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エンドガラクツロナーゼ：ガラクツロン酸複合体の原子分解能結晶構造

机译：内半乳糖醛酸酶：半乳糖醛酸复合物的原子分辨晶体结构

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摘要

近年，放射光の利用をはじめとする測定技術の進歩は，タンパク質結晶の分解能を向上させ，一部のタンパク質結晶では1を超える非常に高い分解能が得られている．このような高い分解能では，1原子当たり，多数の観測値が得られるため，通常の構造解析よりも少ない立体化学的制限を用いた解析や異方性温度因子を考慮した解析が可能であり，より精密な構造モデルが藤られる．その結果得られた明瞭な電子密度図は，通常の分解能に比べ，より明確な解釈が可能である．例えば，電子密度から炭素原子と窒素原子，あるいは酸素原子と窒素原子の識別が可能となり，ヒスチジンやアスパラギン，ダルクミン残基の側鎖の向きを決定することができる．また，水素原子の電子密度も可視化できると考えられている．しかしながら，このような解析を行うためには，分解能が1．2以上かつ最外殻においてが≧2の反射のcompletenessが50％以上すなわち原子分解能の回折強度データが必要とされている．1〕原子分解能における構造解析から得られる側鎖の正確な向きや水素原子の位置などの構造情報は，酵素をはじめとするタンパク質の生理的な機能を解明するうえで有用であるそこで，本稿では，筆者らが行った肋叩叩上腔工刷由来エンドポリガラクツロナーゼ（endoPG）Ⅰの原子分解能Ⅹ線結晶構造解析の結果と，どのように水素原子が可視化されるのかも併せて紹介する．
机译：近年来，测量技术的进步，包括使用辐射光，提高了蛋白质晶体的分辨率，某些蛋白质晶体获得了超过1的极高分辨率。拥有如此高的分辨率，每个原子可以获得大量的观测值，因此与常规结构分析和考虑各向异性温度因素的分析相比，使用较少的立体化学限制进行分析是可能的。创建了更精确的结构模型。所产生的清晰的电子密度图可以比正常分辨率更清晰地解释。例如，可以根据电子密度来区分碳原子和氮原子，或者氧原子和氮原子，并且可以确定组氨酸，天冬酰胺和dalkmin残基的侧链的取向。还认为可以看到氢原子的电子密度。但是，为了进行这样的分析，需要使衍射强度数据的分辨率为1.2以上，最外壳的反射完整性≥2且原子分辨率为50％以上。 1]结构信息（如侧链的确切方向和在原子分辨率下通过结构分析获得的氢原子的位置）对于阐明蛋白质（如酶）的生理功能很有用。 ，我们还将介绍内聚半乳糖醛酸酶（endoPG）I的原子分辨率X射线晶体结构分析的结果，这些结果来自作者惊人的上腔加工，以及如何观察氢原子。 ..

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