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利用DDA-DIA交替采集定量筛选红颊草莓柱头差异蛋白的方法

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本发明公开了一种利用DDA‑DIA交替采集定量筛选红颊草莓柱头差异蛋白的方法，包括以下步骤：1)、DDA采集模式建立红颊草莓柱头蛋白肽段信息库；2)、DIA模式采集待试样品信息：取小蕾期、中蕾期、大蕾期红颊草莓柱头，分别制备成肽段溶液，再进行DIA模式采集定量数据；3)、筛选差异蛋白：将步骤1)得到的信息库列表和步骤2)得到的DIA原始文件导入分析软件Spectronaut Pulsar进行匹配定量、T检验分析，以中蕾期样品为总对照筛选出p<0.05且小蕾期样品、大蕾期样品分别相较中蕾期样品表达倍数≥1.5或者≤2/3的差异蛋白。采用该方法能实现对红颊草莓柱头差异蛋白的定量筛选。

著录项

公开/公告号CN109613253A

专利类型发明专利
公开/公告日2019-04-12

原文格式PDF
申请/专利权人杭州市农业科学研究院;
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申请/专利号CN201811304235.4
发明设计人裘劼人;王淑珍;周历萍;柴伟国;阮松林;余红;童建新;来文国;
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申请日2018-11-03
分类号G01N33/68(20060101);
代理机构33212 杭州中成专利事务所有限公司;
代理人金祺
地址 310024 浙江省杭州市西湖区转塘街道洙泗路261号
入库时间 2024-02-19 09:00:07

法律信息

法律状态公告日

法律状态信息

法律状态
2019-05-07

实质审查的生效 IPC(主分类):G01N33/68 申请日:20181103

实质审查的生效
2019-04-12

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