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シス配列予測ツールCOMETの開発：大規模な塩基配列情報と遺伝子発現情報に基づく 高精度探索手法

机译：顺式序列预测工具COMET的开发：基于大规模碱基序列信息和基因表达信息的高精度搜索方法

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遺伝子発現を制御するシス因子配列（シス 配列;)の同定は，発現制御機構や遺伝子機能の 解明，遺伝子の高度利用化を促進する.ここ で，発現プロフアイルが類似する遺伝子群は， 共通の発現制御機構に支配される可能性が高 レ、.このことから，シス配列を同定するための アプローチとして，遺伝子発現プロファイル が類似する遺伝子群の網羅的な分類と，それ ら遺伝子群が共有するゲノム上の塩基配列モ チーフ（モチーフ配列）の探索が有効である. 近年，多くの植物種において，高速シーケン サ一から得たゲノム配列情報と遺伝子発現情 報が蓄積しており，シス配列の高精度'網羅的 な探索が可能となってきている.しかし，従来のモチーフ配列探索ッ一ル(MEMEなど）で は,大規模な配列情報解析を実施できない.ま た，解析対象遺伝子群に特異的に存在するシ ス配列を効率的に同定できないなどの問題が ある.そこで，本研究では，大規模な配列情報 からシス配列を迅速、高精度に探索し得る ッ一ルCOMETf(COre Motif Exploration Jool) を開発した.
机译：识别控制基因表达的顺式因子序列（cis sequence;）有助于阐明表达控制机制和基因功能，并促进基因的先进利用，在这里，具有相似表达谱的基因组是常见的。它很可能受到表达控制机制的控制，因此，作为一种识别顺式序列的方法，共有具有相似基因表达谱并被基因共享的基因的全面分类。寻找基因组上的碱基序列基序（基序）是有效的，近年来，从高速序列获得的基因组序列信息和基因表达信息已经在许多植物物种中积累，并且顺式序列已经积累。高精度的穷举搜索成为可能，但是，常规的基序搜索工具（MEME等）无法进行大规模的序列信息分析，此外，还需要分析基因组。由于存在无法有效识别特定的现有系统序列等问题，因此，在本研究中，我们可以从大规模序列信息中快速，高精度地搜索顺式序列。开发了Jool。

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