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Availability of Genotypic Data for USDA-ARS National Plant Germplasm System Accessions Using the Genetic Resources Information Network (GRIN) Database.

机译:使用遗传资源信息网络(GRIN)数据库获取USDA-ARS国家植物种质系统登录的基因型数据。

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摘要

The USDA-ARS National Plant Germplasm System (NPGS) provides critical genetic resources to researchers and breeders worldwide. Users of the NPGS materials need access to data for genetic and descriptive characteristics of the plant materials. New tables and codes have been added to the Germplasm Resources Information Network (GRIN) database to hold raw data relating to molecular markers and alleles. The revised tables accommodate multiple marker types; provide raw data for individuals; accept polyploid data; and provide a record of methods, standards, and control values. A long-term goal is to make the GRIN molecular tables fully interoperable with the National Center for Biotechnology Information database as well as bioinformatic databases (model organism and clade organism databases). The development of this capacity provides critical data infrastructure for future genotype-phenotype association studies and gene discovery.
机译:USDA-ARS国家植物种质系统(NPGS)为全球研究人员和育种者提供了重要的遗传资源。 NPGS材料的用户需要访问有关植物材料的遗传和描述特性的数据。新表和代码已添加到种质资源信息网络(GRIN)数据库中,以保存与分子标记和等位基因有关的原始数据。修改后的表格可容纳多种标记类型;为个人提供原始数据;接受多倍体数据;并提供方法,标准和控制值的记录。一个长期目标是使GRIN分子表与国家生物技术信息中心数据库以及生物信息数据库(模型生物和进化枝生物数据库)完全可互操作。这种能力的发展为将来的基因型-表型关联研究和基因发现提供了关键的数据基础设施。

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