Optimized convergence for multiple histogram analysis

Bereau T.; Swendsen R.H.

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Optimized convergence for multiple histogram analysis

机译：针对多个直方图分析的优化收敛

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We propose a new algorithm for solving the weighted histogram analysis method (WHAM) equations to estimate free energies out of a set of Monte Carlo (MC) or molecular dynamics (MD) simulations. The algorithm, based on free-energy differences, provides a more natural way of approaching the problem and improves convergence compared to the widely used direct iteration method. We also study how parameters (temperature, pressure, etc.) of the independent simulations should be chosen to optimize the accuracy of the set of free energies.

机译：我们提出了一种新的算法，用于解决加权直方图分析方法（WHAM）方程，以从一组蒙特卡罗（MC）或分子动力学（MD）模拟中估算自由能。与广泛使用的直接迭代方法相比，该算法基于自由能差异，提供了一种更自然的方法来解决该问题并提高了收敛性。我们还研究了应如何选择独立模拟的参数（温度，压力等），以优化自由能集的精度。

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来源
《Journal of Computational Physics》 |2009年第17期|共11页
作者
Bereau T.; Swendsen R.H.;
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作者单位

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收录信息
原文格式 PDF
正文语种 eng
中图分类数学物理方法;
关键词
Free-energy calculation; Multiple histogram analysis; WHAM;

机译：自由能计算;多个直方图分析;WHAM;

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