathias Brochhausen;Martin N Fransson;Nitin V Kanaskar;Mikael Eriksson;Roxana Merino-Martinez;Roger A Hall;Loreana Norlin;Sanela Kjellqvist;Maria Hortlund;Umit Topaloglu;William R Hogan;Jan-Eric Litton
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2013年第s1期
100.The mouse pathology ontology, MPATH; structure and applications

机译：小鼠病理学本体，MPATH;结构与应用
- 作者：Paul N Schofield;John P Sundberg;Beth A Sundberg;Colin McKerlie;Georgios V Gkoutos
- 期刊名称：《Journal of Biomedical Semantics》 | 2013年第s1期

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