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一种利用SLAF‑seq技术开发芒属植物SNP分子标记进行亲缘关系鉴定的方法

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本发明公开了一种利用SLAF‑seq技术开发芒属植物SNP分子标记进行亲缘关系鉴定的方法。包括以下步骤：1)设计标记开发方案；2)选择最适的酶切方案；3)分别提取基因组DNA进行酶切，构建SLAF‑seq测序文库后测序；4)先对单个样品进行SLAF标签的开发，然后得到的所有SLAF标签进行相似性聚类得到该群体的SLAF标签；5)对群体SLAF标签进行等位基因数和基因序列差异等多态性分析，将其中SNP作为多态性标记；6)对亲本编码基因型，一个字母代表一种基因型，确定分离类型后，再检测子代基因型，用相应字母表示SNP编码基因型；7)选取样品缺失数较少的SNP Marker，提取所有的SNP位点，统计子代的SNP异常分型比率，通过子代SNP异常分型比率是否高于阈值，判断子代和亲本的亲缘关系。

著录项

公开/公告号CN107034302A

专利类型发明专利
公开/公告日2017-08-11

原文格式PDF
申请/专利权人湖南农业大学;
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申请/专利号CN201710422851.9
发明设计人陈智勇;胡忠红;
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申请日2017-06-07
分类号C12Q1/68(20060101);
代理机构43113 长沙正奇专利事务所有限责任公司;
代理人何为;周栋
地址 410128 湖南省长沙市芙蓉区东湖农大路1号
入库时间 2023-06-19 02:58:05

法律信息

法律状态公告日

法律状态信息

法律状态
2020-08-25

发明专利申请公布后的撤回 IPC(主分类):C12Q1/68 申请公布日:20170811 申请日:20170607

发明专利申请公布后的撤回
2017-09-05

实质审查的生效 IPC(主分类):C12Q1/68 申请日:20170607

实质审查的生效
2017-08-11

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1. 一种利用SLAF‑seq技术开发芒属植物SNP分子标记进行亲缘关系鉴定的方法 [P] . 中国专利： CN107034302A . 2017-08-11
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3. Expressu00e7o tapes, sequ00dcu00cancia nucleotu00cddica isolated, vector, host cu00c9lula transgu00canica or body nu00e7o cu00c9lula human, plant or plant transgu00canica, methods to identify and / or isolate a sequ00dcu00cancia nucleotu00cddica regulator of transcriu00c7u00e7o, to provide or produce a tape D And expressu00e7o transgu00canica, and to provide a sequ00dcu00cancia nucleotu00cddica regulatory transcriu00c7u00e7o sintu00c9tica, and.Sequ00dcu00cancia regulatory transcriu00c7u00e7o sintu00c9tica [P] . BRPI0607378A2 . 2010-03-23

机译：表达带，分离的seq u00dc cancia核苷酸，载体，人，植物或植物的宿主，植物或植物的transg u00canica核糖体，鉴定和/或分离方法seq u00dc u00cancia nucleot u00cddica调节器，以提供或生产磁带D并表达 u00e7o transg u00canica，并提供seq u00dc u00cancia核苷酸 u00cddica调控性cricri u00c7 u00c7 u00c7 u00c9tica和.seq u00dc u00cancia监管转录 u00c7 u00e7o sint u00c9tica
4. METHOD FOR MOLECULAR LABELLING, BASED ON MICROSATELLITE LOCI, INTENDED FOR GENETIC CERTIFICATION OF PLANT VARIETY OF RUBUS GENUS PLANTS [P] . 俄罗斯专利： RU2732922C2 . 2020-09-24

机译：基于微卫星LOCI的分子标记方法，用于遗传鉴定属植物的植物新品种
5. Uses of a reference DNA SEQ and a proteu00ecna with activity of phosphoribosyl pyrophosphate sintease - 1,Processes for the identification of substances that inhibit the activity of phosphoribosyl pyrophosphate synthetase - 1 plant and for the identification of substances with effect of herbicide, which inhibit the atividadPhosphoribosyl pyrophosphate synthetase and - 1 in plants, the test system based on expression of a SEQ apperance of DNA, and inhibitor of phosphoribosyl pyrophosphate synthetase -. [P] . BR0108729A . 2003-12-30

机译：具有磷酸核糖焦磷酸正糖合酶活性的参考DNA SEQ和蛋白的用途-1，用于鉴定抑制磷酸核糖焦磷酸合成酶活性的物质的方法-用于鉴定具有抑制作用的除草剂物质植物中的磷酸核糖基焦磷酸合成酶和-1，基于DNA SEQ的表达的测试系统以及磷酸核糖基焦磷酸合成酶-的抑制剂。