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Journal of Biomolecular Structure and Dynamics

Journal of Biomolecular Structure and Dynamics

SCIMEDLINECA

中文名称：生物分子结构与动力学杂志

ISSN：0739-1102
出版周期：Bimonthly

发文量：2076

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1.Classifying the properties of life.

机译：分类生活的属性。
- 作者：Macagno F
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第4期
2.Trifonov's meta-definition of life.

机译：Trifonov对生活的元定义。
- 作者：Di Mauro E
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第4期
3.Thermodynamic inversion and self-reproduction with variations: integrated view on the life-nonlife border.

机译：热力学反演和自我复制以及变化：关于生命与非生命边界的综合观点。
- 作者：Kompanichenko VN
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第4期
4.Molecular modeling study for conformational changes of Sirtuin 2 due to substrate and inhibitor binding

机译：底物和抑制剂结合导致Sirtuin 2构象变化的分子模型研究
- 作者：SakkiahS.;ChandrasekaranM.;LeeY.;KimS.;LeeK.W.
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第3期
- Electrostatic potential;
- GROMACS;
- LigandFit;
- Molecular docking;
- Molecular dynamics simulation;
- Sirtinol;
- Sirtuin;
5.Importance of V3 Loop Flexibility and Net Charge in the Context of Co-Receptor Recognition. A Molecular Dynamics Study on HIV gp120.

机译：在共受体识别的背景下，V3回路灵活性和净电荷的重要性。 HIV gp120的分子动力学研究。
- 作者：B Chandramouli;G Chillemi;I Abbate;M R Capobianchi;G Rozera;A Desideri
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第5期
6.The molecular origin of the MMR-dependent apoptosis pathway from dynamics analysis of MutSα-DNA complexes

机译：MutSα-DNA复合物动力学分析的MMR依赖性细胞凋亡途径的分子起源
- 作者：NegureanuL.;SalsburyJr.F.R.
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第3期
7.Conformational changes in the DNA-binding domains of the ecdysteroid receptor during the formation of a complex with the hsp27 response element

机译：与hsp27反应元件形成复合物时蜕皮甾类受体DNA结合结构域的构象变化
- 作者：Paku?aS.;Or?owskiM.;RymarczykG.;KrusińskiT.;JakóbM.;ZoglowekA.;OzyharA.;DobryszyckiP.
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第4期
- Conformational change;
- DHR38;
- DNA bending;
- EcR;
- FRET;
- Intein;
- Nuclear receptor;
- Usp;
8.HELANAL-Plus: a web server for analysis of helix geometry in protein structures.

机译：HELANAL-Plus：用于分析蛋白质结构中螺旋几何形状的Web服务器。
- 作者：Prasun Kumar;Manju Bansal
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第6期
9.The definition of life and the life of a definition.

机译：生活的定义和生活的定义。
- 作者：Neuman Y
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第4期
10.Interactions of calmodulin with death-associated protein kinase peptides: Experimental and modeling studies

机译：钙调蛋白与死亡相关的蛋白激酶肽的相互作用：实验和模型研究
- 作者：KuczeraK.;KursulaP.
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第1期
- Calmodulin;
- Calmodulin-peptide interactions;
- Calorimetry;
- Death-associated protein kinase;
- Free energy simulations;
11.Molecular modelling of the mass density of single proteins

机译：单个蛋白质质量密度的分子模型
- 作者：HuttM.;KulschewskiT.;PleissJ.
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第3期
- Amino acid composition;
- Flexibility;
- Molecular dynamics (MD) simulation;
- Thermal expansion coefficient;
- Thermostability;
12.Isotherm of ligand adsorption on DNA at multiplicative noise

机译：乘性噪声下DNA上配体吸附的等温线
- 作者：ArakelyanV.;HarutyunyanS.;AndriasyanV.;ArakelyanH.
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第2期
- Adsorption;
- DNA;
- Isotherm;
- Ligand;
- Noise;
13.Novel aryl β-aminocarbonyl derivatives as inhibitors of Trypanosoma cruzi trypanothione reductase: Binding mode revised by docking and GRIND2-based 3D-QSAR procedures

机译：新颖的芳基β-氨基羰基衍生物作为克氏锥虫锥虫硫醚还原酶的抑制剂：结合模式通过对接和基于GRIND2的3D-QSAR程序进行了修订
- 作者：DaSilvaC.H.T.D.P.;BernardesL.S.C.;DaSilvaV.B.;ZaniC.L.;CarvalhoI.
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第6期
- 3D-QSAR;
- Chagas disease;
- Docking;
- GRIND-2;
- Trypanosoma cruzi trypanothione reductase;
14.Orderly order in protein intrinsic disorder distribution: Disorder in 3500 proteomes from viruses and the three domains of life

