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基于新转录本组装的肿瘤特异转录区域提取免疫治疗新抗原的方法和应用

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摘要

本发明公开了基于新转录本组装的肿瘤特异转录区域提取免疫治疗新抗原的方法和应用。该方法包括以下步骤：S01，转录组深度测序数据比对；S02，转录本组装；S03，转录本过滤；S04，预测翻译起始密码子；S05，反义转录本；S06，获取肿瘤特有全长新转录本蛋白序列；S07，获取肿瘤特有部分序列差异新转录本蛋白序列；S08，合并蛋白片段；S09，蛋白片段分割；S10，人类白细胞抗原基因分型；S11，肽段亲和力预测；和任选的，S12，质谱验证。通过本发明的方法发现的肿瘤新抗原，不局限于已注释的编码区，可以发现更多的新抗原；来自于非突变的高表达转录本，在不同肿瘤类型中有一定的通用性；经过质谱实验验证，有更高的概率产生免疫应答。

著录项

  • 公开/公告号CN111627497A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2020-09-04

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 深圳市新合生物医疗科技有限公司;

    申请/专利号CN202010426721.4

  • 发明设计人 万季;刘鹏;夏迪;潘有东;王奕;宋麒;

    申请日2020-05-19

  • 分类号G16B20/30(20190101);G16B30/10(20190101);G16B35/00(20190101);G16B50/00(20190101);

  • 代理机构11399 北京冠和权律师事务所;

  • 代理人陈国军

  • 地址 518055 广东省深圳市南山区桃源街道留仙大道众创产业园B50栋4层

  • 入库时间 2023-06-19 08:09:41

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2023-06-13

    授权

    发明专利权授予

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