一组用于检测飞行员LOD易感基因多态性位点及检测试剂盒

技术领域

本发明属于核酸扩增技术领域，涉及一组用于检测飞行员LOD易感基因多态性位点及检测试剂盒。

背景技术

飞行人员的选拔是世界各国都十分重要的问题。国内外相关研究表明，科学的医学选拔不仅能够提高飞行人员最终成飞的预测效率和提高飞机飞行安全，还能大大降低飞行人员训练成本。科学的医学选拔也能提高飞行安全。因此选拔和训练对建设高素质的飞行人员队伍具有重要意义。

单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism，SNP)是由单个核苷酸的改变而引起的DNA序列的改变，造成染色体基因组的多样性。SNP分布广、密度高，已成为继限制性片段长度多态性(RFLP)标志和微卫星即短串联重复(STR)标志后的第三代遗传标志，在肿瘤、糖尿病等复杂疾病的研究中起重要作用。其中，全基因组关联分析(Genome WideAssociation Study，GWAS)是研究这类复杂疾病易感基因的重要手段。

飞行人员作为一个特殊群体，其职业有着高风险和高难度的特点，使得他们要承受很大的生理和心理压力，因而对他们的体质和心理健康有着特定的要求。研究表明，不同个体基础正加速度(+Gz)耐力、高空缺氧耐力、认识反应速度、信息加工能力和突发性心脑血管疾病的发生率存在差异，这种差异与遗传因素有关。

发明内容

本发明的第一个目的是提供一种用于检测飞行员LOD易感基因多态性位点的引物对组。其中，所述飞行员LOD易感基因为飞行员迟发性疾病易感基因，所述飞行员LOD易感基因多态性位点为如下12个SNP位点：rs7181866位点、rs6311位点、rs7305115位点、rs4680位点、rs1799983位点、rs5065位点、rs1801133位点、rs3759584位点、rs4340位点、rs11549465位点、rs1800544位点和rs699947位点。这12个SNP位点是对飞行员这一特殊群体飞行寿命影响较大的一组位点，主要含有加速度耐力相关基因、缺氧耐力相关基因、心理和认知相关基因及心脑血管疾病相关基因等。

所述rs7181866位点为人基因组中如下序列中括号处所示：gatccaacatagaataggagagagt[A/G]cccaaaatgatggtgaagggagacc；

所述rs6311位点为人基因组中如下序列中括号处所示：ATGTCCTCGGAGTGCTGTGAGTGTC[C/T]GGCACTTCCATCCAAAGCCAACAGT；

所述rs7305115位点为人基因组中如下序列中括号处所示：ATGGCTCAGATCCCCTCTACACCCC[A/G]GAACCGTGAGTACCTACATTAAAGC；

所述rs4680位点为人基因组中如下序列中括号处所示：CCAGCGGATGGTGGATTTCGCTGGC[A/G]TGAAGGACAAGGTGTGCATGCCTGA；

所述rs1799983位点为人基因组中如下序列中括号处所示：CCCTGCTGCTGCAGGCCCCAGATGA[G/T]CCCCCAGAACTCTTCCTTCTGCCCC；

所述rs5065位点为人基因组中如下序列中括号处所示：CTTGTCCTCCCTGGCTGTTATCTTC[A/G]GTACTGCAAAGAGAACACAGACATA；

所述rs1801133位点为人基因组中如下序列中括号处所示：TTGAAGGAGAAGGTGTCTGCGGGAG[C/T]CGATTTCATCATCACGCAGCTTTTC；

所述rs3759584位点为人基因组中如下序列中括号处所示：GGCCTTTTCTCCTGTCTCATCCCCA[C/T]GGTCACTGCAGAGGAGACACATGCC；

所述rs4340位点为人基因组中如下序列中括号处所示：CCATTTCTCTAGACCTGCTGCCTAT[(288BPINDEL)/(ALU)/-]ACAGTCACTTTTATGTGGTTTCGCC；其中，288BP的插入/缺失序列如序列表中序列38所示；

所述rs11549465位点为人基因组中如下序列中括号处所示：GTTACGTTCCTTCGATCAGTTGTCA[C/T]CATTAGAAAGCAGTTCCGCAAGCCC；

所述rs1800544位点为人基因组中如下序列中括号处所示：CCGTTGCGTTCTGCTCCGTCGGCCC[C/G]GAGCTGCATGGCCAACTCCCAGCAG；

所述rs699947位点为人基因组中如下序列中括号处所示：GCCAGCTGTAGGCCAGACCCTGGCA[A/C]GATCTGGGTGGATAATCAGACTGAC。

本发明所提供的用于检测人基因组中12个SNP位点的引物对组，具体由如下1)-12)组成：

1)用于检测所述rs7181866位点的引物对1和引物对2；所述引物对1为如下(a1)或(a2)所示的引物对，所述引物对2为如下(a3)或(a4)所示的引物对：

(a1)由序列表中序列1和序列2所示的两条单链DNA分子组成的引物对；

(a2)由将序列表中序列1和序列2经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a1)中所述引物对功能相同的引物对；

(a3)由序列表中序列1和序列3所示的两条单链DNA分子组成的引物对；

(a4)由将序列表中序列1和序列3经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a3)中所述引物对功能相同的引物对；

2)用于检测所述rs6311位点的引物对3和引物对4；所述引物对3为如下(a5)或(a6)所示的引物对，所述引物对4为如下(a7)或(a8)所示的引物对：

(a5)由序列表中序列4和序列5所示的两条单链DNA分子组成的引物对；

(a6)由将序列表中序列4和序列5经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a5)中所述引物对功能相同的引物对；

(a7)由序列表中序列4和序列6所示的两条单链DNA分子组成的引物对；

(a8)由将序列表中序列4和序列6经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a7)中所述引物对功能相同的引物对；

3)用于检测所述rs7305115位点的引物对5和引物对6；所述引物对5为如下(a9)或(a10)所示的引物对，所述引物对6为如下(a11)或(a12)所示的引物对：

(a9)由序列表中序列7和序列8所示的两条单链DNA分子组成的引物对；

(a10)由将序列表中序列7和序列8经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a8)中所述引物对功能相同的引物对；

(a11)由序列表中序列7和序列9所示的两条单链DNA分子组成的引物对；

(a12)由将序列表中序列7和序列9经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a10)中所述引物对功能相同的引物对；

4)用于检测所述rs4680位点的引物对7和引物对8；所述引物对7为如下(a13)或(a14)所示的引物对，所述引物对8为如下(a15)或(a16)所示的引物对：

(a13)由序列表中序列10和序列11所示的两条单链DNA分子组成的引物对；

(a14)由将序列表中序列10和序列11经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a13)中所述引物对功能相同的引物对；

