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一种基于简化基因组测序和SNP次等位基因频率的非杂交后代鉴定方法

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本发明提供了一种基于简化基因组测序和SNP次等位基因频率的非杂交后代鉴定方法，涉及杂交后代鉴定技术领域；所述鉴定方法基于参考基因组，利用SNP次等位基因频率(MAF)数据集，采用遗传关系分析和个体特有的稀有等位变异分析方法，从不同角度反映群体子代间的遗传关系，进而通过箱图直观反映离群个体，确定为非杂交后代，该方法鉴定的非杂交后代与基于双亲纯合显性SNP位点的验证结果一致，因此本发明所述鉴定方法可简单、有效地筛除杂交群体中的非杂交后代，对植物新品种选育及遗传分析、图谱构建、性状定位等研究具有重要意义。

著录项

公开/公告号CN111826429A

专利类型发明专利
公开/公告日2020-10-27

原文格式PDF
申请/专利权人辽宁省果树科学研究所;
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申请/专利号CN202010736451.7
发明设计人刘有春;袁兴福;刘成;王升;张舵;魏鑫;刘修丽;孙斌;王宏光;杨玉春;高树清;
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申请日2020-07-28
分类号C12Q1/6869(20180101);C12Q1/6895(20180101);G16B20/20(20190101);G16B30/10(20190101);
代理机构11569 北京高沃律师事务所;
代理人董大媛
地址 115000 辽宁省营口市鲅鱼圈区铁东街
入库时间 2023-06-19 08:41:05

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法律状态
2022-06-17

授权

发明专利权授予

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1. 一种基于简化基因组测序和SNP次等位基因频率的非杂交后代鉴定方法 [P] . 中国专利： CN111826429A . 2020-10-27
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3. Nucleotide sequences of the mutant and non-mutant fragments of loci A and C of alleles of double low (00) fad3 form desaturase gene and low-linolenic mutant (LLMut) of oilseed rape plants (Brassica napus L. var. Oleifera), allospecific SNP markers specific for loci A and C of fad3 form desaturase gene - double low (00) and low-linolenic mutant (LLMut) of winter oilseed rape plants, nucleotide sequences of primer pairs for the amplification of loci A and C of fad3 form desaturase gene of winter oilseed rape plants, method for amplification of loci A and C of fad3 desaturase gene of winter oilseed rape plants, nucleotide sequences of the primers for the identification of mutant and non-mutant alleles of fad3 forms desaturase gene - double low (00) and low-linolenic mutant (LLMut) of oilseed rape in locus A and locus C in the microsequencing reaction, method for the identification of mutant and non-mutant alleles of fad3 form desaturase gene - double low (00) and low-linolenic mutant (LLM [P] . PL211126B1 . 2012-04-30

机译：双低（00）fad3等位基因的等位基因双低等位基因（A）的位点A和C的突变和非突变片段的核苷酸序列形成去饱和酶基因和油菜植物（甘蓝型油菜）的低亚麻酸突变体（LLMut），是同种异体对fad3基因座A和C特异的SNP标记形成去饱和酶基因-冬季油菜植物的双低（00）和低亚麻酸突变体（LLMut），用于扩增fad3基因去饱和酶A和C的引物对的核苷酸序列冬季油菜植物基因，fad3去饱和酶基因的基因座A和C的扩增方法，用于鉴定fad3形式脱氢酶基因的突变和非突变等位基因的引物的核苷酸序列-双低（00 ）和基因座A和基因座C中油菜的低亚麻酸突变体（LLMut）的微测序反应，fad3形式脱氢酶基因突变和非突变等位基因的鉴定方法-双低（00）和低亚麻酸突变体（法学硕士
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