机译：蛋白质内在失调分布中的有序排列：3500种蛋白质组因病毒和生命的三个域而紊乱
- 作者：XueB.;DunkerA.K.;UverskyV.N.
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第2期
- Archaea;
- Bacteria;
- Eukaryotes;
- Evolution;
- Intrinsic disorder;
- Prokaryotes;
- Proteome complexity;
- Viruses;
15.Three-in-one agonists for PPAR-α, PPAR-γ, and PPAR-δ from traditional Chinese medicine.

机译：中药对PPAR-α，PPAR-γ和PPAR-δ的三合一激动剂。
- 作者：Kuan-Chung Chen;Su-Sen Chang;Hung-Jin Huang;Tu-Liang Lin;Yong-Jiang Wu;Calvin Yu-Chian Chen
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第6期
16.Influence of serum proteins on conformation of prostate-specific antigen.

机译：血清蛋白对前列腺特异性抗原构象的影响。
- 作者：O Fedotoff;L M Mikheeva;A Chait;V N Uversky;B Y Zaslavsky
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第5期
17.Alijanianzadeh, M.a , Saboury, A.A.a , Ganjali, M.R.b , Hadi-Alijanvanda, H.a , Moosavi-Movahedia, A.A.a Inhibition of mushroom tyrosinase by a newly synthesized ligand: Inhibition kinetics and computational simulations

机译：Alijanianzadeh，M.a，Saboury，A.A.a，Ganjali，M.R.b，Hadi-Alijanvanda，H.a，Moosavi-Movahedia，A.A.a新合成的配体对蘑菇酪氨酸酶的抑制作用：抑制动力学和计算模拟
- 作者：AlijanianzadehM.;SabouryA.A.;GanjaliM.R.;Hadi-AlijanvandaH.;Moosavi-MovahediaA.A.
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第4期
- Catecholase;
- Cresolase;
- Inhibition;
- Mushroom tyrosinase;
18.Traditional Chinese medicine as dual guardians against hypertension and cancer?

机译：中医可以作为对抗高血压和癌症的双重监护人吗？
- 作者：TouW.I.;ChenC.Y.-C.
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第3期
- Cancer;
- Docking;
- Molecular dynamics (MD);
- QSAR;
- Src;
- Traditional chinese medicine (TCM);
19.Superhelical DNA as a preferential binding target of 14-3-3γ protein

机译：超螺旋DNA作为14-3-3γ蛋白的优先结合靶标
- 作者：BrázdaV.;?echováJ.;CoufalJ.;RumpelS.;JagelskáE.B.
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第4期
- 14-3-3 Proteins;
- DNA binding;
- Protein-DNA complex;
- Superhelical DNA;
20.An integrated study of tyrosinase inhibition by rutin: progress using a computational simulation.

机译：芦丁对酪氨酸酶抑制作用的综合研究：使用计算模拟的进展。
- 作者：Y-X Si;S-J Yin;S Oh;Z-J Wang;S Ye;L Yan;J-M Yang;Y-D Park;J Lee;G-Y Qian
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第5期
21.Molecular modeling of formate dehydrogenase: The formation of the Michaelis complex

机译：甲酸脱氢酶的分子模型：Michaelis复合物的形成
- 作者：NilovD.K.;ShabalinI.G.;PopovV.O.;?vedasV.K.
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第2期
22.A short review on the structure-function relationship of artificial catecholase/tyrosinase and nuclease activities of Cu-complexes.

机译：铜络合物的人工儿茶酚酶/酪氨酸酶与核酸酶活性的结构-功能关系简述。
- 作者：Reza Silavi;Adeleh Divsalar;Ali Akbar Saboury
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第6期
23.Attempts to define life do not help to understand the origin of life.

机译：试图定义生活无助于理解生活的起源。
- 作者：Szostak JW
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第4期
24.Dynamics of arginase gene evolution in metazoans

机译：后生动物精氨酸酶基因进化的动力学
- 作者：CaoJ.;ShiF.
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第4期
- Arginase;
- Evolution dynamics;
- Selective pressure;
25.Life?

