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PhyreRisk: A Dynamic Web Application to Bridge Genomics, Proteomics and 3D Structural Data to Guide Interpretation of Human Genetic Variants

机译:phyrerisk:动态Web应用程序,用于桥接基因组学,蛋白质组学和3D结构数据,以指导人类遗传变异的解释

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摘要

PhyreRisk is an open-access, publicly accessible web application for interactively bridging genomic, proteomic and structural data facilitating the mapping of human variants onto protein structures. A major advance over other tools for sequence-structure variant mapping is that PhyreRisk provides information on 20,214 human canonical proteins and an additional 22,271 alternative protein sequences (isoforms). Specifically, PhyreRisk provides structural coverage (partial or complete) for 70% (14,035 of 20,214 canonical proteins) of the human proteome, by storing 18,874 experimental structures and 84,818 pre-built models of canonical proteins and their isoforms generated using our in house Phyre2. PhyreRisk reports 55,732 experimentally, multi-validated protein interactions from IntAct and 24,260 experimental structures of protein complexes.
机译:PhyRerisk是一种开放式访问,公开可访问的Web应用程序,用于交互式桥接基因组,蛋白质组学和结构数据,促进人体变体的映射到蛋白质结构上。 对序列结构变体映射的其他工具的主要进步是PhyRerisk提供了关于20,214人的规范蛋白质和另外的22,271个替代蛋白序列(同种型)的信息。 具体而言,PhyRerisk通过储存18,874实验结构和84,818种规范蛋白质预构建模型和使用我们的房屋植物,通过储存18,874个实验结构和84,818型预构建模型,提供70%(部分或完全)的结构覆盖(部分或完全)。 PhyRerisk报告55,732实验,多验证的蛋白质相互作用,与蛋白质复合物的完整和24,260个实验结构。

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