(a15)由序列表中序列12和序列13所示的两条单链DNA分子组成的引物对；

(a16)由将序列表中序列12和序列13经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a15)中所述引物对功能相同的引物对；

5)用于检测所述rs1799983位点的引物对9和引物对10；所述引物对9为如下(a17)或(a18)所示的引物对，所述引物对10为如下(a19)或(a20)所示的引物对：

(a17)由序列表中序列14和序列15所示的两条单链DNA分子组成的引物对；

(a18)由将序列表中序列14和序列15经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a17)中所述引物对功能相同的引物对；

(a19)由序列表中序列14和序列16所示的两条单链DNA分子组成的引物对；

(a20)由将序列表中序列14和序列16经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a19)中所述引物对功能相同的引物对；

6)用于检测所述rs5065位点的引物对11和引物对12；所述引物对11为如下(a21)或(a22)所示的引物对，所述引物对12为如下(a23)或(a24)所示的引物对：

(a21)由序列表中序列17和序列18所示的两条单链DNA分子组成的引物对；

(a22)由将序列表中序列17和序列18经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a21)中所述引物对功能相同的引物对；

(a23)由序列表中序列17和序列19所示的两条单链DNA分子组成的引物对；

(a24)由将序列表中序列17和序列19经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a23)中所述引物对功能相同的引物对；

7)用于检测所述rs1801133位点的引物对13和引物对14；所述引物对13为如下(a25)或(a26)所示的引物对，所述引物对14为如下(a27)或(a28)所示的引物对：

(a25)由序列表中序列20和序列21所示的两条单链DNA分子组成的引物对；

(a26)由将序列表中序列20和序列21经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a25)中所述引物对功能相同的引物对；

(a27)由序列表中序列20和序列22所示的两条单链DNA分子组成的引物对；

(a28)由将序列表中序列20和序列22经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a27)中所述引物对功能相同的引物对；

8)用于检测所述rs3759584位点的引物对15和引物对16；所述引物对15为如下(a29)或(a30)所示的引物对，所述引物对16为如下(a31)或(a32)所示的引物对：

(a29)由序列表中序列23和序列24所示的两条单链DNA分子组成的引物对；

(a30)由将序列表中序列23和序列24经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a29)中所述引物对功能相同的引物对；

(a31)由序列表中序列23和序列25所示的两条单链DNA分子组成的引物对；

(a32)由将序列表中序列23和序列25经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a31)中所述引物对功能相同的引物对；

9)用于检测所述rs4340位点的引物对17和引物对18；所述引物对17为如下(a33)或(a34)所示的引物对，所述引物对18为如下(a35)或(a36)所示的引物对：

(a33)由序列表中序列26和序列27所示的两条单链DNA分子组成的引物对；

(a34)由将序列表中序列26和序列27经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a33)中所述引物对功能相同的引物对；

(a35)由序列表中序列26和序列28所示的两条单链DNA分子组成的引物对；

(a36)由将序列表中序列26和序列28经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a35)中所述引物对功能相同的引物对；

10)用于检测所述rs11549465位点的引物对19和引物对20；所述引物对19为如下(a37)或(a38)所示的引物对，所述引物对20为如下(a39)或(a40)所示的引物对：

(a37)由序列表中序列29和序列30所示的两条单链DNA分子组成的引物对；

(a38)由将序列表中序列29和序列30经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a37)中所述引物对功能相同的引物对；

(a39)由序列表中序列29和序列31所示的两条单链DNA分子组成的引物对；

(a40)由将序列表中序列29和序列31经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a39)中所述引物对功能相同的引物对；

11)用于检测所述rs1800544位点的引物对21和引物对22；所述引物对21为如下(a41)或(a42)所示的引物对，所述引物对22为如下(a43)或(a44)所示的引物对：

(a41)由序列表中序列32和序列33所示的两条单链DNA分子组成的引物对；

(a42)由将序列表中序列32和序列33经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a41)中所述引物对功能相同的引物对；

(a43)由序列表中序列32和序列34所示的两条单链DNA分子组成的引物对；

(a44)由将序列表中序列32和序列34经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a43)中所述引物对功能相同的引物对；

12)用于检测所述rs699947位点的引物对23和引物对24；所述引物对23为如下(a45)或(a46)所示的引物对，所述引物对24为如下(a47)或(a48)所示的引物对：

(a45)由序列表中序列35和序列36所示的两条单链DNA分子组成的引物对；

(a46)由将序列表中序列35和序列36经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a45)中所述引物对功能相同的引物对；

(a47)由序列表中序列35和序列37所示的两条单链DNA分子组成的引物对；

(a48)由将序列表中序列35和序列37经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a47)中所述引物对功能相同的引物对。

根据需要，在所述引物对组中，序列1、序列4、序列7、序列10、序列12、序列14、序列17、序列20、序列23、序列26、序列29、序列32和序列35所示的单链DNA分子的5’末端可以连接荧光基团，如TAMRA。

根据需要，在所述引物对组中，序列2、序列3、序列5、序列6、序列8、序列9、序列11、序列13、序列15、序列16、序列18、序列19、序列21、序列22、序列24、序列25、序列27、序列28、序列30、序列31、序列33、序列34、序列36和序列37所示的单链DNA分子经过人工修饰；所述人工修饰具体为：在这些单链DNA分子自5’末端起的第25位和第26位之间连接连续的12个“—CH₂—”结构。这样的话，当DNA聚合酶扩增到该结构时，由于DNA聚合酶无法识别和跨越该结构而终止产物链的延伸。这使得每条PCR产物链一端都带有一段25个碱基的tagA标签序列粘性末端，另一端具有TAMRA荧光标记，在杂交的过程中无需单链制备，tagA标签序列粘性末端与基因芯片上的tagB序列互补配对，在芯片清洗的过程中另一端TAMRA荧光标记不会丢失，在芯片扫描的过程中激发荧光。

本发明的第二个目的是提供一种用于检测人基因组中所述12个SNP位点的成套单链DNA。

本发明所提供的用于检测人基因组中所述12个SNP位点的成套单链DNA，具体由探针组和所述引物对组组成；

所述探针组由如下1)-12)组成：

1)用于检测所述rs7181866位点的单链DNA探针1(记为tagB1)和单链DNA探针2(记为tagB2)；所述单链DNA探针1(tagB1)的核苷酸序列如序列表中序列2的自5’末端起第1-25位的反向互补序列所示；所述单链DNA探针2(tagB2)的核苷酸序列如序列表中序列3的自5’末端起第1-25位的反向互补序列所示；

