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基于梯度增强决策树预测环状RNA与疾病相关性的方法

摘要

本发明公开了基于梯度增强决策树预测环状RNA与疾病相关性的方法,通过将环状RNA‑疾病关系网络转化为无向图、计算环状RNA碱基序列相似性、功能注释语义相似性以及表达相似性,计算疾病功能以及语义相似性,采用多网络融合算法整合多种环状RNA相似性网络以及加权平均整合疾病相似性网络,提取融合后的环状RNA和疾病相似性网络以及环状RNA‑疾病关系网络的统计学特征,将融合后的环状RNA和疾病相似性网络转换成无权图的图相关特征,环状RNA碱基序列特征以及环状RNA‑疾病关系网络隐式向量特征,训练梯度增强决策树学习机,预测潜在环状RNA‑疾病关系。本发明方法能准确地预测出潜在环状RNA‑疾病关系;且提高了环状RNA‑疾病关系的预测准确率。

著录项

  • 公开/公告号CN110459264A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2019-11-15

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 陕西师范大学;

    申请/专利号CN201910711870.2

  • 发明设计人 雷秀娟;方增强;张宇辰;

    申请日2019-08-02

  • 分类号

  • 代理机构西安通大专利代理有限责任公司;

  • 代理人安彦彦

  • 地址 710119陕西省西安市长安区西长安街620号

  • 入库时间 2024-02-19 15:44:13

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2019-12-10

    实质审查的生效 IPC(主分类):G16B15/30 申请日:20190802

    实质审查的生效

  • 2019-11-15

    公开

    公开

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