首页> 中国专利> 一种具有单碱基分辨率的检测DNA甲基化和单核苷酸变异的测序文库及应用

一种具有单碱基分辨率的检测DNA甲基化和单核苷酸变异的测序文库及应用

页面导航

摘要
著录项
法律信息
相似文献

摘要

本发明提供了一种发夹状的接头以及利用所述发夹状接头同时检测DNA甲基化和单核苷酸变异的方法，属于基因变异检测和表观遗传修饰检测技术领域；所述接头具有如SEQ ID No.1所示的核苷酸序列，所述发夹状接头的5’至3’方向3位和4位上的胞嘧啶是甲基化修饰的胞嘧啶。所述方法包括以下步骤：基因组DNA片段化后进行末端修复加A尾，连接所述的发夹状接头和甲基化测序接头，重亚硫酸盐转化，PCR扩增，收集扩增产物获得测序文库；测序后进行生物信息学分析获得DNA甲基化和单核苷酸变异位点，本方法可以在只测一套数据的情况下同时精确检测DNA甲基化和单核苷酸变异，可以节省50％的成本。

著录项

公开/公告号CN108949945A

专利类型发明专利
公开/公告日2018-12-07

原文格式PDF
申请/专利权人中国科学院动物研究所;
展开▼

申请/专利号CN201810913924.9
发明设计人梁加龙;张坤;腾花景;孙中生;
展开▼

申请日2018-08-10
分类号C12Q1/6876(20180101);C12N15/11(20060101);C40B50/06(20060101);C12Q1/6869(20180101);
代理机构11569 北京高沃律师事务所;
代理人刘奇
地址 100000 北京市朝阳区北辰西路1号院5号
入库时间 2023-06-19 07:32:28

法律信息

法律状态公告日

法律状态信息

法律状态
2019-01-01

实质审查的生效 IPC(主分类):C12Q1/6876 申请日:20180810

实质审查的生效
2018-12-07

公开

公开

相似文献

专利
中文文献
外文文献

1. 一种具有单碱基分辨率的检测DNA甲基化和单核苷酸变异的测序文库及应用 [P] . 中国专利： CN108949945B . 2021.02.26
2. 一种具有单碱基分辨率的检测DNA甲基化和单核苷酸变异的测序文库及应用 [P] . 中国专利： CN108949945A . 2018-12-07
3. Parallel sequencing of nucleic acid segments, useful for detecting single-nucleotide polymorphisms, by single-base extensions with labeled nucleotide [P] . 德国专利： DE10214395A1 . 2003-10-23

机译：通过标记核苷酸的单碱基延伸，可对核酸片段进行平行测序，可用于检测单核苷酸多态性
4. SPECIFIED GENE DETECTING METHOD, AND BASE-MODIFIED NANOPARTICLE AND REAGENT FOR DISCRIMINATING MONOBASIC VARIATION TYPE GENE USED THEREFOR [P] . 日本专利： JP2005227154A . 2005-08-25

机译：一种特定的基因检测方法，以及用其鉴定的单碱基变异型基因的碱基修饰的纳米粒子和试剂
5. Detecting, Sequencing and/or Mapping 5-Hydroxymethylcytosine and 5-Formylcytosine at Single-Base Resolution [P] . 美国专利： US2016194696A1 . 2016-07-07

机译：以单碱基分辨率检测，测序和/或定位5-羟甲基胞嘧啶和5-甲酰基胞嘧啶