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結核集団感染の分子疫学的解析におけるArbitrarily Primed PCR(AP-PCR)法の有用性

机译:任意引物PCR(AP-PCR)方法在结核病暴发的分子流行病学分析中的用途

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摘要

我々は,結核集団感染疑い事例の分子疫学的調査のため,IS6110を用いたRFLP法による結核菌型別検査を行っている.今回は,都内で発生した事例を対優に,より迅速に型別可能なAP-PCR法による解析を同時に実施し,両法の性能を比較し,分子疫学的解析における本法の有用性について検討した.1999~2002年の4年間に,東京都内で発生し結核の集団感染が疑われた5事例由来の分離菌株について,RFLP法ならびにAP-PCR法で型別検査を行い,両者のパターン解析結果を比較した.このうち,2事例は病院での事例,その他は事業所の新入社員研修施設,公民館での社会活動,家庭内での家族と友人関係が疑われる事例が1事例ずつである.このうち4事例でRFLP法とAP-PCR法で事例毎にパターンが一致し,それぞれ集団感染であることが確認された.残る1事例では両法ともにすべての菌株が異なるパターンであった.これらの結果から両法とも型別検査に有用であることが確認された.RFLP法では,パターンの違いが明瞭に判定できるのに対して,AP-PCR法では多数の共通バンドの中に何本の異なるバンドがあるか慎重に判別する必要がある.一方,RFLP法ではμg単位のDNAが必要であるのに対して,AP-PCR法ではng単位で検査できるため,培養の早い時期でも解析が可能であり,迅速に結果が得られる利点がある.両法を検査の必要性に応じて使い分けることが考えられた.
机译:我们正在使用RFLP方法(使用IS6110)进行结核病类型特异性测试,以对疑似结核病暴发病例进行分子流行病学调查。这次,我们将使用AP-PCR方法分析东京发生的病例,该方法可以更快地键入,同时比较两种方法的性能,并讨论该方法在分子流行病学分析中的有用性。调查。从1999年至2002年,通过RFLP方法和AP-PCR方法对源自东京发生的5例疑似结核病暴发的分离株进行了类型测试,并获得了两者的模式分析结果。我们比较了。其中,有两起是在医院的案件,另一起是怀疑在营业场所的新员工培训设施,公共礼堂的社交活动以及在家中的亲友关系的案件。其中,RFLP方法和AP-PCR方法在4例中均与每种模式匹配,证实它们是暴发。在剩下的一种情况下,两种方法中所有菌株的模式都不同。从这些结果可以确认,这两种方法对于特定类型的检查都是有用的。在RFLP方法中,可以清楚地确定图案的差异,而在AP-PCR方法中,有必要仔细确定在许多公共频带中有多少个不同的频带。另一方面,RFLP方法需要DNA的微克,而AP-PCR方法可以测试ng ng,因此即使在培养的早期阶段也可以进行分析,其优点是可以快速获得结果。 ..据认为,应根据检查的需要适当使用两种方法。

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