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Automating a combined composite-consensus method to generate DNA profiles from low and high template mixture samples

机译：自动化组合共识方法，从低和高模板混合物样品生成DNA谱

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We present an automated method to generate DNA profiles from replicate PCRs by combining advantages of the composite and consensus method by a system of brackets in which an allelic balance threshold is used as a variable to separate DNA-profiles of major from minor donors. Through the analysis of artificial low (125 pg) and high (250 pg) template three-person mixtures with low (1:1.5:3) and high (1:5:10) donor ratios we demonstrate the usefulness of a tool to determine the optimal allelic balance threshold within a locus. The automated extraction of dominant profiles saves considerable amounts of time when producing composite-consensus profiles. Drop-in/drop-out rates are produced and a comparison is made with an alternative open source script to evaluate the dominant profiles generated. By introducing this script into the forensic community we hope to increase awareness of much needed collaborative efforts with bioinformaticians and statisticians to develop forensic open source software scripts.
机译：我们提出了一种自动方法，可通过将括号中的等位基因平衡阈值用作变量来分离主要供者和未成年人供者的DNA谱，从而将复合和共有方法的优势相结合，从而从复制PCR产生DNA谱。通过分析低供体比率（1：1.5：3）和高供体比率（1：5：10）的人工低（125 pg）和高（250 pg）模板三人混合物，我们证明了确定工具的有效性一个基因座中的最佳等位基因平衡阈值。在生成复合共识配置文件时，主要配置文件的自动提取可节省大量时间。产生掉入/掉出率，并与替代的开放源脚本进行比较以评估生成的主要配置文件。通过将此脚本引入法医社区，我们希望提高与生物信息学家和统计学家合作开展法医开源软件脚本的迫切需要的认识。

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