2)用于检测所述rs6311位点的单链DNA探针3(记为tagB3)和单链DNA探针4(记为tagB4)；所述单链DNA探针3(tagB3)的核苷酸序列如序列表中序列5的自5’末端起第1-25位的反向互补序列所示；所述单链DNA探针4(tagB4)的核苷酸序列如序列表中序列6的自5’末端起第1-25位的反向互补序列所示；

3)用于检测所述rs7305115位点的单链DNA探针5(记为tagB5)和单链DNA探针6(记为tagB6)；所述单链DNA探针5(tagB5)的核苷酸序列如序列表中序列8的自5’末端起第1-25位的反向互补序列所示；所述单链DNA探针6(tagB6)的核苷酸序列如序列表中序列9的自5’末端起第1-25位的反向互补序列所示；

4)用于检测所述rs4680位点的单链DNA探针7(记为tagB7)和单链DNA探针8(记为tagB8)；所述单链DNA探针7(tagB7)的核苷酸序列如序列表中序列11的自5’末端起第1-25位的反向互补序列所示；所述单链DNA探针8(tagB8)的核苷酸序列如序列表中序列13的自5’末端起第1-25位的反向互补序列所示；

5)用于检测所述rs1799983位点的单链DNA探针9(记为tagB9)和单链DNA探针10(记为tagB10)；所述单链DNA探针9(tagB9)的核苷酸序列如序列表中序列15的自5’末端起第1-25位的反向互补序列所示；所述单链DNA探针10(tagB10)的核苷酸序列如序列表中序列16的自5’末端起第1-25位的反向互补序列所示；

6)用于检测所述rs5065位点的单链DNA探针11(记为tagB11)和单链DNA探针12(记为tagB12)；所述单链DNA探针11(tagB11)的核苷酸序列如序列表中序列18的自5’末端起第1-25位的反向互补序列所示；所述单链DNA探针12(tagB12)的核苷酸序列如序列表中序列19的自5’末端起第1-25位的反向互补序列所示；

7)用于检测所述rs1801133位点的单链DNA探针13(记为tagB13)和单链DNA探针14(记为tagB14)；所述单链DNA探针13(tagB13)的核苷酸序列如序列表中序列21的自5’末端起第1-25位的反向互补序列所示；所述单链DNA探针14(tagB14)的核苷酸序列如序列表中序列22的自5’末端起第1-25位的反向互补序列所示；

8)用于检测所述rs3759584位点的单链DNA探针15(记为tagB15)和单链DNA探针16(记为tagB16)；所述单链DNA探针15(tagB15)的核苷酸序列如序列表中序列24的自5’末端起第1-25位的反向互补序列所示；所述单链DNA探针16(tagB16)的核苷酸序列如序列表中序列25的自5’末端起第1-25位的反向互补序列所示；

9)用于检测所述rs4340位点的单链DNA探针17(记为tagB17)和单链DNA探针18(记为tagB18)；所述单链DNA探针17(tagB17)的核苷酸序列如序列表中序列27的自5’末端起第1-25位的反向互补序列所示；所述单链DNA探针18(tagB18)的核苷酸序列如序列表中序列28的自5’末端起第1-25位的反向互补序列所示；

10)用于检测所述rs11549465位点的单链DNA探针19(记为tagB19)和单链DNA探针20(记为tagB20)；所述单链DNA探针19(tagB19)的核苷酸序列如序列表中序列30的自5’末端起第1-25位的反向互补序列所示；所述单链DNA探针20(tagB20)的核苷酸序列如序列表中序列31的自5’末端起第1-25位的反向互补序列所示；

11)用于检测所述rs1800544位点的单链DNA探针21(记为tagB21)和单链DNA探针22(记为tagB22)；所述单链DNA探针21(tagB21)的核苷酸序列如序列表中序列33的自5’末端起第1-25位的反向互补序列所示；所述单链DNA探针22(tagB22)的核苷酸序列如序列表中序列34的自5’末端起第1-25位的反向互补序列所示；

12)用于检测所述rs699947位点的单链DNA探针23(记为tagB23)和单链DNA探针24(记为tagB24)；所述单链DNA探针23(tagB23)的核苷酸序列如序列表中序列36的自5’末端起第1-25位的反向互补序列所示；所述单链DNA探针24(tagB24)的核苷酸序列如序列表中序列37的自5’末端起第1-25位的反向互补序列所示。

其中，所述单链DNA探针1(tagB1)用于检测所述引物对1的扩增结果；所述单链DNA探针2(tagB2)用于检测所述引物对2的扩增结果；所述单链DNA探针3(tagB3)用于检测所述引物对3的扩增结果；……；所述单链DNA探针24(tagB24)用于检测所述引物对24的扩增结果。

本发明的第三个目的是提供一种用于检测人基因组中所述12个SNP位点的试剂盒。

本发明所提供的用于检测人基因组中12个SNP位点的试剂盒，含有所述引物对组以及杂交芯片；

所述杂交芯片是按照包括如下步骤的方法制备获得的：将通式为“NH₂-(T)_n-杂交探针序列”的24种单链检测探针分别通过氨基与醛基的反应固定到醛基修饰化的固相载体(如玻片)上，获得所述杂交芯片；所述通式中的(T)_n表示n个连续的T，n为大于等于5，且小于等于30的整数；所述通式中对应于所述24种单链检测探针的24种tagB标签为所述探针组中的24条单链DNA探针。

根据需要，所述试剂盒中还含有杂交液；所述杂交液中含有经荧光标记的无关单链DNA分子；所述无关单链DNA分子为非源自于人基因组的单链DNA分子。

所述杂交芯片的制备方法还包括将表面化学质控探针QC、和/或杂交质控探针PC、和/或阴性对照探针BC通过氨基与醛基的反应固定到所述醛基修饰化的固相载体(如玻片)上的步骤；

所述表面化学质控探针QC、所述杂交质控探针PC和所述阴性对照探针均为单链探针；所述表面化学质控探针QC的一端经氨基修饰，另一端具有荧光标记(如Hex)；所述杂交质控探针PC的一端经氨基修饰，且能与所述杂交液中的所述无关单链DNA分子杂交；所述阴性对照探针BC的一端经氨基修饰，且与源自于所述细菌耐药基因的任何单链DNA分子均不能杂交。

进一步，在本发明中，所述表面化学质控探针QC自5’端到3’端的结构组成为“NH₂-TCACTTGCTTCCGTTGAGG-Hex”；所述杂交质控探针PC自5’端到3’端的结构组成为“NH₂-TTTTTTTTTTTTCCTCAACGGAAGCAAGTGAT”；所述阴性对照探针BC自5’端到3’端的结构组成为“NH₂-TTTTTTTTTTTTGTTGCTTCTGGAATGAGTTTGCT”。

