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首页> 外文期刊>European Journal of Medicinal Chemistry: Chimie Therapeutique >Novel natural non-nucleoside inhibitors of HIV-1 reverse transcriptase identified by shape- and structure-based virtual screening techniques
【24h】

Novel natural non-nucleoside inhibitors of HIV-1 reverse transcriptase identified by shape- and structure-based virtual screening techniques

机译：基于形状和结构的虚拟筛选技术鉴定的HIV-1逆转录酶的新型天然非核苷抑制剂

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摘要

In this work we report a parallel application of both docking- and shape-based virtual screening (VS) methods, followed by Molecular Dynamics simulations (MDs), for discovering new compounds able to inhibit the human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) reverse transcriptase (RT) RNA-dependent DNA polymerase activity. Specifically, we screened more than 143000 natural compounds commercially available in the ZINC database against the best five RT crystallographic models, taking into account the five approved NNRTIs as query compounds. As a result, 20hitmolecules were selected and tested on biochemical assays for the inhibition of the RNA dependent DNA polymerase RT function and, among them, an indoline pyrrolidine (hit1), an indonyl piperazine (hit2) and an indolyl indolinone (hit3) derivatives were identified as novel non-nucleoside RT inhibitors in the low micromolar range.
机译：在这项工作中，我们报告了基于对接和形状的虚拟筛选（VS）方法的并行应用，然后是分子动力学模拟（MDS），用于发现能够抑制人类免疫缺陷病毒1型（HIV-1）的新化合物（HIV-1） 逆转录酶（RT）RNA依赖性DNA聚合酶活性。 具体地，我们筛选了超过143000种以上可商购的天然化合物，以ZINC数据库中获得最佳的五个RT晶体模型，考虑到五个批准的NNRTIS作为查询化合物。 结果，选择和测试20Hit分子并测试生物化学测定，用于抑制RNA依赖性DNA聚合酶RT功能，其中吲哚吡咯烷（HIT1），吲哚基哌嗪（HIT2）和吲哚啉酮（HIT3）衍生物是 在低微摩拉范围内鉴定为新的非核苷RT抑制剂。

著录项

  • 来源
  • 作者

    Giosuè Costa; Roberta Rocca; Angela Corona; Nicole Grandi; Federica Moraca; Isabella Romeo; Carmine Talarico; Maria Giovanna Gagliardi; Francesca Alessandra Ambrosio; Francesco Ortuso; Stefano Alcaro; Simona Distinto; Elias Maccioni; Enzo Tramontano; Anna Artese;

  • 作者单位

    Dipartimento di Scienze della Salute Università degli Studi “Magna Gr?cia” di Catanzaro Campus “S;

    Dipartimento di Scienze della Salute Università degli Studi “Magna Gr?cia” di Catanzaro Campus “S;

    Dipartimento di Scienze della Vita e dell’Ambiente Università di Cagliari Cittadella;

    Dipartimento di Scienze della Vita e dell’Ambiente Università di Cagliari Cittadella;

    Dipartimento di Scienze della Salute Università degli Studi “Magna Gr?cia” di Catanzaro Campus “S;

    Dipartimento di Scienze della Salute Università degli Studi “Magna Gr?cia” di Catanzaro Campus “S;

    Dipartimento di Scienze della Salute Università degli Studi “Magna Gr?cia” di Catanzaro Campus “S;

    Dipartimento di Scienze della Salute Università degli Studi “Magna Gr?cia” di Catanzaro Campus “S;

    Dipartimento di Scienze della Salute Università degli Studi “Magna Gr?cia” di Catanzaro Campus “S;

    Dipartimento di Scienze della Salute Università degli Studi “Magna Gr?cia” di Catanzaro Campus “S;

    Dipartimento di Scienze della Salute Università degli Studi “Magna Gr?cia” di Catanzaro Campus “S;

    Dipartimento di Scienze della Vita e dell’Ambiente Università degli Studi di Cagliari;

    Dipartimento di Scienze della Vita e dell’Ambiente Università degli Studi di Cagliari;

    Dipartimento di Scienze della Vita e dell’Ambiente Università di Cagliari Cittadella;

    Dipartimento di Scienze della Salute Università degli Studi “Magna Gr?cia” di Catanzaro Campus “S;

  • 收录信息
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 eng
  • 中图分类 药学;
  • 关键词

    Reverse transcriptase; NNRTIs; In silicovirtual screening; Natural products;

    机译：逆转录酶;NNRTIS;在Silicovirtual筛选;天然产品;

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