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首页> 外文期刊>Journal of Biomolecular Structure and Dynamics >Distamycin-stabilized antiparallel-parallel combination (APC) DNA.
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Distamycin-stabilized antiparallel-parallel combination (APC) DNA.

机译：双霉素稳定的反平行-平行组合（APC）DNA。

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The formation of Antiparallel-Parallel-Combination (APC) DNA, a liner duplex with a segment of parallel-stranded (ps) helix flanked by conventional B-DNA, was tested with a number of synthetic oligonucleotides. The groove-binding ligand distamycin A (DstA) was used to stabilize the ps segment comprising five A x T base pairs. Two drug molecules bound per APC, one in each of the two equivalent grooves characteristic of ps-DNA. APC-DNA, reference molecules and their complexes with DstA were analysed by several methods: circular dichroism and absorption spectroscopy, thermal denaturation, chemical modification, and molecular modeling. The dye binding stoichiometry differed significantly due to inherent structural differences in the groove geometries of ps-DNA (trans base pairs, similar grooves) and conventional antiparallel-stranded (aps) B-DNA (cis base pairs, distinct major and minor grooves). The data support the existence of APC folding in solution.
机译：用许多合成的寡核苷酸测试了反平行-平行结合（APC）DNA的形成，该DNA是带有一段平行链（ps）螺旋，两侧是常规B-DNA的衬里双链体。凹槽结合配体双棉霉素A（DstA）用于稳定包含五个A x T碱基对的ps片段。每个APC结合了两个药物分子，分别是ps-DNA的两个等效凹槽中的一个。 APC-DNA，参考分子及其与DstA的配合物通过几种方法进行了分析：圆二色性和吸收光谱，热变性，化学修饰和分子建模。由于ps-DNA的凹槽几何结构中的固有结构差异（反式碱基对，相似的凹槽）和常规的反平行链（aps）B-DNA（顺式碱基对，不同的主要和次要凹槽），染料结合的化学计量存在显着差异。数据支持解决方案中APC折叠的存在。

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