所的引物对组或所述成套单链DNA或所述试剂盒在如下(a)或(b)中的应用也属于本发明的保护范围：

(a)检测人基因组中所述12个SNP位点，或制备用于检测人基因组中所述12个SNP位点的产品；

(b)选拔飞行员，或制备用于选拔飞行员的产品。

在所述(b)所示的应用中，选择具有如下(1)-(13)所示基因型的人作为候选飞行员：

(1)所述rs7181866位点为GG基因型：人基因组中所述rs7181866位点处的核苷酸为G的纯合型；

(2)所述rs6311位点为TT基因型：人基因组中所述rs6311位点处的核苷酸为T的纯合型；

(3)所述rs7305115位点为AA基因型：人基因组中所述rs7305115位点处的核苷酸为A的纯合型；

(4)所述rs4680位点为AA基因型：人基因组中所述rs4680位点处的核苷酸为A的纯合型；

(5)所述rs1799983位点为GG基因型：人基因组中所述rs1799983位点处的核苷酸为G的纯合型；

(6)所述rs5065位点为AA基因型：人基因组中所述rs5065位点处的核苷酸为A的纯合型；

(7)所述rs1801133位点为CC基因型：人基因组中所述rs1801133位点处的核苷酸为C的纯合型；

(8)所述rs3759584位点为TT基因型：人基因组中所述rs3759584位点处的核苷酸为T的纯合型；

(9)所述rs4340位点为插入纯合基因型：人基因组中所述rs4340位点处为插入序列表中序列38的纯合型；

(10)所述rs11549465位点为TT基因型：人基因组中所述rs11549465位点处的核苷酸为T的纯合型；

(11)所述rs1800544位点为CC基因型：人基因组中所述rs1800544位点处的核苷酸为C的纯合型；

(12)所述rs699947位点为AA基因型：人基因组中所述rs699947位点处的核苷酸为A的纯合型。

所述引物对组或所述成套单链DNA在制备所述试剂盒中的应用也属于本发明的保护范围。

本发明以加速度耐力相关基因、缺氧耐力相关基因、心理和认知相关基因及心脑血管疾病相关基因等为候选检测基因(血管紧张素转换酶基因(rs4340)、α2-肾上腺素能受体基因(rs1800544)、脑型肌酸激酶基因(rs3759584)为加速度耐力相关基因，低氧诱导因子1基因(rs11549465)、核呼吸因子1(rs7181866)为缺氧耐力相关基因，5羟色胺2A受体基因(rs6311)、色胺酸羟化酶基因(rs7305115)、儿茶酚胺氧位甲基转移酶基因(rs4680)为心理和认知相关基因，内皮型一氧化氮合酶基因(rs1799983)、心钠素ANP基因(rs5065)、亚甲基四氢叶酸还原酶基因(rs1801133)、血管内皮细胞生长因子基因(rs699947)为心脑血管疾病相关基因)开发一套基因芯片检测试剂盒。本发明提供的试剂盒支持高通量、快速、准确地同时检测12个飞行员LOD易感基因SNP位点，本发明为飞行人员选拔提供参考。

附图说明

图1为杂交芯片的点阵排布示意图。其中，A为各SNP位点rs号排布示意图，B为各SNP探针编号排布，C为各SNP位点对应的基因型。

图2为模板的用量为0.5ng(对应模板浓度为0.25ng/μl)采用通用芯片检测结果。其中，A为照片；B为结果读取。

图3为模板的用量为1ng(对应模板浓度为0.5ng/μl)到50ng(对应模板浓度为25ng/μl)范围内采用通用芯片检测结果。其中，A为照片；B为结果读取。

图4为模板的用量为60ng(对应模板浓度为30ng/μl)采用通用芯片检测结果。其中，A为照片；B为结果读取。

图5为第一位待测者的采用通用芯片检测后的照片及结果读取。其中，A为照片，B为结果读取。

图6为第二位待测者的采用通用芯片检测后的照片及结果读取。其中，A为照片，B为结果读取。

图7为第三位待测者的采用通用芯片检测后的照片及结果读取。其中，A为照片，B为结果读取。

图8为第四位待测者的采用通用芯片检测后的照片及结果读取。其中，A为照片，B为结果读取。

具体实施方式

下述实施例中所使用的实验方法如无特殊说明，均为常规方法。

下述实施例中所用的材料、试剂等，如无特殊说明，均可从商业途径得到。

实施例1、用于检测飞行员LOD易感基因多态性的试剂盒的制备及其使用

一、用于检测飞行员LOD易感基因多态性的试剂盒的组装与制备

(一)针对12个飞行员LOD易感基因SNP位点设计引物

12个飞行员LOD易感基因SNP位点的信息分析结果见表1。

表1 12个飞行员LOD易感基因SNP位点的信息

本发明的发明人进一步针对以上各SNP位点设计了两对引物，每对引物中的一条引物5’末端链接一个特异的tagA标签序列，另一条引物的5’末端具有TAMRA荧光标记，含有tagA标签的引物进行人工修饰，具体做法是：在tagA标签序列与其后的基因特异扩增序列之间连接连续的12个“—CH₂—”结构，当DNA聚合酶扩增到该结构时，由于DNA聚合酶无法识别和跨越该结构而终止产物链的延伸。这使得每条PCR产物链一端都带有一段25个碱基的tagA标签序列粘性末端，另一端具有TAMRA荧光标记，在杂交的过程中无需单链制备，tagA标签序列粘性末端与基因芯片上的tagB序列互补配对，在芯片清洗的过程中另一端TAMRA荧光标记不会丢失，在芯片扫描的过程中激发荧光。

