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Analyzing Protein Disorder with IUPred2A

机译:用IUPRED2A分析蛋白质障碍

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摘要

IUPred2A is a combined prediction tool designed to discover intrinsically disordered or conditionally disordered proteins and protein regions. Intrinsically disordered regions exist without a well‐defined three‐dimensional structure in isolation butcarry out important biological functions. Over the years, various prediction methods have been developed to characterize disordered regions. The existence of disordered segments can also be dependent on different factors such as binding partners or environmental traits like pH or redox potential, and recognizing such regions represents additional computational challenges. In this article, we present detailed instructions on how to use IUPred2A, one of the most widely used tools for the prediction of disordered regions/proteins or conditionally disordered segments, and provide examples of how the predictions can be interpreted in different contexts.
机译:IUPRED2A是一种组合预测工具,旨在发现本质上无序或有条件无序的蛋白质和蛋白质区域。 本质上无序的区域在没有明确定义的三维结构中的分离出来的重要生物学功能。 多年来,已经开发了各种预测方法来表征紊乱的区域。 无序区段的存在也可以依赖于不同的因素,例如具有pH或氧化还原潜力的结合伴侣或环境特征,并且识别出这些区域代表额外的计算挑战。 在本文中,我们提出了有关如何使用IUPRED2A的详细说明,这是用于预测无序区域/蛋白质或有条件无序的段的最广泛使用的工具之一,并提供了如何在不同背景下解释预测的示例。

著录项

  • 来源
  • 作者单位

    Department of Biochemistry MTA‐ELTE Momentum Bioinformatics Research Group ELTE Etvs Loránd University Budapest Hungary;

    Department of Biochemistry MTA‐ELTE Momentum Bioinformatics Research Group ELTE Etvs Loránd University Budapest Hungary;

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  • 正文语种 eng
  • 中图分类 遗传学;
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