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首页> 外文期刊>Current Science: A Fortnightly Journal of Research >POTENTIAL APPLICATION OF RAPD AND RAHM MARKERS IN GENOME ANALYSIS OF SCOMBROID FISHES
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POTENTIAL APPLICATION OF RAPD AND RAHM MARKERS IN GENOME ANALYSIS OF SCOMBROID FISHES

机译：RAPD和RAHM标记在复合鱼类基因组分析中的潜在应用

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Total genomic DNA from 30 different specimens of Indian mackerel Rastrelliger kanagurta (Cuvier) and 5 king seer Scomberomorus commerson (Lacepede) was extracted by a simple modified phenol-chloroform protocol. PCR amplification conditions using 10-mer arbitrary primers were optimized. Primers with the same nucleotide sequences produced varying Random amplified polymorphic DNA (RAPD) patterns and those with different sequences generated different banding patterns for the same template in the two commercially important scombroid fishes. Primer OPA 07 (GAAACGGGTG) yielded more polymorphic loci with high reproducibility. Better performance of the primers from Kit A (Operon Technologies, Inc) is attributed to their high G+C content, RAPDs were highly sensitive to the concentrations of primer, MgCl2 and the brand of Taq DNA polymerase enzyme, Random amplified hybridization microsatellites (RAHM) can overcome the inherent shortcomings of RAPDs. [References: 17]
机译：通过简单的修饰酚-氯仿方案，从30个不同的印度鲭鱼Rastrelliger kanagurta（Cuvier）和5个国王Scomberomorus commerson（Lacepede）的标本中提取总基因组DNA。优化了使用10聚体任意引物的PCR扩增条件。具有相同核苷酸序列的引物产生了不同的随机扩增多态性DNA（RAPD）模式，而具有不同序列的引物为两条商业上重要的共生鱼类中的同一模板产生了不同的条带模式。引物OPA 07（GAAACGGGTG）产生了更多具有高可重复性的多态性基因座。试剂盒A（Operon Technologies，Inc）的引物性能更好归因于其高G + C含量，RAPD对引物，MgCl2和Taq DNA聚合酶品牌的浓度高度敏感，随机扩增杂交微卫星（RAHM） ）可以克服RAPD的固有缺点。 [参考：17]

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