1、针对rs号为rs7181866的SNP位点设计两对引物

第一对引物(以人基因组DNA为模板，只有该SNP位点处的核苷酸为A时可以得到扩增产物，扩增产物为228bp)：

1-F-A-31-3T-tagA1(正向引物，下划线标注处为tagA1标签，序列表的序列2)：

5’-ATCTCGGCGGGTCTATCTACATCTTATAAAGATCCAACATAGAATAGGAGAGATTA-3’；

1-R-T-TAMRA(反向引物，其5’末端具有TAMRA荧光标记，序列表的序列1)：

5’-CGCATCCCAAACTCTCCACTG-3’。

第二对引物(以人基因组DNA为模板，只有该SNP位点的核苷酸为G时可以得到扩增产物，扩增产物为228bp)：

1-F-G-28-3T-tagA2(正向引物，下划线标注处为tagA2标签，序列表的序列3)：

5’-CTGTTCCGCATACCTACTACAGTTGAAGATCCAACATAGAATAGGAGAGATTG-3’；

1-R-T-TAMRA(反向引物，其5’末端具有TAMRA荧光标记，序列表的序列1)：

5’-CGCATCCCAAACTCTCCACTG-3’。

2、针对rs号为rs6311的SNP位点设计两对引物

第一对引物(以人基因组DNA为模板，只有该SNP位点的核苷酸为C时可以得到扩增产物，扩增产物为169bp)：

2-F-C-21-2T-tagA3(正向引物，下划线标注处为tagA3标签，序列表的序列5)：

5’-GAAAGTCCCGCGGTTCATGTTTACTCTCGGAGTGCTGTGAGTGTTC-3’。

2-R-T-TAMRA(反向引物，其5’末端具有TAMRA荧光标记，序列表的序列4)：

5’-GTGCTAATAGTTTATCAGAGTTATCACC-3’；

第二对引物(以人基因组DNA为模板，只有该SNP位点的核苷酸为T时可以得到扩增产物，扩增产物为169bp)：

2-F-T-21-2T-tagA4(正向引物，下划线标注处为tagA4标签，序列表的序列6)：

5’-AGATAGGGGTCCCCCGAATTAAAACCTCGGAGTGCTGTGAGTGTTT-3’；

2-R-T-TAMRA(反向引物，其5’末端具有TAMRA荧光标记，序列表的序列4)：

5’-GTGCTAATAGTTTATCAGAGTTATCACC-3’。

3、针对rs号为rs7305115的SNP位点设计的两对引物。

第一对引物(以人基因组DNA为模板，只有该SNP位点的核苷酸为G时可以得到扩增产物，扩增产物为178bp)：

3-F-T-TAMRA(正向引物，其5’末端具有TAMRA荧光标记，序列表的序列7)：

5’-AGGTCTGGCTTCACGGTGAG-3’；

3-R-G-25-2T-tagA5(反向引物，下划线标注处为tagA5标签，序列表的序列8)：

5’-TAGCGACGCGTAGATAATACCAGCTCTTTAATGTAGGTACTCACGGTTTC-3’。

第二对引物(以人基因组DNA为模板，只有该SNP位点的核苷酸为A时可以得到扩增产物，扩增产物为178bp)：

3-F-T-TAMRA(正向引物，其5’末端具有TAMRA荧光标记，序列表的序列7)：

5’-AGGTCTGGCTTCACGGTGAG-3’；

3-R-A-25-2T-tagA6(反向引物，下划线标注处为tagA6标签，序列表的序列9)：

5’-CGCAGTACTTAGTGTCCGAAACGGACTTTAATGTAGGTACTCACGGTTTT-3’。

4、针对rs号为rs4680的SNP位点设计的两对引物。

第一对引物(以人基因组DNA为模板，只有该SNP位点的核苷酸为G时可以得到扩增产物，扩增产物为323bp)：

4-F-G-23-2T-tagA7(正向引物，下划线标注处为tagA7标签，序列表的序列11)：

5’-TAAGCGGAGGTTTCGAATACTGCACGCGGATGGTGGATTTCGCTGGTG-3’；

4-R-T-TAMRA(反向引物，其5’末端具有TAMRA荧光标记，序列表的序列10)：

5’-TAGGGTTCTGGGATGACAAGG-3’。

第二对引物(以基因组DNA为模板，只有该SNP位点的核苷酸为A时可以得到扩增产物，扩增产物为239bp)：

4-F-T-TAMRA(正向引物，其5’末端具有TAMRA荧光标记，序列表的序列12)：

5’-TGCACAGGCAAGATCGTGGAC-3’；

4-R-A-25-3G-tagA8(反向引物，下划线标注处为tagA8标签，序列表的序列13)：

5’-GGTCTATACGAGATACGCCCGCTTACAGGCATGCACACCTTGTCCTTGAT-3’。

5、针对rs号为rs1799983的SNP位点设计的两对引物。

第一对引物(以基因组DNA为模板，只有该SNP位点的核苷酸为G时可以得到扩增产物，扩增产物为245bp)：

5-F-T-TAMRA(正向引物，其5’末端具有TAMRA荧光标记，序列表的序列14)：

5’-GTGGTCACGGAGACCCAG-3’。

5-R-G-20-2A-tagA9(反向引物，下划线标注处为tagA9标签，序列表的序列15)：

5’-CTTATTCGTACGAGCCAACACTTGGGAAGGAAGAGTTCTGGGGAC-3’。

第二对引物(以基因组DNA为模板，只有该SNP位点的核苷酸为T时可以得到扩增产物，扩增产物为245bp)：

5-F-T-TAMRA(正向引物，其5’末端具有TAMRA荧光标记，序列表的序列14)：

5’-GTGGTCACGGAGACCCAG-3’。

5-R-T-23-2A-tagA10(反向引物，下划线标注处为tagA10标签，序列表的序列16)：

5’-AACACTTTCAGTATCGCGAGGGAGTGCAGAAGGAAGAGTTCTGGGGAA-3’。

6、针对rs号为rs5065的SNP位点设计的两对引物。

第一对引物(以基因组DNA为模板，只有该SNP位点的核苷酸为A时可以得到扩增产物，扩增产物为160bp)：

6-F-A-21-3G-tagA11(正向引物，下划线标注处为tagA11标签，序列表的序列18)：

5’-TTGTGGGCCCTCTATACCAGTATGGCCTCCCTGGCTGTTATCTGCA-3’；

6-R-T-TAMRA(反向引物，其5’末端具有TAMRA荧光标记，序列表的序列17)：

5’-GAAGCAGGTGGTCAGTAATCAAG-3’。

第二对引物(以基因组DNA为模板，只有该SNP位点的核苷酸为G时可以得到扩增产物，扩增产物为160bp)：

6-F-G-21-3G-tagA12(正向引物，下划线标注处为tagA12标签，序列表的序列19)：

5’-CACAACCGCTATTAGACCGTGTGCTCCTCCCTGGCTGTTATCTGCG-3’；

6-R-T-TAMRA(反向引物，其5’末端具有TAMRA荧光标记，序列表的序列17)：

5’-GAAGCAGGTGGTCAGTAATCAAG-3’。

7、针对rs号为rs1801133的SNP位点设计的两对引物。

第一对引物(以基因组DNA为模板，只有该SNP位点的核苷酸为C时可以得到扩增产物，扩增产物为272bp)：

7-F-T-TAMRA(正向引物，其5’末端具有TAMRA荧光标记，序列表的序列20)：

5’-TAGTTCAGGCTGTGCTGTGCT-3’；

7-R-C-22-2A-tagA13(反向引物，下划线标注处为tagA13标签，序列表的序列21)：

5’-CCAGTAGGGCTCTCGTACACAATCTAGCTGCGTGATGATGAAATCAG-3’。

第二对引物(以基因组DNA为模板，只有该SNP位点的核苷酸为T时可以得到扩增产物，扩增产物为272bp)：

7-F-T-TAMRA(正向引物，其5’末端具有TAMRA荧光标记，序列表的序列20)：

5’-TAGTTCAGGCTGTGCTGTGCT-3’；

7-R-T-22-2A-tagA14(反向引物，下划线标注处为tagA14标签，序列表的序列22)：

5’-CATACGCGCGTAGCAAGTAGTACTCAGCTGCGTGATGATGAAATCAA-3’。

8、针对rs号为rs3759584的SNP位点设计的两对引物。

第一对引物(以基因组DNA为模板，只有该SNP位点的核苷酸为C时可以得到扩增产物，扩增产物为159bp)：

8-F-T-TAMRA(正向引物，其5’末端具有TAMRA荧光标记，序列表的序列23)：

5’-TAGGTGCCTCAGAGCAGAAGG-3’；

8-R-C-21-3T-tagA15(反向引物，下划线标注处为tagA15标签，序列表的序列24)：

5’-GAGTTGGCGACGAGACAGTAGGATTGTGTCTCCTCTGCAGTGACTG-3’。

第二对引物(以基因组DNA为模板，只有该SNP位点的核苷酸为T时可以得到扩增产物，扩增产物为159bp)：

8-F-T-TAMRA(正向引物，其5’末端具有TAMRA荧光标记，序列表的序列23)：

5’-TAGGTGCCTCAGAGCAGAAGG-3’；

8-R-T-21-3T-tagA16(反向引物，下划线标注处为tagA16标签，序列表的序列25)：

5’-GGCATAGTATCCCGACCGTACTAACGTGTCTCCTCTGCAGTGATCA-3’。

9、针对rs号为rs4340的SNP位点设计的两对引物。

第一对引物(以基因组DNA为模板，只有该SNP位点的核苷酸为“缺失”时可以得到扩增产物，扩增产物为119bp)：

9-F-QS-26-2C-tagA17(正向引物，下划线标注处为tagA17标签，序列表的序列27)：

5’-GTGATACGCCCCGGCAACTTAGTAACTGCTGCCTATACAGTCACTTTTACG-3’；

9-R-T-TAMRA(反向引物，其5’末端具有TAMRA荧光标记，序列表的序列26)：

5’-CTTAGCTCACCTCTGCTTGTAAG-3’。

第二对引物(以基因组DNA为模板，只有该SNP位点的核苷酸为“插入”时可以得到扩增产物，扩增产物为235bp)：

9-F-CR-27-tagA18(正向引物，下划线标注处为tagA18标签，序列表的序列28)：

5’-CATGGAGTTGTAAGGTGCCTACTCTCGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAG-3’；

