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Analog Designing & Target Idendification of Collagenase in Wound Healing

机译：伤口愈合中胶原酶的模拟设计和靶标识别

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In this study it has been analyzed the role of collagenase analog on the triple helical structure of collagen in wound healing through Insilco method. The tools used are i) The PDB RCSB to get the 3D structure of the protein Collagen, ii) The drug bank to get the drugs for the wound healing disease, iii) The NC BI to get the drug collagenase chemical structure, iv) The NCI to get the analogs for the drug collagenase v) The hex to perform docking of collagen receptor and collagenase ligands vi)The Swiss PDB Deep Viewer to find the interacting amino acids from the docked complex. vii)The CAST P to find the active sites in the protein collagen. The analogs of collagenase drug acts on the amino acids such as proline and hydroxyproline to inhibit their role in the triple helical structure of collagen protein and to release fibrin or fibronectin which prevents blood loss in wound. It is finally conclude that in the five analogs of collagenase drug the most effective analogs which are acting on the Proline and hydroxyproline that are responsible for forming the triple helical structure of the collagen protein, can be cleaved by the action of three analogs like 1 -bromo-2.5-pyrrolidinedione. 2-ethyl-1.2-dipheny1-1 -butanol and 5-methyl-2-phenyl-2.4-dihydro-3H-pyrazol-3-one.
机译：在这项研究中，已经分析了胶原酶类似物在通过Insilco方法中胶原蛋白在伤口愈合中的三重螺旋结构中的作用。使用的工具是i）PDB RCSB获取蛋白质胶原蛋白的3D结构，ii）毒品库以获取伤口愈合疾病的药物，iii）NC BI获得药物胶原酶化学结构，iv） NCI获得了药物胶原酶的类似物，v）执行胶原蛋白受体和胶原酶配体VI的对接vi）瑞士PDB深度观看器，以从停靠的复合物中找到相互作用的氨基酸。 vii）铸造P以在蛋白质胶原蛋白中找到活性位点。胶原酶药物的类似物作用于氨基酸（例如脯氨酸和羟丙烯）上，可抑制它们在胶原蛋白的三螺旋结构中的作用，并释放纤维蛋白或纤连蛋白，以防止伤口流失。最终得出的结论是，在胶原酶药物的五个类似物中，最有效的类似物作用于脯氨酸和羟基丙烯蛋白，这些类似物负责形成胶原蛋白的三重螺旋结构，可以通过三个类似物（例如1-1-）的作用来裂解Bromo-2.5-吡啶酮。 2-乙基1.2-二苯基1-1-丁醇和5-甲基-2-苯基-2.4-二氢-3H-3H-吡唑-3-酮。

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