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【24h】

GB2sequin-A file converter preparing custom GenBank files for database submission

机译：GB2SQUIN-A文件转换器为数据库提交准备自定义GenBank文件

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The typical we lab user often annotates smaller sequences in the GenBank format, but resulting files are not accepted for database submission by NCBI. This makes submission of such annotations a cumbersome task. Here we present "GB2sequin" an easy-to-use web application that converts custom annotations in the GenBank format into the NCBI direct submission format Sequin. Additionally, the program generates a "five-column, tab-delimited feature table" and a FASTA file. Those are required for submission through BankIt or the update of an existing GenBank entry. We specifically developed "GB2sequin" for the regular we lab researcher with strong focus on user-friendliness and flexibility. The application is equipped with an intuitive graphical interface and a comprehensive documentation. It can be employed to prepare any GenBank file for database submission and is freely available online at https://chlorobox.mpimp-golm.mpg.de/GenBank2Sequin.html.
机译：典型的我们实验室用户通常会在GenBank格式中注释较小的序列，但NCBI的数据库提交不会接受产生的文件。 这使得这些注释提交了一个麻烦的任务。 在这里，我们呈现“GB2SEQUIN”易于使用的Web应用程序，可将GenBank格式的自定义注释转换为NCBI Direct提交格式Sequin。 此外，程序还生成“五列，选项卡分隔的功能表”和FASTA文件。 这些都是通过银行业提交或更新现有的GenBank条目所必需的。 我们专门为普通的我们实验室研究人员开发了“GB2SEQUIN”，强烈关注用户友好性和灵活性。 该应用程序配备了直观的图形界面和全面的文档。 它可以用于准备数据库提交的任何GenBank文件，并在https://chlorobox.mpimp-golm.mpg.de/genbank2sequin.html上自由地提供。

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