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SPIN: Submitting Sequences Determinedat Protein Level to UniProt

机译：旋转：将序列确定为Uniprot的蛋白质水平

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摘要

Public availability of biological sequences is essential for their widespreadaccess and use by the research community. The Universal Protein Resource(UniProt) is a comprehensive resource for protein sequence and functionaldata. While most protein sequences entering UniProt are imported from othersource databases containing nucleotide or 3-D structure data, protein sequencesdetermined at the protein level can be submitted directly to UniProt. To this end,UniProt provides aWeb interface called SPIN. This service enables researchersto make their de novo–sequenced proteins available to the scientific communityand acquire UniProt accession numbers for use in publications. This unitexplains the process of submitting a protein sequence to UniProt using SPIN.The basic protocol describes all the necessary steps for a single sequence. Asupport protocol gives guidance on how best to deal with exceptionally largedatasets.
机译：生物序列的公共可用性对于他们的普遍存在和研究界的使用至关重要。 通用蛋白质资源（UNIPROT）是蛋白质序列和功能的综合资源。 虽然进入UNIPROT的大多数蛋白质序列从含有核苷酸或3-D结构数据的局部数据库导入，但是在蛋白质水平上鉴定的蛋白质可以直接提交给Uniprot。 为此，UNIPROT提供名为Spin的AWEB接口。 该服务使研究能够使其De Novo测序的蛋白质可用于科学界和获得的Uniprot登录号码以供出版物。 这种Unitexplains使用旋转将蛋白质序列提交蛋白质序列的过程。基本协议描述了单个序列的所有必要步骤。 Asupport协议为有关如何最好地处理的是极致的轨迹的指导。

著录项

  • 来源
  • 作者

    Klemens Pichler; Kate Warner; Michele Magrane; The UniProtConsortium;

  • 作者单位

    European Molecular Biology Laboratory European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI) Wellcome Genome Campus Hinxton Cambridge United Kingdom;

    European Molecular Biology Laboratory European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI) Wellcome Genome Campus Hinxton Cambridge United Kingdom;

    European Molecular Biology Laboratory European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI) Wellcome Genome Campus Hinxton Cambridge United Kingdom;

    European Molecular Biology Laboratory European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI) Wellcome Genome Campus Hinxton Cambridge United Kingdom;

  • 收录信息
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 eng
  • 中图分类 遗传学;
  • 关键词

    direct protein sequencing; submission; UniProt;

    机译：直接蛋白质测序;提交;UNIPROT;

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