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Transcriptome comparison between two fig (Ficus carica L.) cultivars

机译：两种图（Ficus Carica L.）品种之间的转录组比较

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The fig tree, Ficus carica L., is one of the first domesticated plants, grown since the beginning of agriculture for fresh consumption of its fruits. Recently, the predicted transcriptome of the Japanese cultivar Horaishi was published based on its genome sequence. After producing a preliminary genome sequence draft of another genotype, the Italian cv. Dottato, we identified and annotated 41,857 putative genes. A comparison was made between the predicted transcriptomes of the two cultivars and putatively Dottato specific genes were identified. Of these, 534 genes were not found in the Horaishi genome and might represent sequences unique to cv. Dottato. Only 2,374 pairs of reliable orthologous genes could be selected in the two genotypes indicating the occurrence of large sequence variability. Overall, our data provide a resource for fig functional genomics studies, and represent one of the first reports on the intraspecific genome diversity existing in this species.
机译：无花果树，榕属Carica L.是第一家驯养植物之一，自农业开始以来为其果实的新鲜食用而生长。 最近，基于其基因组序列公布了日本品种Horaishi的预测转录组。 在产生另一种基因型的初步基因组序列草案后，意大利CV。 Dottato，我们鉴定并注释了41,857个推定基因。 在预测的两种品种的预测转录组之间进行了比较，并鉴定了额外的Dottath特异性基因。 其中，在Horaishi基因组中未发现534个基因，并且可能代表CV独特的序列。 杜拉蒂。 在两种基因型中，只能选择2,374对可靠的正交基因，表明发生大序列变异性的发生。 总体而言，我们的数据提供了无活性基因组学研究的资源，并代表了本物种存在的内部内部基因组多样性的第一份报告之一。

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