机译：生活？
- 作者：Mishra S
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第4期
26.Mechanism of BAG1 repair on Parkinson's disease-linked DJ1 mutation

机译：BAG1修复对帕金森病相关DJ1突变的机制
- 作者：ChenC.Y.-C.
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第1期
- BAG1;
- Molecular dynamics;
- Parkinson's disease;
- Protein repair;
- Protein-protein interaction;
27.Ultrafast electron transfer in the recognition of different DNA sequences by a DNA-binding protein with different dynamical conformations

机译：通过具有不同动态构象的DNA结合蛋白识别不同DNA序列的超快电子传递
- 作者：MondolT.;BatabyalS.;PalS.K.
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第3期
- λ-repressor;
- Different dynamical conformations;
- Operator DNA;
- Photoinduced electron transfer;
- TCSPC;
28.Dynamic and Structural Changes in the Minimally Restructuring EcoRI Bound to a Minimally Mutated DNA Chain.

机译：动态和结构的变化在最小重组EcoRI绑定到最小突变的DNA链。
- 作者：Ramakrishnan V;Jagannathan S;Shaikh AR;Rajagopalan R
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第4期
29.Dissecting structural basis of the unique substrate selectivity of human enteropeptidase catalytic subunit

机译：解剖人肠肽酶催化亚基独特底物选择性的结构基础
- 作者：OstapchenkoV.G.;GasparianM.E.;KosinskyY.A.;EfremovR.G.;DolgikhD.A.;KirpichnikovM.P.
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第1期
- Active site;
- Enteropeptidase;
- Enzymatic catalysis;
- Molecular modeling;
- Substrate selectivity;
30.Definition by means of indefiniteness.

机译：通过不确定性进行定义。
- 作者：Zhuravlev YN
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第4期
31.Analysis of Delta-Notch interaction by molecular modeling and molecular dynamic simulation studies

机译：通过分子建模和分子动力学模拟研究分析Delta-Notch相互作用
- 作者：MajumderR.;RoyS.;ThakurA.R.
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第1期
- Delta;
- Drosophila;
- Homology modeling;
- MD simulation;
- Notch;
- Protein-protein docking;
32.Using principal component analysis and support vector machine to predict protein structural class for low-similarity sequences via PSSM

机译：使用主成分分析和支持向量机通过PSSM预测低相似序列的蛋白质结构类别
- 作者：ZhangS.;YeF.;YuanX.
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第6期
- Principal component analysis;
- Protein structural class;
- PSSM;
- Support vector machine;
- Transition probability matrix;
33.Can DNA-binding proteins of replisome tautomerize nucleotide bases? Ab initio model study

机译：复制体互变异构体的DNA结合蛋白可以使核苷酸碱基吗？从头算模型研究
- 作者：BrovaretsO.O.;YurenkoY.P.;DubeyI.Ya.;HovorunD.M.
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第6期
- Ab initio study;
- Dynamical instability;
- Mutagenic tautomers of DNA bases;
- Point mutations;
- Proton transfer;
- Replisome proteins;
34.Recognition rules for binding of homeodomains to operator DNA.

机译：同源域与操纵子DNA结合的识别规则。
- 作者：Chirgadze YN;Sivozhelezov VS;Polozov RV;Stepanenko VA;Ivanov VV
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第4期
35.Inhibition of protein-protein interaction of HER2-EGFR and HER2-HER3 by a rationally designed peptidomimetic

机译：通过合理设计的拟肽抑制HER2-EGFR和HER2-HER3的蛋白质相互作用
- 作者：BanappagariS.;CortiM.;PincusS.;SatyanarayanajoisS.
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第5期
- EGFR;
- HER2;
- Homology modeling;
- Pathhunter assay;
- Peptidomimetic;
- Protein-protein interactions;
- Surface plasmon resonance;
36.First principles calculations of thermodynamics and kinetic parameters and molecular dynamics simulations of acetylcholinesterase reactivators: Can mouse data provide new insights into humans?