9-R-T-TAMRA(反向引物，其5’末端具有TAMRA荧光标记，序列表的序列26)：

5’-CTTAGCTCACCTCTGCTTGTAAG-3’。

10、针对rs号为rs11549465的SNP位点设计的两对引物。

第一对引物(以基因组DNA为模板，只有该SNP位点的核苷酸为C时可以得到扩增产物，扩增产物为136bp)：

10-F-T-TAMRA(正向引物，其5’末端具有TAMRA荧光标记，序列表的序列29)：

5’-AGGACACAGATTTAGACTTGGAGATG-3’；

10-R-C-25-3C-5T-tagA19(反向引物，下划线标注处为tagA19标签，序列表的序列30)：

5’-AACGAAGTCATAGGATCCCTCGAGTGGCTTGCGGAACTGCTTTCTTACGG-3’。

第二对引物(以基因组DNA为模板，只有该SNP位点的核苷酸为T时可以得到扩增产物，扩增产物为136bp)：

10-F-T-TAMRA(正向引物，其5’末端具有TAMRA荧光标记，序列表的序列29)：

5’-AGGACACAGATTTAGACTTGGAGATG-3’；

10-R-T-25-3C-5T-tagA20(反向引物，下划线标注处为tagA20标签，序列表的序列31)：

5’-GTCTGGTCGACCCTATCACATCAAAGGCTTGCGGAACTGCTTTCTTACGA-3’。

11、针对rs号为rs1800544的SNP位点设计的两对引物。

第一对引物(以基因组DNA为模板，只有该SNP位点的核苷酸为C时可以得到扩增产物，扩增产物为270bp)：

11-F-T-TAMRA(正向引物，其5’末端具有TAMRA荧光标记，序列表的序列32)：

5’-CTTCCTCCCTCTCCAGGAC-3’。

11-R-C-22-3G-tagA21(反向引物，下划线标注处为tagA21标签，序列表的序列33)：

5’-GAGTGTAGCACACCGGGATTAGGTTTGGGAGTTGGCCATGCAGCGCC-3’。

第二对引物(以基因组DNA为模板，只有该SNP位点的核苷酸为G时可以得到扩增产物，扩增产物为270bp)：

11-F-T-TAMRA(正向引物，其5’末端具有TAMRA荧光标记，序列表的序列32)：

5’-CTTCCTCCCTCTCCAGGAC-3’。

11-R-G-22-3G-tagA22(反向引物，下划线标注处为tagA22标签，序列表的序列34)：

5’-ACAGCAACTATGTAACGTGCGAACCTGGGAGTTGGCCATGCAGCGCG-3’。

12、针对rs号为rs699947的SNP位点设计的两对引物。

第一对引物(以基因组DNA为模板，只有该SNP位点的核苷酸为A时可以得到扩增产物，扩增产物为153bp)：

12-F-A-19-3G-tagA23(正向引物，下划线标注处为tagA23标签，序列表的序列36)：

5’-ATAGGTTAAGTATCGGTGGAGCGTCGTAGGCCAGACCCTGGGAA-3’。

12-R-T-TAMRA(反向引物，其5’末端具有TAMRA荧光标记，序列表的序列35)：

5’-CTAGCTGGTTTCTGACCTGGC-3’；

第二对引物(以基因组DNA为模板，只有该SNP位点的核苷酸为C时可以得到扩增产物，扩增产物为153bp)：

12-F-C-19-3G-tagA24(正向引物，下划线标注处为tagA24标签，序列表的序列37)：

5’-GGCCCCCGTGAGATATCTTAATCCTGTAGGCCAGACCCTGGGAC-3’；

12-R-T-TAMRA(反向引物，其5’末端具有TAMRA荧光标记，序列表的序列35)：

5’-CTAGCTGGTTTCTGACCTGGC-3’。

(二)制备杂交芯片

杂交芯片为分别固定有24种单链检测探针的基片。每种检测探针都是一段氨基修饰的寡核苷酸探针，24种单链检测探针的通式为“NH₂-TTTTTTTTTTTTTTT-tag标签”，24种单链检测探针分别具有tagB1标签至tagB24标签，tagB1标签与tagA1标签反向互补，tagB2标签与tagA2标签反向互补，……，tagB24标签与tagA24标签反向互补。各检测探针分别用基因点样液(博奥生物集团有限公司产品，其产品目录号为CP.440010)溶解，终浓度为10μM，重复三次点制到醛基化修饰的玻片(博奥生物集团有限公司产品，其产品目录号为CP.420022-005)上，从而通过氨基与醛基的反应将24种探针固定到杂交芯片上。另外，同样通过氨基与醛基的反应将表面化学质控探针QC、杂交质控探针PC和阴性对照探针NC也固定到杂交芯片上。QC是一端带有Hex标记，另一端具有氨基修饰的单链寡核苷酸探针，用于观察芯片点样和固定的效率，其自5’端到3’端的结构组成为NH₂-TCACTTGCTTCCGTTGAGG-Hex。PC是一段氨基修饰的单链寡核苷酸探针，可以与杂交液中添加的经荧光标记的无关单链DNA分子(C-PC)杂交，用于杂交过程的质控，其自5’端到3’端的结构组成为NH₂-TTTTTTTTTTTTCCTCAACGGAAGCAAGTGAT。NC是一段氨基修饰的寡核苷酸探针，与杂交体系中的所有待检测序列均不会杂交，用于观察有无非特异杂交，其自5’端到3’端的结构组成为NH₂-TTTTTTTTTTTTGTTGCTTCTGGAATGAGTTTGCT。图1为杂交芯片的点阵排布示意图。

