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一种融合社区结构和节点度的局部路径相似度的蛋白质链接预测算法

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摘要

本发明公开了一种融合社区结构和节点度的局部路径相似度的蛋白质链接预测算法，该算法的目的是预测蛋白质交互网络中的潜在链接。该方法的步骤主要包括：构建邻接矩阵，检测社区结构，构建训练集和测试集，计算社区紧密度指标，计算基于节点度的局部路径相似度，计算中所有未链接的节点之间的相似度值。现有的链接预测方法大多利用节点的共同邻居信息，而没有考虑到蛋白质社区结构信息对链接预测的贡献。因此，在考虑到基于局部信息相似性的方法和基于社区结构的蛋白质交互预测方法存在的不足，本发明提出了一种融合社区结构和节点度的局部路径相似度的蛋白质链接预测方法，在考虑蛋白质交互网络中的社区信息的同时，结合蛋白质之间的拓扑结构进行链接预测。

著录项

公开/公告号CN111696626A

专利类型发明专利
公开/公告日2020-09-22

原文格式PDF
申请/专利权人长春工业大学;
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申请/专利号CN201911153140.1
发明设计人王贵参;王红梅;李浩;王金哲;王远威;郭真俊;
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申请日2019-11-22
分类号G16B25/10(20190101);
代理机构
代理人
地址 130000 吉林省长春市朝阳区延安大街2055号
入库时间 2023-06-19 08:20:46

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专利
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1. 一种融合社区结构和节点度的局部路径相似度的蛋白质链接预测算法 [P] . 中国专利： CN111696626A . 2020-09-22
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