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用于改善基于扩增子测序的微生物群落分类学解析的方法和系统

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本发明涉及用于改善基于扩增子测序的微生物群落分类学解析的方法和系统。使用桑格(Sanger)等传统测序方法(较长的读出长度)获得分类学解析需要大量时间。然而，NGS技术(较短的读出长度)的测序涉及大量成本。除此之外，分类学分类的准确度和深度也较低。提供了用于提高基于扩增子测序的对微生物群落的分类学概况分析的准确度的方法和系统。所提出的策略依赖于从两个配对末端测序实验获得微生物群落的分类丰度概况，每个测序实验靶向非连续(或连续)V区的不同成对组合。然后，基于个体V区(实验中靶向)在解析每个所考虑的分类群中的(预估的)准确度，将两个分类学概况组合。

著录项

公开/公告号CN110819704A

专利类型发明专利
公开/公告日2020-02-21

原文格式PDF
申请/专利权人塔塔咨询服务有限公司;
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申请/专利号CN201910742535.9
发明设计人 S·S·曼德;A·杜塔;N·K·皮那;M·M·哈克;
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申请日2019-08-12
分类号
代理机构上海专利商标事务所有限公司;
代理人陈扬扬
地址印度马哈拉施特拉邦
入库时间 2023-12-17 07:08:50

法律信息

法律状态公告日

法律状态信息

法律状态
2020-03-17

实质审查的生效 IPC(主分类):C12Q1/6869 申请日:20190812

实质审查的生效
2020-02-21

公开

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