(三)用于检测飞行员LOD易感基因多态性的试剂盒的组成

本发明所提供的用于飞行员LOD易感基因多态性(即前文所述12种SNP位点)的试剂盒的含有：

(1)步骤(一)设计合成的24个引物对；

(2)步骤(二)制备的固定有24种检测探针以及表面化学质控探针QC、杂交质控探针PC和阴性对照探针BC的杂交芯片；

(3)杂交液；所述杂交液中含有经荧光标记的无关单链DNA分子(C-PC)，其核苷酸序列为5’-ATCACTTGCTTCCGTTGAGG-3’。

二、用于检测飞行员LOD易感基因多态性的试剂盒的使用方法

1、样品聚合酶链式反应(PCR)扩增

取待测者的外周血样本，提取基因组DNA，以其为模板，分别采用步骤一(一)设计合成的24个引物对进行PCR扩增。PCR反应体系(20μL)的组分如表2所示。PCR反应采用S1000^TM>

表2PCR反应体系(20μL)的组分

表3PCR反应程序

PCR反应结束后共得到13份PCR扩增产物。

2、芯片杂交

完成PCR扩增后，每个扩增体系取样，按照表4制备杂交体系，然后分别与步骤一(二)制备的芯片上的不同点杂交。采用1-F-A-31-3T-tagA1和1-R-T-TAMRA组成的引物对进行PCR扩增得到的扩增体系与芯片上固定有具有tagB1标签的探针的点杂交。采用1-F-G-28-3T-tagA2和1-R-T-TAMRA组成的引物对进行PCR扩增得到的扩增体系与芯片上固定有具有tagB2标签的探针的点杂交。采用2-F-C-21-2T-tagA3和2-R-T-TAMRA组成的引物对进行PCR扩增得到的扩增体系与芯片上固定有具有tagB3标签的探针的点杂交。采用2-F-T-21-2T-tagA4和2-R-T-TAMRA组成的引物对进行PCR扩增得到的扩增体系与芯片上固定有具有tagB4标签的探针的点杂交。采用3-F-T-TAMRA和3-R-G-25-2T-tagA5组成的引物对进行PCR扩增得到的扩增体系与芯片上固定有具有tagB5标签的探针的点杂交。采用3-F-T-TAMRA和3-R-A-25-2T-tagA6组成的引物对进行PCR扩增得到的扩增体系与芯片上固定有具有tagB6标签的探针的点杂交。采用4-F-G-23-2T-tagA7和4-R-T-TAMRA组成的引物对进行PCR扩增得到的扩增体系与芯片上固定有具有tagB7标签的探针的点杂交。采用4-F-T-TAMRA和4-R-A-25-3G-tagA8组成的引物对进行PCR扩增得到的扩增体系与芯片上固定有具有tagB8标签的探针的点杂交。采用5-F-T-TAMRA和5-R-G-20-2A-tagA9组成的引物对进行PCR扩增得到的扩增体系与芯片上固定有具有tagB9标签的探针的点杂交。采用5-F-T-TAMRA和5-R-T-23-2A-tagA10组成的引物对进行PCR扩增得到的扩增体系与芯片上固定有具有tagB10标签的探针的点杂交。采用6-F-A-21-3G-tagA11和6-R-T-TAMRA组成的引物对进行PCR扩增得到的扩增体系与芯片上固定有具有tagB11标签的探针的点杂交。采用6-F-G-21-3G-tagA12和6-R-T-TAMRA组成的引物对进行PCR扩增得到的扩增体系与芯片上固定有具有tagB12标签的探针的点杂交。采用7-F-T-TAMRA和7-R-C-22-2A-tagA13组成的引物对进行PCR扩增得到的扩增体系与芯片上固定有具有tagB13标签的探针的点杂交。采用7-F-T-TAMRA和7-R-T-22-2A-tagA14组成的引物对进行PCR扩增得到的扩增体系与芯片上固定有具有tagB14标签的探针的点杂交。采用8-F-T-TAMRA和8-R-C-21-3T-tagA15组成的引物对进行PCR扩增得到的扩增体系与芯片上固定有具有tagB15标签的探针的点杂交。采用8-F-T-TAMRA和8-R-T-21-3T-tagA16组成的引物对进行PCR扩增得到的扩增体系与芯片上固定有具有tagB16标签的探针的点杂交。采用9-F-QS-26-2C-tagA17和9-R-T-TAMRA组成的引物对进行PCR扩增得到的扩增体系与芯片上固定有具有tagB17标签的探针的点杂交。采用9-F-CR-27-tagA18和9-R-T-TAMRA组成的引物对进行PCR扩增得到的扩增体系与芯片上固定有具有tagB18标签的探针的点杂交。采用10-F-T-TAMRA和10-R-C-25-3C-5T-tagA19组成的引物对进行PCR扩增得到的扩增体系与芯片上固定有具有tagB19标签的探针的点杂交。采用10-F-T-TAMRA和10-R-T-25-3C-5T-tagA20组成的引物对进行PCR扩增得到的扩增体系与芯片上固定有具有tagB20标签的探针的点杂交。采用11-F-T-TAMRA和11-R-C-22-3G-tagA21组成的引物对进行PCR扩增得到的扩增体系与芯片上固定有具有tagB21标签的探针的点杂交。采用11-F-T-TAMRA和11-R-G-22-3G-tagA22组成的引物对进行PCR扩增得到的扩增体系与芯片上固定有具有tagB22标签的探针的点杂交。采用12-F-A-19-3G-tagA23和12-R-T-TAMRA组成的引物对进行PCR扩增得到的扩增体系与芯片上固定有具有tagB23标签的探针的点杂交。采用12-F-C-19-3G-tagA24和12-R-T-TAMRA组成的引物对进行PCR扩增得到的扩增体系与芯片上固定有具有tagB24标签的探针的点杂交。杂交体系(18μL)的组分见表4。

