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Sequence-Specific Oligonucleotide Purification Using Peptide Nucleic Acid Amphiphiles in Hydrophobic Interaction Chromatography

机译:疏水相互作用色谱中使用肽核酸两亲物纯化特定序列的寡核苷酸

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摘要

We present a methodology to perform sequence-specific separations of oligonucleotides using pep tide nucleic acids covalently linked to alkane chains,or "PNA amphiphiles(PNAAs)".The PNAA/DNA duplexes are discriminated from unbound DNA using hydrophobic interaction chromatography on a phenyl-substituted Sepharose column.Nearly quantitative recovery is achieved at concentrations of 50 muM after incubation of oligomers with a stoichiometric amount of PNAA for 1 min or so.The method exhibits high sequence specificity,selectivity,and resolution when applied to mixtures of various oligomers up to 60 base pairs in length.
机译:我们提出了一种使用共价连接到烷烃链或“ PNA两亲物(PNAAs)”的肽段核酸进行寡核苷酸序列特异性分离的方法。使用苯基上的疏水相互作用色谱法将PNAA / DNA双链体与未结合的DNA区别开来。将低聚物与化学计量的PNAA孵育1分钟左右后,在50μM的浓度下几乎可以实现定量回收。该方法在将各种低聚物混合使用时,具有很高的序列特异性,选择性和分离度长度为60个碱基对。

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