...
  • 主题
高级搜索  >
历史搜索 清空历史
首页> 外文期刊>AIDS >Spatiotemporal dynamics of the HIV-1 CRF06_cpx epidemic in western Africa
【24h】

Spatiotemporal dynamics of the HIV-1 CRF06_cpx epidemic in western Africa

机译：西部非洲HIV-1 CRF06_cpx流行的时空动态

获取原文
获取原文并翻译 | 示例
           
页面导航
  • 摘要
  • 著录项
  • 相似文献
  • 相关主题

摘要

Objective: To investigate the origin and spatiotemporal dynamics of dissemination of the HIV-1 CRF06_cpx clade in western Africa. Design: A total of 180 HIV-1 CRF06_cpx-like pol sequences isolated from 12 different countries from west and west-central Africa over a period of 16 years (1995-2010) were analyzed. Methods: Evolutionary, phylogeographic and demographic parameters were jointly estimated from sequence data using a Bayesian coalescent-based method and combined with molecular epidemiology and spatial accessibility data. Results: The CRF06_cpx most probably emerged in Burkina Faso in 1979 (1970-1985). From Burkina Faso, the virus was first disseminated to Mali and Nigeria during the 1980s and later to other countries from west and west-central Africa. Demographic reconstruction indicates that the CRF06_cpx epidemic grew exponentially during the 1980s, with a median growth rate of 0.82 year~(-1) (0.60-1.09 year~(-1)), and after stabilize. We found a negative correlation between CRF06_cpx prevalence and the geographical distance to Burkina Faso's capital. Regional accessibility information agrees with the overall geographical range of the CRF06_cpx, but not fully explains the highly heterogeneous distribution pattern of this CRF at regional level.Conclusion: The CRF06_cpx epidemic in western Africa probably emerged at the late 1970s and grew during the 1980s at a rate comparable to the HIV-1 epidemics in the United States and Europe. Burkina Faso seems to be the most important epicenter of dissemination of the HIV-1 CRF06_cpx strain at regional level. The explanation for the current geographical distribution of CRF06_cpx is probably multifactorial.
机译：目的：研究在非洲西部传播HIV-1 CRF06_cpx进化枝的起源和时空动态。设计：在16年内（1995-2010年），对来自非洲中西部和西部的12个不​​同国家的180个HIV-1 CRF06_cpx样pol序列进行了分析。方法：使用基于贝叶斯聚结的方法，根据序列数据共同估算进化，植物学和人口统计学参数，并结合分子流行病学和空间可及性数据。结果：CRF06_cpx最有可能在1979年（1970-1985年）在布基纳法索出现。该病毒从布基纳法索首先在1980年代传播到马里和尼日利亚，然后从非洲中西部传播到其他国家。人口结构重建表明，CRF06_cpx流行病在1980年代呈指数增长，中位数增长率为0.82年〜（-1）（0.60-1.09年〜（-1）），并且在稳定之后。我们发现CRF06_cpx患病率与到布基纳法索首都的地理距离之间存在负相关关系。区域可访问性信息与CRF06_cpx的整体地理范围一致，但并未完全解释该CRF在区域一级的高度异质分布模式。结论：西非的CRF06_cpx流行病可能在1970年代末出现，并在1980年代爆发。与美国和欧洲的HIV-1流行相当。布基纳法索似乎是区域一级传播HIV-1 CRF06_cpx菌株的最重要中心。当前CRF06_cpx地理分布的解释可能是多因素的。

著录项

相似文献

  • 外文文献
  • 中文文献
  • 专利
获取原文

客服邮箱：kefu@zhangqiaokeyan.com

京公网安备：11010802029741号 ICP备案号：京ICP备15016152号-6 六维联合信息科技 (北京) 有限公司©版权所有

  • 客服微信

  • 服务号