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【24h】

2,5-Diketopiperazines: A New Class of Poly(ADP-ribose)polymerase Inhibitors

机译:2,5-二酮哌嗪:一种新的聚(ADP-核糖)聚合酶抑制剂

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摘要

We show for the first time that natural 2,5-diketopiperazines (cyclic dipeptides) can suppress the activity of the important anticancer target poly(ADP-ribose)polymerase (PARP). Cyclo(L-Ala-L-Ala) and cyclo(L-Ala-D-Ala) can interact with the key residues of the PARP-1 active site, as demonstrated using docking and molecular dynamics simulations. One of the amide groups of cyclo(L-Ala-L-Ala) and cyclo(L-Ala-D-Ala) forms hydrogen bonds with the Gly863 residue, while the second amide group can form a hydrogen bond with the catalytic residue Glu988, and the side chain can make a hydrophobic contact with Ala898. Newly identified diketopiperazine inhibitors are promising basic structures for the design of more effective inhibitors of PARP family enzymes. The piperazine core with two chiral centers provides many opportunities for structural optimization.
机译:我们首次展示天然的2,5-二酮哌嗪(环偶肽)可以抑制重要抗癌靶聚(ADP-核糖)聚合酶(PARP)的活性。 Cyclo(L-Ala-L-Ala)和Cyclo(L-Ala-D-Ala)可以与使用对接和分子动力学模拟所证明的PARP-1活性位点的关键残留物相互作用。 环偶(L-ALA-L- ala)和环(L-ALA-D-ALA)的酰胺基团中的一种与GLY863残基形成氢键,而第二酰胺基团可以与催化残渣GLU988形成氢键 ,侧链可以与ALA898进行疏水接触。 新发现的二酮哌嗪抑制剂是对PARP家族酶更有效的抑制剂设计的基本结构。 具有两个手平中心的哌嗪核心为结构优化提供了许多机会。

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