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計算機シミュレーションを利用した代謝デザイン技術効率的に基質から目的物質に変換するための代謝経路の改変

机译:使用计算机模拟的代谢设计技术修改代谢途径,可有效地从底物转化为目标物质

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摘要

今日,燃料アルコールやアミノ酸,プラスチック原 料,医薬品に至るまで,さまざまな有用物質が生物の代 謝を利用して生産されている.このような代謝を利用し た有用物質生産の課題の一つは,基質から目的物質へ変 換収率を向上させることである.ゲノム解析が飛躍的に 進展し,利用可能な代謝経路の情報が充実している現 在,これらの情報をもとに合理的に代謝経路を改変する ことが望まれている.収率を向上させるための効果的な 方法は,目的物質の生産に不要な反応を欠失することで ある力5,代謝は多段階の酵素反応からなる複雑な経路で あり,補酵素の生産と消費の収支も考慮する必要がある ため,どの反応を遮断すれば効率的に基質を目的物質に 変換できるかは容易に判断できない.どの反応を欠失す ればよいか網羅的に探索するには計算機の力を活用する 方法がある.本稿では代謝経路モデルを利用したシミュ レーシヨンに基づく代謝デザィン手法を紹介する.
机译:如今,各种各样的有用物质,例如燃料乙醇,氨基酸,塑料原料和药物都是利用生物体的成本生产的,这是利用这种新陈代谢生产有用物质的挑战之一。目的是提高从底物到目标物质的转化率,基因组分析取得了巨大进展,有关可利用的代谢途径的信息十分丰富,因此基于这些信息是合理的。希望以积极的方式改变代谢途径,提高产量的有效途径是消除生产目标物质所不需要的反应5,并且代谢过程是多步的。由于这是一个复杂的途径,由酶促反应组成,并且有必要考虑辅酶的产生和消耗之间的平衡,因此很难确定应该阻断哪种反应以有效地将底物转化为目标物质。有一种利用计算机功能全面搜索是否应删除反应的方法,本文介绍了一种基于新陈代谢途径模型的基于模拟的新陈代谢设计方法。

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