机译：乙酰胆碱酯酶激活剂的热力学和动力学参数的第一性原理计算以及分子动力学模拟：小鼠数据能否为人类提供新的见解？
- 作者：MatosK.S.;DaCunhaE.F.F.;DaSilvaGon?alvesA.;WilterA.;Ku?aK.;Fran?aT.C.C.;RamalhoT.C.
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第5期
- Acetylcholinesterase;
- Chemical mechanism of reactivation;
- Neurotoxic agents;
- QM/MM;
37.Structural dynamics of full-length retroviral integrase: A molecular dynamics analysis

机译：全长逆转录病毒整合酶的结构动力学：分子动力学分析
- 作者：BalasubramanianS.;RajagopalanM.;RamaswamyA.
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第6期
- C-loop;
- DynDom;
- Full-length integrase;
- Full-length integrase dimer;
- Molecular dynamics simulation;
38.Coexistence of G-quadruplex and duplex domains within the secondary structure of 31-mer DNA thrombin-binding aptamer

机译：31-mer DNA凝血酶结合适体二级结构中G-四链体和双链体结构域的共存
- 作者：DolinnayaN.G.;YuminovaA.V.;SpiridonovaV.A.;ArutyunyanA.M.;KopylovA.M.
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第5期
- Circular dichroism;
- G-quadruplex structure;
- Noncanonical DNA;
- Thrombin-binding aptamer;
- Uv melting;
39.Copper(I)-alkyl sulfide and -cysteine tri-nuclear clusters as models for metallo proteins: a structural density functional analysis.

机译：铜（I）-烷基硫化物和-半胱氨酸三核簇作为金属蛋白的模型：结构密度泛函分析。
- 作者：Gabriella Tamasi;Stefano Mangani;Renzo Cini
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第6期
40.Insights into the thermal stabilization and conformational transitions of DNA by hyperthermophile protein Sso7d: molecular dynamics simulations and MM-PBSA analysis.

机译：通过嗜热菌蛋白Sso7d洞察DNA的热稳定性和构象转变：分子动力学模拟和MM-PBSA分析。
- 作者：Lin Chen;Qing-Chuan Zheng;Li-Ying Yu;Wen-Ting Chu;Ji-Long Zhang;Qiao Xue;Hong-Xing Zhang;Chia-Chung Sun
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第6期
41.In silico Investigation of the Disease-Associated Retinoschisin C110Y and C219G Mutants.

机译：与疾病相关的视黄醛毒素C110Y和C219G突变体的计算机研究。
- 作者：J W Wu;H-L Liu
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第5期
42.Role of hydrophobic core on the thermal stability of proteins - molecular dynamics simulations on a single point mutant of sso7d abstract.

机译：疏水核心对蛋白质热稳定性的作用-sso7d摘要的单点突变体的分子动力学模拟。
- 作者：U D Priyakumar
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第5期
43.Structural dynamics of double-helical RNAs composed of CUG/CUG- and CUG/CGG-repeats

机译：由CUG / CUG-和CUG / CGG重复组成的双螺旋RNA的结构动力学
- 作者：TamjarJ.;KatorchaE.;PopovA.;MalininaL.
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第5期
44.A minimal or concise set of definition of life is not useful.

机译：最小或简洁的生活定义集是没有用的。
- 作者：Tang BL
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第4期
45.Permeation pathway of homomeric connexin 26 and connexin 30 channels investigated by molecular dynamics.

机译：通过分子动力学研究同质连接蛋白26和连接蛋白30通道的渗透途径。
- 作者：F Zonta;G Polles;G Zanotti;F Mammano
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第5期
46.Merits and caveats of using a vocabulary approach to define life.

机译：使用词汇定义生活的优点和警告。
- 作者：Popa R
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第4期
47.Short review: Protein structure prediction: Challenging targets for CASP10

机译：简短评论：蛋白质结构预测：CASP10的挑战性目标
- 作者：RunthalaA.
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第5期
- Alignment;
- Assessment;
- BLAST;
- CASP;
- PDB;
- Refinement;
- Template;
48.Network models reveal stability and structural rearrangement of signal recognition particle

机译：网络模型揭示了信号识别粒子的稳定性和结构重排
- 作者：ChangS.;HeH.-Q.;HuJ.-P.;JiaoX.;TianX.-H.
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第2期
- Anisotropic network model;
- Gaussian network model;
- RNA;
- Signal recognition particle;
- Structural rearrangement;
49.Cold shock domain protein from Philosamia ricini prefers single-stranded nucleic acids binding

机译：来自Philosamia ricini的冷休克域蛋白更倾向于单链核酸结合
- 作者：ManiA.;YadavaP.K.;GuptaD.K.
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第5期
- Cold-shock domain;
- Philosamia ricini;
- Y-box proteins;
50.An insight into the origin and functional evolution of bacterial aromatic ring-hydroxylating oxygenases

机译：深入了解细菌芳香环羟化加氧酶的起源和功能进化
- 作者：ChakrabortyJ.;GhosalD.;DuttaA.;DuttaT.K.
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第4期
- Biodegradation;
- Dioxygenase;
- Evolution;
- Iron-sulfur protein;
- Rieske protein;
51.Peculiarities of copper binding to alpha-synuclein.

