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【24h】

Development of a Multiplex PCR Assay for Concurrent Detection of Clavibacter michiganensis ssp. michiganemis and Xanthomonas axonopodis pv. vesicatoria

机译：同时检测密歇根杆状菌属的多重PCR检测方法的开发。 michiganemis和Xanthomonas axonopodis pv。 vesicatoria

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In this study, concurrent amplification of X. axonopodis pv. vesicatoria and C. michiganensis ssp. michiganensis with primer pairs RST2-RST3 and CMM-5-CMM-6 was investigated by multiplex PCR. Reported CMM-5-CMM-6 and RST2-RST3 primer pairs were used to amplify template DNAs of Clavibacter michiganensis ssp. michiganensis and Xanthomonas axonopodis pv. vesicatoria, respectively. To optimize multiplex PCR reaction conditions; annealing temperature was determined by gradient PCR and primer concentrations for each primer pair were tested. Primer concentration ratios of 0.2 and 0.4 mu M in final concentration for RST2-RST3 and CMM-5-CMM-6 primer pairs were found to be optimal for multiplex PCR reactions, respectively. Gradient PCR, in single and multiplex PCR reactions has shown that annealing temperatures 58.5-59.5°C were optimal for RST2-RST3 and CMM-5-CMM-6 primer pairs for multiplex PCR.
机译：在这项研究中，同时扩增X. axonopodis pv。 vesicatoria和C.michiganensis ssp。通过多重PCR研究了具有引物对RST2-RST3和CMM-5-CMM-6的密歇根州。报道的CMM-5-CMM-6和RST2-RST3引物对用于扩增密歇根氏杆菌属ssp的模板DNA。密歇根州和轴生黄单胞菌PV。 vesicatoria，分别。优化多重PCR反应条件;通过梯度PCR确定退火温度，并测试每个引物对的引物浓度。发现对于RST2-RST3和CMM-5-CMM-6引物对，终浓度为0.2和0.4μM的引物浓度比分别对于多重PCR反应是最佳的。在单次和多重PCR反应中的梯度PCR显示，对于多重PCR，RST2-RST3和CMM-5-CMM-6引物对的退火温度最佳为58.5-59.5°C。

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