表4杂交体系(18μL)的组分

50℃杂交60min。从杂交盒中取出芯片浸入42℃的800ml洗液I(配方：水：780ml，20×SSC：12ml，10％SDS：8ml)中轻轻洗涤2min；再从洗液I中取出芯片浸入42℃的800ml洗液II(配方：水：797.5ml，20×SSC：2.5ml)中轻轻洗涤2min；最后1000转离心2min。

3、扫描及结果判定

芯片荧光信号采用LuxScan^TM>

根据扫描结果按照如下方法确定待测者基因组中前文所述12个SNP位点处的核苷酸：根据芯片上各SNP位点不同基因型的点阵排布，来确定各SNP位点的基因型，如rs7181866位点，若tagB1亮、tagB2不亮，检测结果为AA纯合型；若tagB1不亮、tagB2亮，检测结果为GG纯合型；若tagB1亮、tagB2亮，检测结果为AG杂合型。

选择具有如下(1)-(13)所示基因型的人作为候选飞行员：

(1)所述rs7181866位点为GG基因型：人基因组中所述rs7181866位点处的核苷酸为G的纯合型；

(2)所述rs6311位点为TT基因型：人基因组中所述rs6311位点处的核苷酸为T的纯合型；

(3)所述rs7305115位点为AA基因型：人基因组中所述rs7305115位点处的核苷酸为A的纯合型；

(4)所述rs4680位点为AA基因型：人基因组中所述rs4680位点处的核苷酸为A的纯合型；

(5)所述rs1799983位点为GG基因型：人基因组中所述rs1799983位点处的核苷酸为G的纯合型；

(6)所述rs5065位点为AA基因型：人基因组中所述rs5065位点处的核苷酸为A的纯合型；

(7)所述rs1801133位点为CC基因型：人基因组中所述rs1801133位点处的核苷酸为C的纯合型；

(8)所述rs3759584位点为TT基因型：人基因组中所述rs3759584位点处的核苷酸为T的纯合型；

(9)所述rs4340位点为插入纯合基因型：人基因组中所述rs4340位点处为插入序列表中序列38的纯合型；

(10)所述rs11549465位点为TT基因型：人基因组中所述rs11549465位点处的核苷酸为T的纯合型；

(11)所述rs1800544位点为CC基因型：人基因组中所述rs1800544位点处的核苷酸为C的纯合型；

(12)所述rs699947位点为AA基因型：人基因组中所述rs699947位点处的核苷酸为A的纯合型。

实施例2、用于检测飞行员LOD易感基因多态性的试剂盒检测线的测定

用于检测飞行员LOD易感基因多态性的试剂盒的检测线的测定，取一位待测者的外周血样本，提取基因组DNA，以其为模板，按照实施例1步骤二进行操作，利用nanodrop测量模板的核酸浓度，按0.1、0.25、0.5、1.0、5.0、10.0、25.0、30.0、40.0、50.0、60.0、70.0、80.0、100.0ng/μl的梯度进行稀释，检测待测基因组中前文所述12个SNP位点处的核苷酸及对应基因型，具体判定方法参见实施例1步骤二3。每浓度梯度采用三个通用芯片进行重复检测。与通过Sanger法测序确认所述12个SNP位点的基因型进行比较，实验结果表明，模板的核酸浓度在1ng到50ng范围内，三个通用芯片检测读取的结果均与对应位点测序的结果一致。模板的核酸浓度低于1ng，或高于50ng，三个通用芯片检测读取的结果与对应位点测序的结果一致性较差，部分杂交结果如下。

模板的用量为0.5ng(对应模板浓度为0.25ng/μl)采用通用芯片检测后的照片见图2中A，结果读取见图2中B，与测序结果比较结果发现有假阴性，无法确定样品各SNP位点的基因型。

模板的用量为1ng(对应模板浓度为0.5ng/μl)到50ng(对应模板浓度为25ng/μl)范围内采用通用芯片检测后的照片见图3中A，结果读取见图3中B，与测序结果完全一致。

模板的用量为60ng(对应模板浓度为30ng/μl)采用通用芯片检测后的照片见图4中A，结果读取见图4中B，与测序结果比较结果发现有假阳性，无法确定样品各SNP位点的基因型。

实施例3、实际临床样品的检测

一、待测者

待测者为4位知情同意的志愿者，均已通过Sanger法测序确认所述12个SNP位点的基因型。

二、检测待测者的飞行员LOD易感基因多态性

取待测者的外周血样本，提取基因组DNA，以其为模板，按照实施例1步骤二进行操作，检测待测基因组中前文所述12个SNP位点处的核苷酸及对应基因型，具体判定方法参见实施例1步骤二3。每位待测者采用三个通用芯片进行重复检测。

结果表明，每位待测者采用三个通用芯片检测读取的结果均与全基因组测序的结果一致。

第一位待测者的采用通用芯片检测后的照片见图5中A，结果读取见图5中B。

第二位待测者的采用通用芯片检测后的照片见图6中A，结果读取见图6中B。

第三位待测者的采用通用芯片检测后的照片见图7中A，结果读取见图7中B。

第四位待测者的采用通用芯片检测后的照片见图8中A，结果读取见图8中B。

四位待测者12个SNP位点的基因型结果见表5。

表5 4个待测者12个SNP位点基因型检测结果

注：表中，1代表rs号为rs7181866的SNP位点。2代表rs号为rs6311的SNP位点。3代表rs号为rs7305115的SNP位点。4代表rs号为rs4680的SNP位点。5代表rs号为rs1799983的SNP位点。6代表rs号为rs5065的SNP位点。7代表rs号为rs1801133的SNP位点。8代表rs号为rs3759584的SNP位点。9代表rs号为rs4340的SNP位点(CR表示“插入”，QS表示“缺失”)。10代表rs号为rs11549465的SNP位点。11代表rs号为rs1800544的SNP位点。12代表rs号为rs699947的SNP位点。

综合分析，这四位志愿者都不是最佳人选，相对第四位志愿者比其它三位更适合。