机译：铜结合到α-突触核蛋白的特性。
- 作者：Ahmad A;Burns CS;Fink AL;Uversky VN
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第4期
52.Probing the interaction of human serum albumin with bilirubin in the presence of aspirin by multi-spectroscopic, molecular modeling and zeta potential techniques: insight on binary and ternary systems.

机译：通过多光谱，分子建模和ζ电位技术探讨在阿司匹林存在下人血清白蛋白与胆红素的相互作用：对二元和三元系统的见解。
- 作者：A Hosainzadeh;M Gharanfoli;M R Saberi;J K Chamani
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第5期
53.Molecular dynamics of anthraquinone DNA intercalators with polyethylene glycol side chains.

机译：带有聚乙二醇侧链的蒽醌DNA嵌入剂的分子动力学。
- 作者：S J Beckford;D W Dixon
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第5期
54.Mechanistic insights into the dual inhibition strategy for checking leishmaniasis

机译：对利什曼病检查双重抑制策略的机理见解
- 作者：GroveraA.;KatiyarS.P.;JeyakanthanJ.;DubeyV.K.;SundarD.
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第4期
- Dual inhibition;
- Leishmania donovani;
- Leishmaniasis;
- Molecular dynamics;
- Molecular modeling;
- Ornithine decarboxylase;
- Spermidine synthase;
55.Predicting protein oxidation sites with feature selection and analysis approach

机译：通过特征选择和分析方法预测蛋白质氧化位点
- 作者：NiuS.;HuL.-L.;ZhengL.-L.;HuangT.;FengK.-Y.;CaiY.-D.;LiH.-P.;LiY.-X.;ChouK.-C.
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第6期
56.The complexity of life: can life be simply defined?

机译：生活的复杂性：可以简单定义生活吗？
- 作者：Yeong FM
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第4期
57.Insights into protein - DNA interactions, stability and allosteric communications: a computational study of mutSalpha-DNA recognition complexes.

机译：深入了解蛋白质-DNA相互作用，稳定性和变构通讯：mutSalpha-DNA识别复合物的计算研究。
- 作者：Negureanu L;Salsbury FR
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第4期
58.The DMRT gene family in amphioxus

机译：两栖动物中的DMRT基因家族
- 作者：WangF.;YuY.;JiD.;LiH.
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第2期
- Amphioxus;
- DMRT genes;
- Evolution;
- Sex determination;
59.Characterization of Aβ aggregation mechanism probed by congo red

机译：刚果红探测Aβ聚集机制的表征
- 作者：WangC.-C.;HuangH.-B.;TsayH.-J.;ShiaoM.-S.;WuW.-J.W.;ChengY.-C.;LinT.-H.
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第2期
- β-amyloid peptide;
- Congo red;
- Discordant helix;
- Nuclear magnetic resonance;
60.In silico study of structural determinants modulating the redox potential of Rigidoporus lignosus and other fungal laccases

机译：在计算机上研究结构决定因素调节木僵菌和其他真菌漆酶的氧化还原电位
- 作者：CambriaM.T.;GullottoD.;GaravagliaS.;CambriaA.
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第1期
- Laccase;
- Redox potential;
- Rigidoporus lignosus;
- Structural determinants;
61.Life in its uniqueness remains difficult to define in scientific terms.

机译：生命的独特性仍然很难用科学的术语来定义。
- 作者：Meierhenrich UJ
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第4期
62.Conformational analysis of GT1B ganglioside and its interaction with botulinum neurotoxin type B: A study by molecular modeling and molecular dynamics

机译：GT1B神经节苷脂的构象分析及其与B型肉毒杆菌神经毒素的相互作用：分子模型和分子动力学研究
- 作者：VenkateshwariS.;VelurajaK.
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第3期
- BoNT/B;
- Conformation;
- Gangliosides;
- Glycosidic linkage;
- GT1B;
63.SPINE-D: Accurate Prediction of Short and Long Disordered Regions by a Single Neural-Network Based Method.

机译：SPINE-D：通过基于单个神经网络的方法准确预测短和长混乱区域。
- 作者：Zhang T;Faraggi E;Xue B;Dunker AK;Uversky VN;Zhou Y
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第4期
64.Fast Mapping of Biomolecular Interfaces by Random Spin Labeling (RSL).

