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使用会聚比决定簇和分流比决定簇来分析新陈代谢通量的方法

摘要

本发明涉及一种使用CRD和SRD分析新陈代谢通量的方法,具体地,所述方法包括:选择特定目标生物体,并基于生物化学反应构建所选生物体的代谢网络模型,确定代谢网络模型中特定代谢通量之间的相关性,将相关比定义为CRD和SRD,为了测定新陈代谢通量比通过实验定义新陈代谢通量的相关比,使用确定的CRD、SRD和人工代谢物相关比修改化学计算矩阵,并应用代谢网络模型的修改的化学计算矩阵以便进行线性编程。根据本发明的方法,相对于目标生物体(包括E.coli.),该目标生物的基因组水平的新陈代谢网络模型被构建,其中特定代谢物的流入/流出新陈代谢通量之间的关系可使用得自各种实验包括使用放射性同位素标记的碳源的生长实验和用于测定酶反应速率的实验的有用信息定义为相关比。因此,来自各种实验的限制值可被有效使用,使内部新陈代谢通量可以更为准确迅速的方式定量并分析。

著录项

  • 公开/公告号CN101460844A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2009-06-17

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 韩国科学技术院;

    申请/专利号CN200680054294.X

  • 发明设计人 李相烨;崔亨奭;金兑勇;

    申请日2006-09-08

  • 分类号G01N33/50;

  • 代理机构南京经纬专利商标代理有限公司;

  • 代理人楼高潮

  • 地址 韩国大田广域市

  • 入库时间 2023-12-17 22:06:15

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2013-06-05

    发明专利申请公布后的视为撤回 IPC(主分类):C12Q1/02 申请公布日:20090617 申请日:20060908

    发明专利申请公布后的视为撤回

  • 2009-08-12

    实质审查的生效

    实质审查的生效

  • 2009-06-17

    公开

    公开

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