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基于邻域粗糙集的加权KNN肿瘤基因表达谱分类方法

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摘要

本发明涉及肿瘤基因表达谱分类技术领域，特别是一种基于邻域粗糙集的加权KNN肿瘤基因表达谱分类方法，其特征在于：包括以下步骤：步骤1：采用Relief算法排序所有基因，然后选择前d个基因构成初始信息基因子集Gd；步骤2：采用基于邻域粗糙集模型的前向属性约简算法对所述初始信息基因子集Gd中的基因进行约简，进一步得到重要特征基因子集Go，其基数接近最小；步骤3：将所述重要特征基因子集Go作为加权KNN分类方法的输入，对肿瘤样本集进行分类训练，训练后得到肿瘤分类模型；步骤4：采用测试集评估得到的肿瘤分类模型。该方法有利于发现有差异的基因表达，避免同样重要地依赖于所有属性的相似性度量引起的误导，克服“维数陷阱”问题。

著录项

  • 公开/公告号CN101923604A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2010-12-22

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 福建师范大学;

    申请/专利号CN201010234953.6

  • 发明设计人 孔祥增;陈智勤;陈丽萍;宋考;

    申请日2010-07-23

  • 分类号G06F19/00(20060101);C12Q1/68(20060101);

  • 代理机构35100 福州元创专利商标代理有限公司;

  • 代理人蔡学俊

  • 地址 350007 福建省福州市仓山区上三路32号

  • 入库时间 2023-12-18 01:39:26

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2013-06-12

    发明专利申请公布后的驳回 IPC(主分类):G06F19/00 申请公布日:20101222 申请日:20100723

    发明专利申请公布后的驳回

  • 2011-02-02

    实质审查的生效 IPC(主分类):G06F19/00 申请日:20100723

    实质审查的生效

  • 2010-12-22

    公开

    公开

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