机译：通过随机自旋标记（RSL）快速映射生物分子界面。
- 作者：Hartl MJ;Burmann BM;Prasch SJ;Schwarzinger C;Schweimer K;Wohrl BM;Rosch P;Schwarzinger S
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第4期
65.Comparative structural analysis of two proteins belonging to quorum sensing system in Vibrio cholerae

机译：霍乱弧菌群体感应系统中两种蛋白质的比较结构分析
- 作者：HussainM.;FazilT.;KumarS.;RaoN.S.;SelvarajC.;SinghS.K.;PandeyH.P.;SinghD.V.
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第5期
- Drug targets;
- Molecular dynamics;
- Protein modeling;
- Two component signaling system;
- Vibrio cholerae;
66.Structural phylogenomics uncovers the early and concurrent origins of cysteine biosynthesis and iron-sulfur proteins

机译：结构系统基因组学揭示了半胱氨酸生物合成和铁硫蛋白的早期和并行起源
- 作者：ZhangH.-Y.;QinT.;JiangY.-Y.;Caetano-AnollésG.
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第5期
- Cysteine biosynthesis;
- Evolution;
- Iron-sulfur proteins;
- Molecular clock;
- Protein structure;
67.BetaSuperposer: superposition of protein surfaces using beta-shapes.

机译：BetaSuperposer：使用beta形状叠加蛋白质表面。
- 作者：Jae-Kwan Kim;Deok-Soo Kim
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第6期
68.Phylogenetic study of SIVcpz MT145 virus based on proteome and genome analysis

机译：基于蛋白质组和基因组分析的SIVcpz MT145病毒系统发生研究
- 作者：SoleimaniP.;BarzegarA.;MovafeghiA.
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第3期
- HIV;
- Mega5;
- MT145;
- Phylogeny;
- SIV;
69.The effect of fucoidan on tyrosinase: Computational molecular dynamics integrating inhibition kinetics

机译：岩藻依聚糖对酪氨酸酶的影响：结合抑制动力学的计算分子动力学
- 作者：WangZ.-J.;SiY.-X.;OhS.;YangJ.-M.;YinS.-J.;ParkY.-D.;LeebJ.;QianG.-Y.
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第4期
- Docking simulation;
- Fucoidan;
- Inhibition kinetics;
- Molecular dynamics simulation;
- Tyrosinase;
70.Fanali, G.a , Ascenzi, P.b , Bernardi, G.b , Fasano, M.a Sequence analysis of serum albumins reveals the molecular evolution of ligand recognition properties

机译：Fanali，G.a，Ascenzi，P.b，Bernardi，G.b，Fasano，M.a血清白蛋白的序列分析揭示了配体识别特性的分子进化
- 作者：FanaliG.;AscenziP.;BernardiG.;FasanoM.
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第6期
- Albumin;
- Allostery;
- Ligand binding;
- Molecular evolution;
- Structural evolution;
71.NS2B/NS3 protease: allosteric effect of mutations associated with the pathogenicity of tick-borne encephalitis virus.

机译：NS2B / NS3蛋白酶：与tick传脑炎病毒的致病性相关的突变的变构作用。
- 作者：Ulyana V Potapova;Sergey I Feranchuk;Vladimir V Potapov;Nina V Kulakova;Ilya G Kondratov;Galina N Leonova;Sergey I Belikov
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第6期
72.The extracellular subunit interface of the 5-HT 3 receptors: A computational alanine scanning mutagenesis study

机译：5-HT 3受体的细胞外亚基界面：计算丙氨酸扫描诱变研究
- 作者：DeRienzoF.;MouraBarbosaA.J.;PerezM.A.S.;FernandesP.A.;RamosM.J.;MenzianiM.C.
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第3期
- 5-HT 3 receptors;
- Agonists;
- Antagonists;
- Computational alanine scanning mutagenesis;
- Interface;
- Molecular dynamics simulations;
73.Steered molecular dynamics simulations on the binding of the appendant structure and helix-β2 in domain-swapped human cystatin C dimer.

