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一种用于预测原发性乳腺癌发生风险的DNA甲基化标记物及其筛选方法和应用

摘要

本发明公开了一种用于预测原发性乳腺癌发生风险的DNA甲基化标记物及其筛选方法和应用。所述方法包括以下步骤:(1)对样本数据进行甲基化分析,获得与预测原发性乳腺癌发生风险相关的甲基化位点;(2)获得针对所述甲基化位点的甲基化Beta值;(3)基于所述甲基化位点的甲基化Beta值构建原发性乳腺癌发生风险预测模型,并通过计算比值比验证该模型的可行性;(4)采用机器学习方法构建基于所述甲基化位点的原发性乳腺癌发生风险预测模型,计算比值比、AUC、召回率、精确率和F1值,与步骤(3)的预测模型进行相互验证;(5)所述预测模型中甲基化探针对应的甲基化位点即为DNA甲基化标记物。本发明可提高原发性乳腺癌的检出率,适于大规模推广应用。

著录项

  • 公开/公告号CN111440869A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2020-07-24

    原文格式PDF

  • 申请/专利号CN202010181207.9

  • 发明设计人 张红雨;全源;佟馨宇;李姜;黄清;

    申请日2020-03-16

  • 分类号

  • 代理机构广州三环专利商标代理有限公司;

  • 代理人颜希文

  • 地址 430070 湖北省武汉市洪山区狮子山1号华中农业大学

  • 入库时间 2023-12-17 10:24:54

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2020-08-18

    实质审查的生效 IPC(主分类):C12Q1/6886 申请日:20200316

    实质审查的生效

  • 2020-07-24

    公开

    公开

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