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首页> 外文期刊>Marine genomics >Complete genome sequence of Pseudoalteromonas sp. MEBiC 03485, isolated from deep-sea sediment
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Complete genome sequence of Pseudoalteromonas sp. MEBiC 03485, isolated from deep-sea sediment

机译：Pseudoalteromonas sp的完全基因组序列。 Mebic 03485，从深海沉积物隔离

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Pseudoalteromonas strains are widely distributed in the marine environment and most have attracted considerable interest owing to their ability to synthesize biologically active metabolites. In this study, we report and describe the genome sequence of Pseudoalteromonas sp. MEBiC 03485, isolated from the deep-sea sediment of Pacific Ocean at a depth of 2000 m. The complete genome consisted of three contigs with a total genome size of 4,167,407 bp and a GC content of 40.761%, and was predicted to contain 4194 protein-coding genes and 131 non-coding RNA genes. The strain MEBiC 03485 genome was also shown to contain genes for diverse metabolic pathways. Genome analysis revealed that the genome of strain MEBiC 03485 was enriched with genes involved in signal transduction, mobile elements, and cold-adaptation, some of which might improve ecological fitness in the deep-sea environment. These findings improve our understanding of microbial adaptation strategies in deepsea environments.
机译：伪甲腺炎菌株在海洋环境中广泛分布，由于它们在合成生物活性代谢物的能力，大多数都引起了相当大的兴趣。 在这项研究中，我们报告并描述了伪altomonas sp的基因组序列。 MeBic 03485，从太平洋深海沉积物隔离，深度为2000米。 完整的基因组由三个共体组成，总基因组大小为4,167,407bp，GC含量为40.761％，预计含有4194个蛋白质编码基因和131个非编码RNA基因。 还显示菌株MEBIC 03485基因组含有不同代谢途径的基因。 基因组分析表明，菌株MEBIC 03485的基因组富集了参与信号转导，移动元件和冷适应的基因，其中一些可能会改善深海环境中的生态健康。 这些发现改善了我们对深度环境中微生物适应策略的理解。

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