机译：在结构域交换的人胱抑素C二聚体中，附加结构与螺旋β2结合的分子动力学模拟研究。
- 作者：Manli Shen;Jing Guan;Linan Xu;Yuanyuan Yu;Jianwei He;Gary W Jones;Youtao Song
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第6期
74.Structure and reorientational dynamics of angiotensin I and II: A microscopic physical insight

机译：血管紧张素I和II的结构和重新定向动力学：微观物理见解
- 作者：DeLeonK.Y.;PatelA.P.;KuczeraK.;JohnsonC.K.;JasG.S.
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第6期
- Angiotensin;
- Anisotropy decay;
- Circular dichroism;
- FTIR;
- Molecular dynamics;
- Reorientational dynamics;
75.Defining life: an exercise in semantics or a route to biological insights?

机译：定义生活：进行语义练习还是获得生物学见解的途径？
- 作者：Koonin EV
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第4期
76.Accurate prediction of protein structural classes using functional domains and predicted secondary structure sequences

机译：使用功能域和预测的二级结构序列准确预测蛋白质结构类别
- 作者：AdlA.A.;Nowzari-DaliniA.;XueB.;UverskyV.N.;QianX.
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第6期
77.Definition of life: navigation through uncertainties.

机译：生活的定义：穿越不确定性。
- 作者：Trifonov EN
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第4期
78.Life: self-directing with unlimited variability on self-speeding.

机译：寿命：自我指导，自我加速具有无限的可变性。
- 作者：Ma W
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第4期
79.SS-Stabilizing Proteins Rationally: Intrinsic Disorder-Based Design of Stabilizing Disulphide Bridges in GFP.

机译：合理地稳定SS的蛋白质：稳定GFP中的二硫键的基于内在疾病的设计。
- 作者：Melnik BS;Povarnitsyna TV;Glukhov AS;Melnik TN;Uversky VN
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第4期
80.Is A n+1 definition of life useful?

机译：生命的n + 1定义有用吗？
- 作者：Tessera M
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第4期
81.The roles of intrinsic disorder in orchestrating the wnt-pathway.

机译：内在障碍在协调wnt途径中的作用。
- 作者：B Xue;A K Dunker;V N Uversky
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第5期
82.Molecular Dynamics Simulations on Pars Intercerebralis Major Peptide-C (PMP-C) Reveal the Role of Glycosylation and Disulfide Bonds in its Enhanced Structural Stability and Function.

机译：Pars脑内主要肽C（PMP-C）的分子动力学模拟揭示了糖基化和二硫键在增强的结构稳定性和功能中的作用。
- 作者：S Kaushik;D Mohanty;A Surolia
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第5期
83.Life = self-reproduction with variations?

机译：生命=自我复制与变化？
- 作者：Hansma HG
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第4期
84.Interpreting the structural mechanism of action for MT7 and human muscarinic acetylcholine receptor 1 complex by modeling protein-protein interaction

机译：通过模拟蛋白质-蛋白质相互作用来解释MT7和人毒蕈碱型乙酰胆碱受体1复合物的作用机制
- 作者：XuJ.;ChenH.
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第1期
- Molecular dynamics simulations;
- Muscarinic acetylcholine receptor;
- Muscarinic toxin;
- Protein-protein docking;
85.Modelling and Bioinformatics Analysis of the Dimeric Structure of House Dust Mite Allergens from Families 5 and 21: Der f 5 Could Dimerize as Der p 5.

机译：来自家庭5和21的屋尘螨过敏原二聚体结构的建模和生物信息学分析：Der f 5可以二聚为Der p 5。
- 作者：Khemili S;Kwasigroch JM;Hamadouche T;Gilis D
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第4期
86.Predicting nucleosome positions in yeast: using the absolute frequency.

机译：使用绝对频率预测酵母中的核小体位置。
- 作者：Z Zhang;Y Zhang;I Gutman
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第5期
87.Identification of the Structural Features that Mediate Binding Specificity in the Recognition of STAT Proteins by Dual-Specificity Phosphatases.

机译：鉴定介导结合特异性的双特异性磷酸酶介导结合特异性的结构特征。
- 作者：Jardin C;Salsbury FR
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第4期
88.Substitution of asparagine 76 by a tyrosine residue induces domain swapping in Helicobacter pylori phosphopantetheine adenylyltransferase

机译：酪氨酸残基取代天冬酰胺76引起幽门螺杆菌磷酸泛素腺苷酸转移酶中的结构域交换
- 作者：ChengC.-S.;ChenW.-T.;ChenY.-W.;ChenC.-H.;LuoY.-C.;LyuP.-C.;YinH.-S.
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第4期
- Coenzyme A;
- Dinucleotide-binding fold;
- Domain swapping;
- Helicobacter pylori;
- Phosphopantetheine adenylyltransferase;
89.Appendant structure plays an important role in amyloidogenic cystatin dimerization prior to domain swapping

机译：附加结构在结构域交换之前在淀粉样蛋白半胱氨酸蛋白酶抑制剂二聚作用中起重要作用
- 作者：YuA.;LiuX.;HeJ.;ZhangM.;LiH.;WeiD.;SongY.
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第1期
- Amyloidosis;
- Appendant structure;
- Domain swapping;
- Hydrophobic core;
- Molecular dynamic simulation;
90.Molecular Dynamics of HIV1-Integrase in Complex with 93del - A Structural Perspective on the Mechanism of Inhibition.

