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Genome-specific higher-order background models to improve motif detection

机译：基因组特定的高阶背景模型可改善基序检测

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Motif detection based on Gibbs sampling is a common procedure used to retrieve regulatory motifs in silico. Using a species-specific background model was previously shown to increase the robustness of the algorithm. Here, we demonstrate that selecting a non-species-adapted background model can have an adverse effect on the results of motif detection. The large differences in the average nucleotide composition of prokaryotic sequences exacerbate the problem of exchanging background models. Therefore, we have developed complex background models for all prokaryotic species with available genome sequences.
机译：基于Gibbs采样的图案检测是一种常用的程序，可用于检索计算机模拟的调控基序。先前显示使用特定于物种的背景模型可以提高算法的鲁棒性。在这里，我们证明选择一个非物种适应的背景模型可以对图案检测的结果产生不利影响。原核序列的平均核苷酸组成上的巨大差异加剧了交换背景模型的问题。因此，我们已经开发了具有可用基因组序列的所有原核物种的复杂背景模型。

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