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首页> 外文期刊>Biochemistry >NMR studies of the anti-apoptotic protein Bcl-xL in micelles.
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NMR studies of the anti-apoptotic protein Bcl-xL in micelles.

机译：胶束中抗凋亡蛋白Bcl-xL的NMR研究。

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The Bcl-2 family of proteins play a pivotal role in the regulation of programmed cell death. One of the postulated mechanisms for the function of these proteins involves the formation of ion channels in membranes. As a first step to structurally characterize these proteins in a membrane environment, we investigated the structure of a Bcl-x(L) mutant protein when incorporated into small detergent micelles. This form of Bcl-x(L) lacks the loop (residues 49-88) between helix 1 and helix 2 and the putative C-terminal transmembrane helix (residues 214-237). Below the critical micelle concentration (CMC), Bcl-x(L) binds detergents in the hydrophobic groove that binds to pro-apoptotic proteins. However, above the CMC, Bcl-x(L) undergoes a dramatic conformational change. Using NMR methods, we characterized the secondary structure of Bcl-x(L) in the micelle-bound form. Like Bcl-x(L) in aqueous solution, the structure of the protein when dissolved in dodecylphosphocholine (DPC) micelles consists of several alpha-helices separated by loops. However, the length and position of the individual helices of Bcl-x(L) in micelles differ from those in aqueous solution. The location of Bcl-x(L) within the micelle was examined from the analysis of protein-detergent NOEs and limited proteolysis. In addition, the mobility of the micelle-bound form of Bcl-x(L) was investigated from NMR relaxation measurements. On the basis of these studies, a model is proposed for the structure, dynamics, and location of Bcl-x(L) in micelles. In this model, Bcl-x(L) has a loosely packed, dynamic structure in micelles, with helices 1 and 6 and possibly helix 5 partially buried in the hydrophobic interior of the micelle. Other parts of the protein are located near the surface or on the outside of the micelle.
机译：Bcl-2蛋白家族在调节程序性细胞死亡中起着关键作用。这些蛋白质功能的一种推测机制涉及在膜中形成离子通道。作为在膜环境中结构表征这些蛋白质的第一步，我们研究了将Bcl-x（L）突变体蛋白质掺入小的去污剂微团时的结构。这种形式的Bcl-x（L）在螺旋1和螺旋2和推定的C端跨膜螺旋（残基214-237）之间没有环（残基49-88）。在临界胶束浓度（CMC）以下，Bcl-x（L）在疏水沟中结合去污剂，该去污剂与促凋亡蛋白结合。但是，在CMC上方，Bcl-x（L）经历了巨大的构象变化。使用核磁共振方法，我们表征了胶束结合形式的Bcl-x（L）的二级结构。像水溶液中的Bcl-x（L）一样，当溶解在十二烷基磷酸胆碱（DPC）胶束中时，蛋白质的结构由被环隔开的几个α螺旋组成。但是，胶束中Bcl-x（L）单个螺旋的长度和位置与水溶液中的不同。 Bcl-x（L）在胶束中的位置是通过分析蛋白洗涤剂的NOE和有限的蛋白水解作用来检查的。另外，通过NMR弛豫测量研究了Bcl-x（L）的胶束结合形式的迁移率。在这些研究的基础上，提出了胶束中Bcl-x（L）的结构，动力学和位置的模型。在该模型中，Bcl-x（L）在胶束中具有松散堆积的动态结构，其中螺旋1和6以及可能的螺旋5部分埋在了胶束的疏水内部。蛋白质的其他部分位于胶束的表面附近或外部。

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