机译：HIV 1-整合酶与93 del配合物的分子动力学-抑制机理的结构性观点。
- 作者：M Sgobba;O Olubiyi;S Ke;S Haider
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第5期
91.Mechanism of the activation step of the aminoacylation reaction: a significant difference between class I and class II synthetases.

机译：氨基酰化反应激活步骤的机制：I类和II类合成酶之间的显着差异。
- 作者：Sindrila Dutta Banik;Nilashis Nandi
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第6期
92.Elucidating the structural and conformational factors responsible for the activity and substrate specificity of alkanesulfonate monooxygenase

机译：阐明负责链烷磺酸单加氧酶活性和底物特异性的结构和构象因素
- 作者：FerrarioV.;BraiucaP.;TessaroP.;KnapicL.;GruberC.;PleissJ.;EbertC.;EichhornE.;GardossiL.
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第1期
- 3D-QSAR;
- Alkanesulfonate monooxygenase;
- Molecular dynamic simulation;
- Substrate specificity;
93.Self-generated and reproducible dynamics in 'gene years' represent life.

机译：“基因年”中的自我产生和可再现的动力学代表着生命。
- 作者：Mittal A
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第4期
94.Oxidative damage to DNA constituents by iron-mediated Fenton reactions: The deoxyadenosine family

机译：铁介导的Fenton反应对DNA成分的氧化损伤：脱氧腺苷家族
- 作者：ChattopadhyayaR.;GoswamiB.
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第4期
- Deoxyadenosine;
- DNA damage;
- Fenton reaction;
95.Potential human cholesterol esterase inhibitor design: benefits from the molecular dynamics simulations and pharmacophore modeling studies.

机译：潜在的人类胆固醇酯酶抑制剂设计：得益于分子动力学模拟和药效团建模研究。
- 作者：S John;S Thangapandian;K W Lee
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第5期
96.Origin and evolution of genes and genomes. Crucial role of triplet expansions

机译：基因和基因组的起源和进化。三重态扩张的关键作用
- 作者：FrenkelZ.M.;TrifonovE.N.
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第2期
- Codon usage;
- Gene evolution;
- Repeats;
- Triplet expansion;
97.Structural insight into the mechanism of epothilone A bound to beta-tubulin and its mutants at Arg282Gln and Thr274Ile

机译：埃博霉素A绑定到β-微管蛋白及其突变体Arg282Gln和Thr274Ile的机制的结构见解。
- 作者：ShiG.;WangY.;JinY.;ChiS.;ShiQ.;GeM.;WangS.;ZhangX.;XuS.
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第5期
- Active pocket;
- DFT;
- EpoA;
- MD simulation;
- Mechanism;
- Taxol;
- Tubulin;
98.Molecular modeling studies on nucleoside hydrolase from the biological warfare agent Brucella suis

机译：生物战剂猪布鲁氏菌核苷水解酶的分子模型研究
- 作者：ManciniD.T.;MatosK.S.;DaCunhaE.F.F.;AssisT.M.;Guimar?esA.P.;Fran?aT.C.C.;RamalhoT.C.
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第1期
- Brucella suis;
- Docking;
- Homology modeling;
- Molecular dynamics;
- Nucleoside hydrolase;
99.On the misgivings of anthropomorphic consensus polling in defining the complexity of life.

机译：关于拟人化共识投票在定义生活复杂性方面的疑虑。
- 作者：Egel R
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第4期
100.A rigid network of long-range contacts increases thermostability in a mutant endoglucanase.

机译：远程接触的刚性网络增加了突变内切葡聚糖酶的热稳定性。
- 作者：A J Rader;Ragothaman M Yennamalli;Andrew K Harter;Taner Z Sen
- 期刊名称：《Journal of Biomolecular Structure and Dynamics》 | 2012年第6期

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