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Direct IBD mapping: identical-by-descent mapping without genotyping.

机译:直接IBD映射:无基因分型的逐次同源映射。

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摘要

Direct identical-by-descent (IBD) mapping is a technique, that combines genomic mismatch scanning (GMS) and DNA microarray technology, for mapping regions shared IBD between two individuals without locus-by-locus genotyping or sequencing. The lack of reagents has limited its widespread application. In particular, two key reagents have been limiting, 1). mismatch repair proteins MutS, L and H, and 2). genomic microarrays for identifying the genomic locations of the GMS-selected IBD fragments. Here, we describe steps that optimized the procedure and resources that will facilitate the development of direct IBD mapping.
机译:直接按血统同源(IBD)作图是一种结合基因组错配扫描(GMS)和DNA微阵列技术的技术,用于对两个个体之间共享的IBD区域进行作图,而无需按基因座进行基因分型或测序。试剂的缺乏限制了其广泛的应用。特别是,两种关键试剂一直受到限制:1)。错配修复蛋白MutS,L和H,以及2)。基因组微阵列,用于鉴定GMS选择的IBD片段的基因组位置。在这里,我们描述了优化过程和资源的步骤,这些步骤和资源将有助于直接IBD映射的开发。

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