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首页> 外文期刊>Journal of genetics >The complete chloroplast genome of the threatened itboldDipentodon sinicus/it/bold (Dipentodontaceae)
【24h】

The complete chloroplast genome of the threatened itboldDipentodon sinicus/it/bold (Dipentodontaceae)

机译：威胁的完全叶绿体基因组。＆＆＆ dipentodon sinicus和 （Dipentodontaceae）

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Dipentodon is a monotypic genus of Dipentodontaceae and the only species, Dipentodon sinicus, is scattered in southwest China as well as adjacent Myanmar, northeast India and northern Vietnam. This species was evaluated as vulnerable in China Species Red List'. Here, we assembled and characterized the complete chloroplast (cp) genome of D. sinicus using Illumina sequencing data for the first time. The complete cp genome was 158,795 bp in length, consisting of a pair of inverted repeats of 26,587 bp, a large single-copy region of 87,233 bp and a small single-copy region of 18,388 bp. The genome encoded 113 unique genes, including 79 protein-coding genes, 30 tRNA genes and four rRNA genes. Phylogenetic analysis based on 16 complete cp genome sequences indicated that D. sinicus is a member of Huerteales, consistent with its position in the latest classification of flowering plants (AGP IV).
机译：Dipentodon是Dipentodontaceae的单调型属，唯一的物种Dipentodon Sinicus散落在中国西南部，邻近缅甸，东北印度和越南北部。 该物种被评估为脆弱的中国物种红色列表'。 在这里，我们组装并表征了D.Inicus的完全叶绿体（Cp）基因组使用Illumina测序数据。 完整的CP基因组的长度为158,795bp，由一对倒置重复的26,587 bp，一个大的单拷贝区域为87,233 bp，小单拷贝区域为18,388 bp。 基因组编码113个独特基因，包括79个蛋白质编码基因，30个TRNA基因和四个RRNA基因。 基于16个完整的CP基因组序列的系统发育分析表明，D.Inicus是Huerteales的成员，其符合其在最新分类的开花植物（AGP IV）的位置。

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